seq1 = pF1KE1526.tfa, 1086 bp
seq2 = pF1KE1526/gi568815579r_55162611.tfa (gi568815579r:55162611_55379608), 216998 bp

>pF1KE1526 1086
>gi568815579r:55162611_55379608 (Chr19)

(complement)

1-219  (100001-100210)   95% ->
220-424  (101763-101967)   100% ->
425-649  (104987-105211)   100% ->
650-805  (113323-113478)   100% ->
806-902  (113627-113723)   100% ->
903-1014  (114220-114331)   100% ->
1015-1086  (116927-116998)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGACGAAGGCTCAAGGGGGAGCCGCCTGCCCCTGGCGCTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGACGAAGGCTCAAGGGGGAGCCGCCTGCCCCTGGCGCTGCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTCCCAGGGTTGCTCTTCAGGGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||-------|-||-||||||||||||||||
 100051 GGCCTCCCAGGGTTGCTCTTCA       G GG GGCGGCGGCGGCGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCGGCTGGGGGCTCGGGCAATTCCCGGCCCCCACGCAACCTCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100092 CCTCGGCTGGGGGCTCGGGCAATTCCCGGCCCCCACGCAACCTCCAAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGCTGCAGATGGCCATCACCGCGGGCTCTGAAGAGCCAGACCCTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100142 TTGCTGCAGATGGCCATCACCGCGGGCTCTGAAGAGCCAGACCCTCCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAACCGATGAGTGAGGAG         AGGCGTCAGTGGCTGCAGGAGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100192 AGAACCGATGAGTGAGGAGGTA...CAGAGGCGTCAGTGGCTGCAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCATGTCGGCTGCCTTCCGAGGCCAGCGGGAGGAGGTGGAGCAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101785 CCATGTCGGCTGCCTTCCGAGGCCAGCGGGAGGAGGTGGAGCAGATGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCTGCCTCCGAGTGCTGTCACAGCCCATGCCCCCCACTGCTGGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101835 AGCTGCCTCCGAGTGCTGTCACAGCCCATGCCCCCCACTGCTGGGGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGAGCAGGCGGCCGACCAGCAAGAGCGAGAGGGGGCCCTGGAGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101885 CGAGCAGGCGGCCGACCAGCAAGAGCGAGAGGGGGCCCTGGAGCTGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGACCTGTGTGAGAACATGGACAATGCCGCAG         ACTTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101935 CCGACCTGTGTGAGAACATGGACAATGCCGCAGGTA...CAGACTTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCTGTCTGGCATGCACCTGCTGGTGGGCCGGTACCTGGAGGCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104995 CAGCTGTCTGGCATGCACCTGCTGGTGGGCCGGTACCTGGAGGCGGGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCGGGACTGCGGTGGCGGGCGGCACAGCTCATCGGCACGTGCAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105045 TGCGGGACTGCGGTGGCGGGCGGCACAGCTCATCGGCACGTGCAGTCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACGTGGCAGCCATCCAGGAGCAGGTGCTGGGCCTGGGTGCCCTGCGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105095 ACGTGGCAGCCATCCAGGAGCAGGTGCTGGGCCTGGGTGCCCTGCGTAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGCTGCGGCTGCTGGACCGCGACGCCTGCGACACGGTGCGCGTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105145 CTGCTGCGGCTGCTGGACCGCGACGCCTGCGACACGGTGCGCGTCAAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTCTTCGCCATCTCCT         GTCTGGTCCGAGAGCAGGAGGCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105195 CCTCTTCGCCATCTCCTGTG...CAGGTCTGGTCCGAGAGCAGGAGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGCTGCTGCAGTTCCTCCGCCTGGACGGCTTCTCTGTGTTGATGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113347 GGCTGCTGCAGTTCCTCCGCCTGGACGGCTTCTCTGTGTTGATGAGGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ATGCAGCAGCAGGTGCAGAAGCTCAAGGTCAAATCAGCATTCCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113397 ATGCAGCAGCAGGTGCAGAAGCTCAAGGTCAAATCAGCATTCCTGCTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAACCTGCTGGTGGGCCACCCTGAACACAAAG         GGACCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 113447 GAACCTGCTGGTGGGCCACCCTGAACACAAAGGTG...CAGGGACCCTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCTCCATGGGGATGGTCCAGCAGCTGGTGGCCCTGGTGCGGACAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113636 GCTCCATGGGGATGGTCCAGCAGCTGGTGGCCCTGGTGCGGACAGAGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCCCCTTCCACGAGCACGTGCTTGGAGCCCTGTGCAG         CCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113686 AGCCCCTTCCACGAGCACGTGCTTGGAGCCCTGTGCAGGTA...CAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGTGACAGACTTTCCGCAGGGTGTGCGCGAGTGTCGGGAGCCGGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114223 GGTGACAGACTTTCCGCAGGGTGTGCGCGAGTGTCGGGAGCCGGAACTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCCTGGAGGAGCTCCTCCGCCACCGCTGTCAGCTGCTGCAGCAGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114273 GCCTGGAGGAGCTCCTCCGCCACCGCTGTCAGCTGCTGCAGCAGCATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGTACCAG         GAGGAGCTGGAGTTCTGTGAAAAGCTGCTACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 114323 GAGTACCAGGTA...CAGGAGGAGCTGGAGTTCTGTGAAAAGCTGCTACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GACCTGTTTCTCCAGCCCAGCGGACGACAGCATGGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116959 GACCTGTTTCTCCAGCCCAGCGGACGACAGCATGGATCGG