seq1 = pF1KE1510.tfa, 2145 bp
seq2 = pF1KE1510/gi568815591f_12470787.tfa (gi568815591f:12470787_12752712), 281926 bp

>pF1KE1510 2145
>gi568815591f:12470787_12752712 (Chr7)

1-199  (100001-100199)   99% ->
200-354  (107278-107432)   100% ->
355-516  (110274-110435)   100% ->
517-666  (133728-133877)   100% ->
667-759  (152015-152107)   100% ->
760-892  (154224-154356)   100% ->
893-981  (154976-155064)   100% ->
982-1197  (155798-156013)   100% ->
1198-1319  (158315-158436)   100% ->
1320-1410  (165259-165349)   100% ->
1411-1581  (169561-169731)   100% ->
1582-1759  (173352-173529)   100% ->
1760-1881  (173798-173919)   100% ->
1882-1959  (178681-178758)   100% ->
1960-2020  (181055-181115)   100% ->
2021-2145  (181802-181926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCGGGAGCTATACCACGAAGAGTTCGCCCGGGCGGGCAAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCGGGAGCTATACCACGAAGAGTTCGCCCGGGCGGGCAAGCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCTGCAGGTCTGGAGGATTGAGAAGCTGGAGCTGGTGCCCGTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGCTGCAGGTCTGGAGGATTGAGAAGCTGGAGCTGGTGCCCGTGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAGCGCTCACGGCGACTTCTACGTCGGGGATGCCTACCTGGTGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAGCGCTCACGGCGACTTCTACGTCGGGGATGCCTACCTGGTGCTGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGGCCAAGACGAGCCGAGGCTTCACCTACCGCCTGCACTTCTGGCTCG 
        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||>
 100151 ACGGCCAAGACGAGCCGAGGCTTCACCTACCACCTGCACTTCTGGCTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    200         GAAAGGAGTGTTCCCAGGATGAAAGCACAGCTGCTGCCATCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TA...TAGGAAAGGAGTGTTCCCAGGATGAAAGCACAGCTGCTGCCATCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACTGTTCAGATGGATGACTATTTGGGTGGCAAGCCAGTGCAGAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107320 TCACTGTTCAGATGGATGACTATTTGGGTGGCAAGCCAGTGCAGAATAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAACTTCAAGGATATGAGTCTAATGACTTTGTTAGCTATTTCAAAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107370 GAACTTCAAGGATATGAGTCTAATGACTTTGTTAGCTATTTCAAAGGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCTGAAATACAAG         GCTGGAGGCGTGGCATCTGGATTAAATC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107420 TCTGAAATACAAGGTA...CAGGCTGGAGGCGTGGCATCTGGATTAAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGTTCTTACGAACGACCTGACAGCCAAGAGGCTCCTACATGTGAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110302 ATGTTCTTACGAACGACCTGACAGCCAAGAGGCTCCTACATGTGAAGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGTAGAGTGGTGAGAGCCACAGAAGTTCCCCTTAGCTGGGACAGTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110352 CGTAGAGTGGTGAGAGCCACAGAAGTTCCCCTTAGCTGGGACAGTTTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGGGTGACTGCTTCATCATTGACCTTGGCACC         GAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110402 CAAGGGTGACTGCTTCATCATTGACCTTGGCACCGTA...TAGGAAATTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCAGTGGTGTGGTTCCTCGTGCAACAAATATGAACGTCTGAAGGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133735 ATCAGTGGTGTGGTTCCTCGTGCAACAAATATGAACGTCTGAAGGCAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGGTAGCTACTGGCATTCGGTACAATGAAAGGAAAGGAAGGTCTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133785 CAGGTAGCTACTGGCATTCGGTACAATGAAAGGAAAGGAAGGTCTGAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AATTGTCGTGGAAGAAGGAAGTGAACCCTCAGAACTTATAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 133835 AATTGTCGTGGAAGAAGGAAGTGAACCCTCAGAACTTATAAAGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    667   GTCTTAGGGGAAAAGCCAGAGCTTCCAGATGGAGGTGATGATGATGAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152013 AGGTCTTAGGGGAAAAGCCAGAGCTTCCAGATGGAGGTGATGATGATGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATTATAGCAGACATAAGTAACAGGAAAATGGCTAAACTATACATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 152063 ATTATAGCAGACATAAGTAACAGGAAAATGGCTAAACTATACATGGTG..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    760     GTTTCAGATGCAAGTGGCTCCATGAGAGTGACTGTGGTGGCAGAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152113 .TAGGTTTCAGATGCAAGTGGCTCCATGAGAGTGACTGTGGTGGCAGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAAACCCCTTCTCAATGGCAATGCTGCTGTCTGAAGAATGCTTTATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154270 AAAACCCCTTCTCAATGGCAATGCTGCTGTCTGAAGAATGCTTTATTTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACCACGGGGCTGCCAAACAAATTTTCGTATGGAAAG         GTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 154320 GACCACGGGGCTGCCAAACAAATTTTCGTATGGAAAGGTA...TAGGTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGATGCTAATCCCCAAGAGAGGAAGGCTGCAATGAAGACAGCTGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154980 AGATGCTAATCCCCAAGAGAGGAAGGCTGCAATGAAGACAGCTGAAGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTCTACAGCAAATGAATTATTCCAAGAATACCCAA         ATTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 155030 TTCTACAGCAAATGAATTATTCCAAGAATACCCAAGTA...CAGATTCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTTCTTCCAGAAGGAGGTGAAACACCAATCTTCAAACAGTTTTTTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155804 GTTCTTCCAGAAGGAGGTGAAACACCAATCTTCAAACAGTTTTTTAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTGGAGAGATAAAGATCAGAGTGATGGCTTCGGGAAAGTTTATGTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155854 CTGGAGAGATAAAGATCAGAGTGATGGCTTCGGGAAAGTTTATGTCACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGAAAGTGGCTCAAATAAAACAAATTCCCTTTGATGCCTCAAAATTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155904 AGAAAGTGGCTCAAATAAAACAAATTCCCTTTGATGCCTCAAAATTACAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGTTCTCCGCAGATGGCAGCCCAGCACAATATGGTGGATGATGGTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155954 AGTTCTCCGCAGATGGCAGCCCAGCACAATATGGTGGATGATGGTTCTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CAAAGTGGAG         ATTTGGCGTGTAGAAAACAATGGTAGGATCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 156004 CAAAGTGGAGGTA...CAGATTTGGCGTGTAGAAAACAATGGTAGGATCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AAGTTGACCAAAACTCATATGGTGAATTCTATGGTGGTGACTGCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158346 AAGTTGACCAAAACTCATATGGTGAATTCTATGGTGGTGACTGCTACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATACTCTACACCTATCCCAGAGGACAGATTATCTACACGTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 158396 ATACTCTACACCTATCCCAGAGGACAGATTATCTACACGTGGTG...TAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCAAGGAGCAAATGCCACACGAGATGAGCTGACAACATCTGCGTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165259 GCAAGGAGCAAATGCCACACGAGATGAGCTGACAACATCTGCGTTCCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGTTCAGTTGGATCGGTCCCTTGGAGGACAGGCTGTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 165309 CTGTTCAGTTGGATCGGTCCCTTGGAGGACAGGCTGTGCAGGTT...CAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ATCCGAGTCTCCCAAGGCAAAGAGCCTGTTCACCTACTGAGTTTGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169561 ATCCGAGTCTCCCAAGGCAAAGAGCCTGTTCACCTACTGAGTTTGTTCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGACAAACCGCTCATTATTTACAAGAATGGAACATCAAAGAAAGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169611 AGACAAACCGCTCATTATTTACAAGAATGGAACATCAAAGAAAGGAGGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGCACCTGCTCCCCCTACACGCCTCTTTCAAGTCCGGAGAAACCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169661 AGGCACCTGCTCCCCCTACACGCCTCTTTCAAGTCCGGAGAAACCTGGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TCTATCACCAGAATTGTGGAG         GTTGATGTTGATGCAAATTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 169711 TCTATCACCAGAATTGTGGAGGTA...CAGGTTGATGTTGATGCAAATTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACTGAATTCTAACGATGTTTTTGTCCTGAAACTGCCACAAAATAGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173372 ACTGAATTCTAACGATGTTTTTGTCCTGAAACTGCCACAAAATAGTGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACATCTGGGTAGGAAAAGGTGCTAGCCAGGAGGAGGAGAAAGGAGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173422 ACATCTGGGTAGGAAAAGGTGCTAGCCAGGAGGAGGAGAAAGGAGCAGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TATGTAGCAAGTGTCCTAAAGTGCAAAACCTTAAGGATCCAAGAAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173472 TATGTAGCAAGTGTCCTAAAGTGCAAAACCTTAAGGATCCAAGAAGGCGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 GGAGCCAG         AGGAGTTCTGGAATTCCCTTGGAGGGAAAAAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 173522 GGAGCCAGGTG...CAGAGGAGTTCTGGAATTCCCTTGGAGGGAAAAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACTACCAGACCTCACCACTACTGGAAACCCAGGCTGAAGACCATCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173831 ACTACCAGACCTCACCACTACTGGAAACCCAGGCTGAAGACCATCCACCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CGGCTTTACGGCTGCTCTAACAAAACTGGAAGATTTGTT         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 173881 CGGCTTTACGGCTGCTCTAACAAAACTGGAAGATTTGTTGTA...CAGAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGAAGAGATTCCAGGAGAGTTCACCCAGGATGATTTAGCTGAAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178683 TGAAGAGATTCCAGGAGAGTTCACCCAGGATGATTTAGCTGAAGATGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 TCATGTTACTAGATGCTTGGGAACAG         ATATTTATTTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 178733 TCATGTTACTAGATGCTTGGGAACAGGTA...CAGATATTTATTTGGATT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GGCAAAGATGCTAATGAAGTTGAGAAAAAAGAATCTCTGAAGTCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 181070 GGCAAAGATGCTAATGAAGTTGAGAAAAAAGAATCTCTGAAGTCTGGTA.

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021      CCAAAATGTACCTTGAGACAGACCCTTCTGGAAGAGACAAGAGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181120 ..TAGCCAAAATGTACCTTGAGACAGACCCTTCTGGAAGAGACAAGAGGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CACCAATTGTCATCATAAAACAGGGCCATGAGCCACCCACATTCACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181847 CACCAATTGTCATCATAAAACAGGGCCATGAGCCACCCACATTCACAGGC

   2250     .    :    .    :    .    :
   2116 TGGTTCCTGGGCTGGGATTCCAGCAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 181897 TGGTTCCTGGGCTGGGATTCCAGCAAGTGG