seq1 = pF1KE1569.tfa, 261 bp
seq2 = pF1KE1569/gi568815597f_161115322.tfa (gi568815597f:161115322_161318940), 203619 bp

>pF1KE1569 261
>gi568815597f:161115322_161318940 (Chr1)

1-49  (100001-100049)   100% ->
50-144  (102665-102759)   100% ->
145-180  (102920-102955)   100% ->
181-201  (103382-103402)   100% ->
202-261  (103560-103619)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTCCAGCAGTGGTCTTGCTCTTACTCCTTTTGGTTGAACAAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100001 ATGATTCCAGCAGTGGTCTTGCTCTTACTCCTTTTGGTTGAACAAGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50         CGGCCCTGGGAGAGCCTCAGCTCTGCTATATCCTGGATGCCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TA...CAGCGGCCCTGGGAGAGCCTCAGCTCTGCTATATCCTGGATGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCTGTTTCTGTATGGAATTGTCCTCACCCTCCTCTACTGTCGACTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102707 TCCTGTTTCTGTATGGAATTGTCCTCACCCTCCTCTACTGTCGACTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTA         ATCCAAGTGCGAAAGGCAGCTATAACCAGCTATGAG  
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102757 GTAGCG...CAGATCCAAGTGCGAAAGGCAGCTATAACCAGCTATGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181        AAATCAGATGGTGTTTACACG         GGCCTGAGCACCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102958 A...CAGAAATCAGATGGTGTTTACACGGTA...CAGGGCCTGAGCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    215 GGAACCAGGAGACTTACGAGACTCTGAAGCATGAGAAACCACCACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103573 GGAACCAGGAGACTTACGAGACTCTGAAGCATGAGAAACCACCACAG