seq1 = pF1KE1468.tfa, 2841 bp
seq2 = pF1KE1468/gi568815581r_45164720.tfa (gi568815581r:45164720_45390745), 226026 bp

>pF1KE1468 2841
>gi568815581r:45164720_45390745 (Chr17)

(complement)

1-256  (100001-100256)   100% ->
257-326  (101441-101510)   100% ->
327-537  (103382-103592)   100% ->
538-1152  (103701-104315)   100% ->
1153-1290  (105797-105934)   100% ->
1291-1420  (116153-116282)   100% ->
1421-1552  (116492-116623)   100% ->
1553-1657  (117139-117243)   100% ->
1658-1821  (119525-119688)   100% ->
1822-1972  (120183-120333)   100% ->
1973-2326  (122987-123340)   100% ->
2327-2433  (123548-123654)   100% ->
2434-2578  (124065-124209)   100% ->
2579-2679  (125483-125583)   100% ->
2680-2841  (125946-126107)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTGATGGAAATGGCCTGCCCAGGTGCCCCTGGCTCAGCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTGATGGAAATGGCCTGCCCAGGTGCCCCTGGCTCAGCAGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCAGAAGGAACTCCCCAAAGCCAAGGAGAAGACGCCGCCACTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCAGAAGGAACTCCCCAAAGCCAAGGAGAAGACGCCGCCACTGGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAACAGAGCTCCGTCTACAAGCTTGAGGCCGTGGAGAAGAGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAACAGAGCTCCGTCTACAAGCTTGAGGCCGTGGAGAAGAGCCCTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCTGCGGAAAGTGGGAGATCCTGAATGACGTGATTACCAAGGGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCTGCGGAAAGTGGGAGATCCTGAATGACGTGATTACCAAGGGCACAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGGAAGGCTCCGAGGCAGGGCCAGCTGCCATCTCTATCATCGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGGAAGGCTCCGAGGCAGGGCCAGCTGCCATCTCTATCATCGCCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAGT         GTGAGAATAGCCAAGAGTTCAGCCCCACCTTTTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAGTGTA...TAGGTGAGAATAGCCAAGAGTTCAGCCCCACCTTTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAACGCATTTTCATCGCTGGGTCCAAACAGTACAG         CCAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101476 GAACGCATTTTCATCGCTGGGTCCAAACAGTACAGGTA...CAGCCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAGAGTCTTGATCAGATCCCCAACAATGTGGCCCATGCTACAGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103388 CGAGAGTCTTGATCAGATCCCCAACAATGTGGCCCATGCTACAGAGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAATGGCCCGTGTGTGTTGGAAGGGAAAGCGTCGCAGCAAAGCCCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103438 AAATGGCCCGTGTGTGTTGGAAGGGAAAGCGTCGCAGCAAAGCCCGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACGGAAGAAGAAGAGCTCAAAGTCCCTGGCTCATGCAGGAGTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103488 AAACGGAAGAAGAAGAGCTCAAAGTCCCTGGCTCATGCAGGAGTGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCCAAACCCCTCCCCAGGACCCCTGAGCAGGAGAGCTGCACCATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103538 GGCCAAACCCCTCCCCAGGACCCCTGAGCAGGAGAGCTGCACCATCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCAG         GAGGATGAGTCTCCACTCGGCGCCCCATATGTTAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103588 TGCAGGTG...CAGGAGGATGAGTCTCCACTCGGCGCCCCATATGTTAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACACCCCGCAGTTCACCAAGCCTCTGAAGGAACCAGGCCTTGGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103737 AACACCCCGCAGTTCACCAAGCCTCTGAAGGAACCAGGCCTTGGGCAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGTTTTAAGCAGCTTGGCGAGGGCCTACGGCCGGCTCTGCCTCGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103787 CTGTTTTAAGCAGCTTGGCGAGGGCCTACGGCCGGCTCTGCCTCGATCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AACTCCACAAACTGATCAGCCCCTTGCAATGTCTGAACCACGTGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103837 AACTCCACAAACTGATCAGCCCCTTGCAATGTCTGAACCACGTGTGGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCACCACCCCCAGGACGGAGGCCCCCTGCCCCTGCCCACGCACCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103887 CTGCACCACCCCCAGGACGGAGGCCCCCTGCCCCTGCCCACGCACCCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCCTATAGCAGACTGCCTCATCCCTTCCCATTCCACCCTCTCCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103937 CCCCTATAGCAGACTGCCTCATCCCTTCCCATTCCACCCTCTCCAGCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGAAACCTCACCCTCTGGAGTCCTTCCTGGGCAAACTGGCCTGTGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103987 GGAAACCTCACCCTCTGGAGTCCTTCCTGGGCAAACTGGCCTGTGTAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AGCCAGAAACCCTTGCCTGACCCACACCTGAGCAAACTGGCCTGTGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104037 AGCCAGAAACCCTTGCCTGACCCACACCTGAGCAAACTGGCCTGTGTAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CAGTCCAAAGCCCCTGCCTGGCCCACACCTGGAGCCCAGCTGCCTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104087 CAGTCCAAAGCCCCTGCCTGGCCCACACCTGGAGCCCAGCTGCCTGTCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GTGGTGCCCATGAGAAGTTTTCTGTGGAGGAATACCTAGTGCATGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104137 GTGGTGCCCATGAGAAGTTTTCTGTGGAGGAATACCTAGTGCATGCTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CAAGGCAGCGTGAGCTCAGGCCAGGCCCACAGCCTGACCAGCCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104187 CAAGGCAGCGTGAGCTCAGGCCAGGCCCACAGCCTGACCAGCCTGGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GACCTGGGCAGCAAGGGGCTCCAGATCCCGGGAGCCCAGCCCCAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104237 GACCTGGGCAGCAAGGGGCTCCAGATCCCGGGAGCCCAGCCCCAAAACTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGGACAACGAGGGTGTCCTGCTCACTGAG         AAACTCAAGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104287 AGGACAACGAGGGTGTCCTGCTCACTGAGGTA...CAGAAACTCAAGCCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GTGGATTATGAGTACCGAGAAGAAGTCCACTGGGCCACGCACCAGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105809 GTGGATTATGAGTACCGAGAAGAAGTCCACTGGGCCACGCACCAGCTCCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCTGGGCAGAGGCTCCTTCGGAGAGGTGCACAGGATGGAGGACAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105859 CCTGGGCAGAGGCTCCTTCGGAGAGGTGCACAGGATGGAGGACAAGCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 CTGGCTTCCAGTGCGCTGTCAAAAAG         GTGCGGCTGGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105909 CTGGCTTCCAGTGCGCTGTCAAAAAGGTA...CAGGTGCGGCTGGAAGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTTCGGGCAGAGGAGCTGATGGCATGTGCAGGATTGACCTCACCCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116168 TTTCGGGCAGAGGAGCTGATGGCATGTGCAGGATTGACCTCACCCAGAAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TGTCCCTTTGTATGGAGCTGTGAGAGAAGGGCCTTGGGTCAACATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116218 TGTCCCTTTGTATGGAGCTGTGAGAGAAGGGCCTTGGGTCAACATCTTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGGAGCTGCTGGAAG         GTGGCTCCCTGGGCCAGCTGGTCAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 116268 TGGAGCTGCTGGAAGGTA...TAGGTGGCTCCCTGGGCCAGCTGGTCAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GAGCAGGGCTGTCTCCCAGAGGACCGGGCCCTGTACTACCTGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116518 GAGCAGGGCTGTCTCCCAGAGGACCGGGCCCTGTACTACCTGGGCCAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CCTGGAGGGTCTGGAATACCTCCACTCACGAAGGATTCTGCATGGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116568 CCTGGAGGGTCTGGAATACCTCCACTCACGAAGGATTCTGCATGGGGACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 TCAAAG         CTGACAACGTGCTCCTGTCCAGCGATGGGAGCCAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116618 TCAAAGGTA...CAGCTGACAACGTGCTCCTGTCCAGCGATGGGAGCCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GCAGCCCTCTGTGACTTTGGCCATGCTGTGTGTCTTCAACCTGATGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117174 GCAGCCCTCTGTGACTTTGGCCATGCTGTGTGTCTTCAACCTGATGGCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GGGAAAGTCCTTGCTCACAG         GGGACTACATCCCTGGCACAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 117224 GGGAAAGTCCTTGCTCACAGGTA...CAGGGGACTACATCCCTGGCACAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 AGACCCACATGGCTCCGGAGGTGGTGCTGGGCAGGAGCTGCGACGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119546 AGACCCACATGGCTCCGGAGGTGGTGCTGGGCAGGAGCTGCGACGCCAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GTGGATGTCTGGAGCAGCTGCTGTATGATGCTGCACATGCTCAACGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119596 GTGGATGTCTGGAGCAGCTGCTGTATGATGCTGCACATGCTCAACGGCTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CCACCCCTGGACTCAGTTCTTCCGAGGGCCGCTCTGCCTCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 119646 CCACCCCTGGACTCAGTTCTTCCGAGGGCCGCTCTGCCTCAAGGTC...C

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1822   ATTGCCAGCGAGCCTCCGCCTGTGAGGGAGATCCCACCCTCCTGCGCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120181 AGATTGCCAGCGAGCCTCCGCCTGTGAGGGAGATCCCACCCTCCTGCGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 CCTCTCACAGCCCAGGCCATCCAAGAGGGGCTGAGGAAAGAGCCCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120231 CCTCTCACAGCCCAGGCCATCCAAGAGGGGCTGAGGAAAGAGCCCATCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CCGCGTGTCTGCAGCGGAGCTGGGAGGGAAGGTGAACCGGGCACTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120281 CCGCGTGTCTGCAGCGGAGCTGGGAGGGAAGGTGAACCGGGCACTACAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 AAG         TGGGAGGTCTGAAGAGCCCTTGGAGGGGAGAATATAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120331 AAGGTA...TAGTGGGAGGTCTGAAGAGCCCTTGGAGGGGAGAATATAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GAACCAAGACATCCACCGCCAAATCAAGCCAATTACCACCAGACCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123025 GAACCAAGACATCCACCGCCAAATCAAGCCAATTACCACCAGACCCTCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TGCCCAGCCGAGAGAGCTTTCGCCAAGGGCCCCAGGGCCCCGGCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123075 TGCCCAGCCGAGAGAGCTTTCGCCAAGGGCCCCAGGGCCCCGGCCAGCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 AGGAGACAACAGGCAGAGCCCCTAAGCTCCAGCCTCCTCTCCCACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123125 AGGAGACAACAGGCAGAGCCCCTAAGCTCCAGCCTCCTCTCCCACCAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 CCCCCAGAGCCAAACAAGTCTCCTCCCTTGACTTTGAGCAAGGAGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123175 CCCCCAGAGCCAAACAAGTCTCCTCCCTTGACTTTGAGCAAGGAGGAGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 TGGGATGTGGGAACCCTTACCTCTGTCCTCCCTGGAGCCAGCCCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123225 TGGGATGTGGGAACCCTTACCTCTGTCCTCCCTGGAGCCAGCCCCTGCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 GAAACCCCAGCTCACCAGAGCGGAAAGCAACCGTCCCGGAGCAGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123275 GAAACCCCAGCTCACCAGAGCGGAAAGCAACCGTCCCGGAGCAGGAACTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 CAGCAGCTGGAAATAG         AATTATTCCTCAACAGCCTGTCCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 123325 CAGCAGCTGGAAATAGGTA...CAGAATTATTCCTCAACAGCCTGTCCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 GCCATTTTCTCTGGAGGAGCAGGAGCAAATTCTCTCGTGCCTCAGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123573 GCCATTTTCTCTGGAGGAGCAGGAGCAAATTCTCTCGTGCCTCAGCATCG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 ACAGCCTCTCCCTGTCGGATGACAGTGAGAAG         AACCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 123623 ACAGCCTCTCCCTGTCGGATGACAGTGAGAAGGTG...CAGAACCCATCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 AAGGCCTCTCAAAGCTCGCGGGACACCCTGAGCTCAGGCGTACACTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124074 AAGGCCTCTCAAAGCTCGCGGGACACCCTGAGCTCAGGCGTACACTCCTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2493 GAGCAGCCAGGCCGAGGCTCGAAGCTCCAGCTGGAACATGGTGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124124 GAGCAGCCAGGCCGAGGCTCGAAGCTCCAGCTGGAACATGGTGCTGGCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2543 GGGGGCGGCCCACCGACACCCCAAGCTATTTCAATG         GTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 124174 GGGGGCGGCCCACCGACACCCCAAGCTATTTCAATGGTA...TAGGTGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 AAAGTCCAAATACAGTCTCTTAATGGTGAACACCTGCACATCCGGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125488 AAAGTCCAAATACAGTCTCTTAATGGTGAACACCTGCACATCCGGGAGTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2634 CCACCGGGTCAAAGTGGGAGACATCGCCACTGGCATCAGCAGCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 125538 CCACCGGGTCAAAGTGGGAGACATCGCCACTGGCATCAGCAGCCAGGTA.

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680      ATCCCAGCTGCAGCCTTCAGCTTGGTGACCAAAGACGGGCAGCCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 125588 ..TAGATCCCAGCTGCAGCCTTCAGCTTGGTCACCAAAGACGGGCAGCCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 GTTCGCTACGACATGGAGGTGCCAGACTCGGGCATCGACCTGCAGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125991 GTTCGCTACGACATGGAGGTGCCAGACTCGGGCATCGACCTGCAGTGCAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 ACTGGCCCCTGATGGCAGCTTCGCCTGGAGCTGGAGGGTCAAGCATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126041 ACTGGCCCCTGATGGCAGCTTCGCCTGGAGCTGGAGGGTCAAGCATGGCC

   2950     .    :    .
   2825 AGCTGGAGAACAGGCCC
        |||||||||||||||||
 126091 AGCTGGAGAACAGGCCC