seq1 = pF1KE1549.tfa, 1527 bp
seq2 = pF1KE1549/gi568815591r_92013668.tfa (gi568815591r:92013668_92234364), 220697 bp

>pF1KE1549 1527
>gi568815591r:92013668_92234364 (Chr7)

(complement)

1-192  (100001-100192)   100% ->
193-291  (102493-102591)   100% ->
292-468  (105309-105485)   100% ->
469-595  (106734-106860)   100% ->
596-770  (107938-108112)   100% ->
771-890  (110512-110631)   100% ->
891-1086  (111050-111245)   100% ->
1087-1182  (115750-115845)   98% ->
1183-1351  (117153-117321)   100% ->
1352-1527  (120522-120697)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCGGCTGGGATGCTGCTGCTGGGCTTGCTGCAGGCGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCGGCTGGGATGCTGCTGCTGGGCTTGCTGCAGGCGGGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCGGTGCTGGGCCAGGCGATGGAGAAGGTGACAGGCGGCAACCTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCGGTGCTGGGCCAGGCGATGGAGAAGGTGACAGGCGGCAACCTCTTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATGCTGCTGATCGCCTGCGCCTTCACCCTCAGCCTGGTCTACCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATGCTGCTGATCGCCTGCGCCTTCACCCTCAGCCTGGTCTACCTGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTCTGGCCGCCGGCCACCTGGTCCAGCTGCCCGCAGGGGTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100151 CGTCTGGCCGCCGGCCACCTGGTCCAGCTGCCCGCAGGGGTGGTA...TA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    193  AAAAGTCCTCCATACATTTTCTCCCCAATTCCATTCCTTGGGCATGCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 GAAAAGTCCTCCATACATTTTCTCCCCAATTCCATTCCTTGGGCATGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAGCATTTGGGAAAAGTCCAATTGAATTTCTAGAAAATGCATATGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102542 TAGCATTTGGGAAAAGTCCAATTGAATTTCTAGAAAATGCATATGAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          TATGGACCTGTATTTAGTTTTACCATGGTAGGCAAGACATT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 GTA...TAGTATGGACCTGTATTTAGTTTTACCATGGTAGGCAAGACATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TACTTACCTTCTGGGGAGTGATGCTGCTGCACTGCTTTTTAATAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105350 TACTTACCTTCTGGGGAGTGATGCTGCTGCACTGCTTTTTAATAGTAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAAGACCTGAATGCAGAAGATGTCTACAGTCGCCTGACAACACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105400 ATGAAGACCTGAATGCAGAAGATGTCTACAGTCGCCTGACAACACCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGGGAAGGGAGTTGCATACGATGTGCCTAATCCA         GTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105450 TTTGGGAAGGGAGTTGCATACGATGTGCCTAATCCAGTA...AAGGTTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTGGAGCAGAAGAAAATGTTAAAAAGTGGCCTTAACATAGCCCACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106739 CTTGGAGCAGAAGAAAATGTTAAAAAGTGGCCTTAACATAGCCCACTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AACAGCATGTTTCTATAATTGAAAAAGAAACAAAGGAATACTTTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106789 AACAGCATGTTTCTATAATTGAAAAAGAAACAAAGGAATACTTTGAGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGGGAGAAAGTGGAGAAAAAA         ATGTGTTTGAAGCTCTTTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106839 TGGGGAGAAAGTGGAGAAAAAAGTA...TAGATGTGTTTGAAGCTCTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGAGCTCATAATTTTAACAGCTAGCCATTGTTTGCATGGAAAGGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107957 TGAGCTCATAATTTTAACAGCTAGCCATTGTTTGCATGGAAAGGAAATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GAAGTCAACTCAATGAAAAGGTAGCACAGCTGTATGCAGATTTGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108007 GAAGTCAACTCAATGAAAAGGTAGCACAGCTGTATGCAGATTTGGATGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGTTTCAGCCATGCAGCCTGGCTCTTACCAGGTTGGCTGCCTTTGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108057 GGTTTCAGCCATGCAGCCTGGCTCTTACCAGGTTGGCTGCCTTTGCCTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTTCAG         ACGCAGGGACAGAGCTCATCGGGAAATCAAGGATA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108107 TTTCAGGTA...CAGACGCAGGGACAGAGCTCATCGGGAAATCAAGGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTTTCTATAAGGCAATCCAGAAACGCAGACAGTCTCAAGAAAAAATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110547 TTTTCTATAAGGCAATCCAGAAACGCAGACAGTCTCAAGAAAAAATTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACATTCTCCAAACTTTACTAGATGCTACATACAA         GGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110597 GACATTCTCCAAACTTTACTAGATGCTACATACAAGTA...TAGGGATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCGTCCTTTGACTGATGATGAAGTAGCAGGGATGCTTATTGGATTACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111056 GCGTCCTTTGACTGATGATGAAGTAGCAGGGATGCTTATTGGATTACTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGGCAGGGCAGCATACATCCTCAACTACTAGTGCTTGGATGGGCTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111106 TGGCAGGGCAGCATACATCCTCAACTACTAGTGCTTGGATGGGCTTCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTGGCCAGAGACAAAACACTTCAAAAAAAATGTTATTTAGAACAGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111156 TTGGCCAGAGACAAAACACTTCAAAAAAAATGTTATTTAGAACAGAAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGTCTGTGGAGAGAATCTGCCTCCTTTAACTTATGACCAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111206 AGTCTGTGGAGAGAATCTGCCTCCTTTAACTTATGACCAGGTT...TAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCAAGGATCTAAATTTACTTGATCGCTGTATAAAAGAAACATTAAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115751 TCAAGGATCTAAATTTACTTGATCGCTGTATAAAAGAAACATTAAGACTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGACCTCCTGTAATGATCATGATGAGAATGGCCAGAACTCCTCAG     
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 115801 AGACCTCCTATAATGATCATGATGAGAATGGCCAGAACTCCTCAGGTG..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183     ACTGTGGCAGGGTATACCATTCCTCCAGGACATCAGGTGTGTGTTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115851 .TAGACTGTGGCAGGGTATACCATTCCTCCAGGACATCAGGTGTGTGTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTCCCACTGTCAATCAAAGACTTAAAGACTCATGGGTAGAACGCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117199 CTCCCACTGTCAATCAAAGACTTAAAGACTCATGGGTAGAACGCCTGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTTAATCCTGATCGCTACTTACAGGATAACCCAGCATCAGGGGAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117249 TTTAATCCTGATCGCTACTTACAGGATAACCCAGCATCAGGGGAAAAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGCCTATGTGCCATTTGGAGCTG         GGCGTCATCGTTGTATTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 117299 TGCCTATGTGCCATTTGGAGCTGGTA...TAGGGCGTCATCGTTGTATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GGGAAAATTTTGCCTATGTTCAAATTAAGACAATTTGGTCCACTATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120540 GGGAAAATTTTGCCTATGTTCAAATTAAGACAATTTGGTCCACTATGCTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CGTTTATATGAATTTGATCTCATTGATGGATACTTTCCCACTGTGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120590 CGTTTATATGAATTTGATCTCATTGATGGATACTTTCCCACTGTGAATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TACAACTATGATTCACACCCCTGAAAACCCAGTTATCCGTTACAAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120640 TACAACTATGATTCACACCCCTGAAAACCCAGTTATCCGTTACAAACGAA

   1600     .
   1520 GATCAAAA
        ||||||||
 120690 GATCAAAA