seq1 = pF1KE1469.tfa, 279 bp
seq2 = pF1KE1469/gi568815582f_57258817.tfa (gi568815582f:57258817_57463585), 204769 bp

>pF1KE1469 279
>gi568815582f:57258817_57463585 (Chr16)

1-73  (100001-100073)   98% ->
74-197  (101621-101744)   100% ->
198-279  (104688-104769)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGCCTACAGACTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTGCTGT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCGCCTACAGACTGCACTCCTGGTTGTCCTCGTCCTCCTTGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCTTCAAGCAACTGAGGCAG         GCCCCTACGGCGCCAACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 GGCGCTTCAAGCAACTGAGGCAGGTG...TAGGCCCCTACGGCGCCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAAGACAGCGTCTGCTGCCGTGATTACGTCCGTTACCGTCTGCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101639 TGGAAGACAGCGTCTGCTGCCGTGATTACGTCCGTTACCGTCTGCCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCGTGGTGAAACACTTCTACTGGACCTCAGACTCCTGCCCGAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101689 CGCGTGGTGAAACACTTCTACTGGACCTCAGACTCCTGCCCGAGGCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGGT         GTTGCTAACCTTCAGGGATAAGGAGATCTGTGCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101739 CGTGGTGTG...CAGGTTGCTAACCTTCAGGGATAAGGAGATCTGTGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    233 ATCCCAGAGTGCCCTGGGTGAAGATGATTCTCAATAAGCTGAGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104723 ATCCCAGAGTGCCCTGGGTGAAGATGATTCTCAATAAGCTGAGCCAA