seq1 = pF1KE1554.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KE1554/gi568815586r_10059883.tfa (gi568815586r:10059883_10272077), 212195 bp

>pF1KE1554 819
>gi568815586r:10059883_10272077 (Chr12)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-178  (102903-103004)   100% ->
179-424  (105121-105366)   100% ->
425-564  (111153-111292)   100% ->
565-680  (111616-111731)   100% ->
681-819  (112057-112195)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTTTGATGACCTAAAGATCCAGACTGTGAAGGACCAGCCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTTTGATGACCTAAAGATCCAGACTGTGAAGGACCAGCCTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGTCAAATGGAAAAAAAGCTAAAG         GTCTTCAGTTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GAAGTCAAATGGAAAAAAAGCTAAAGGTA...TAGGTCTTCAGTTTCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTCTCCATGGTGGTGCCTGGCTGCTGCGACTCTAGGGGTCCTTTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102918 ACTCTCCATGGTGGTGCCTGGCTGCTGCGACTCTAGGGGTCCTTTGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGATTAGTAGTGACCATTATGGTGCTGGGCATGCAAT         TATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102968 GGATTAGTAGTGACCATTATGGTGCTGGGCATGCAATGTA...CAGTATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAGGTGTCTGACCTCCTAACACAAGAGCAAGCAAACCTAACTCACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105125 CCAGGTGTCTGACCTCCTAACACAAGAGCAAGCAAACCTAACTCACCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGAAACTGGAGGGACAGATCTCAGCCCGGCAACAAGCAGAAGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105175 AAAAGAAACTGGAGGGACAGATCTCAGCCCGGCAACAAGCAGAAGAAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCACAGGAGTCAGAAAACGAACTCAAGGAAATGATAGAAACCCTTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105225 TCACAGGAGTCAGAAAACGAACTCAAGGAAATGATAGAAACCCTTGCTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGCTGAATGAGAAATCCAAAGAGCAAATGGAACTTCACCACCAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105275 GAAGCTGAATGAGAAATCCAAAGAGCAAATGGAACTTCACCACCAGAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAATCTCCAAGAAACACTGAAGAGAGTAGCAAATTGTTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105325 TGAATCTCCAAGAAACACTGAAGAGAGTAGCAAATTGTTCAGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  CTCCTTGTCCGCAAGACTGGATCTGGCATGGAGAAAACTGTTACCTATT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111152 GCTCCTTGTCCGCAAGACTGGATCTGGCATGGAGAAAACTGTTACCTATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTCCTCGGGCTCATTTAACTGGGAAAAGAGCCAAGAGAAGTGCTTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111202 TTCCTCGGGCTCATTTAACTGGGAAAAGAGCCAAGAGAAGTGCTTGTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGATGCCAAGTTGCTGAAAATTAATAGCACAGCTGATCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111252 TGGATGCCAAGTTGCTGAAAATTAATAGCACAGCTGATCTGGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACTTCATCCAGCAAGCAATTTCCTATTCCAGTTTTCCATTCTGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111616 GACTTCATCCAGCAAGCAATTTCCTATTCCAGTTTTCCATTCTGGATGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGTCTCGGAGGAACCCCAGCTACCCATGGCTCTGGGAGGACGGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111666 GCTGTCTCGGAGGAACCCCAGCTACCCATGGCTCTGGGAGGACGGTTCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTTTGATGCCCCACTT         ATTTAGAGTCCGAGGCGCTGTCTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 111716 CTTTGATGCCCCACTTGTA...CAGATTTAGAGTCCGAGGCGCTGTCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAGACATACCCTTCAGGTACCTGTGCATATATACAACGAGGAGCTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112082 CAGACATACCCTTCAGGTACCTGTGCATATATACAACGAGGAGCTGTTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGCGGAAAACTGCATTTTAGCTGCCTTCAGTATATGTCAGAAGAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112132 TGCGGAAAACTGCATTTTAGCTGCCTTCAGTATATGTCAGAAGAAGGCAA

    850     .    :
    806 ACCTAAGAGCACAG
        ||||||||||||||
 112182 ACCTAAGAGCACAG