seq1 = pF1KE1420.tfa, 627 bp
seq2 = pF1KE1420/gi568815579f_48656237.tfa (gi568815579f:48656237_48858217), 201981 bp

>pF1KE1420 627
>gi568815579f:48656237_48858217 (Chr19)

1-235  (100001-100235)   99% ->
236-339  (100690-100793)   100% ->
340-627  (101694-101981)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTCGGACGAGACCGGGTTCGAGCACTCAGGGCTGTGGGTTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100001 ATGGACTCGGACGAGACCGGGTTCGAGCACTCAGGACTGTGGGTTTCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGCTGGTCTTCTGCTGGGAGCCTGCCAGGCACACCCCATCCCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGCTGGTCTTCTGCTGGGAGCCTGCCAGGCACACCCCATCCCTGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGTCCTCTCCTGCAATTCGGGGGCCAAGTCCGGCAGCGGTACCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGTCCTCTCCTGCAATTCGGGGGCCAAGTCCGGCAGCGGTACCTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAGATGATGCCCAGCAGACAGAAGCCCACCTGGAGATCAGGGAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGATGATGCCCAGCAGACAGAAGCCCACCTGGAGATCAGGGAGGATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACGGTGGGGGGCGCTGCTGACCAGAGCCCCGAAA         GTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100201 GACGGTGGGGGGCGCTGCTGACCAGAGCCCCGAAAGTG...TAGGTCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAGCTGAAAGCCTTGAAGCCGGGAGTTATTCAAATCTTGGGAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100696 TGCAGCTGAAAGCCTTGAAGCCGGGAGTTATTCAAATCTTGGGAGTCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACATCCAGGTTCCTGTGCCAGCGGCCAGATGGGGCCCTGTATGGATCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100746 ACATCCAGGTTCCTGTGCCAGCGGCCAGATGGGGCCCTGTATGGATCGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340        CTCCACTTTGACCCTGAGGCCTGCAGCTTCCGGGAGCTGCTTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100796 G...TAGCTCCACTTTGACCCTGAGGCCTGCAGCTTCCGGGAGCTGCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGAGGACGGATACAATGTTTACCAGTCCGAAGCCCACGGCCTCCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101737 TTGAGGACGGATACAATGTTTACCAGTCCGAAGCCCACGGCCTCCCGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACCTGCCAGGGAACAAGTCCCCACACCGGGACCCTGCACCCCGAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 CACCTGCCAGGGAACAAGTCCCCACACCGGGACCCTGCACCCCGAGGACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCTCGCTTCCTGCCACTACCAGGCCTGCCCCCCGCACCCCCGGAGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 101837 AGCTCGCTTCCTGCCACTACCAGGCCTGCCCCCCGCACTCCCGGAGCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCGGAATCCTGGCCCCCCAGCCCCCCGATGTGGGCTCCTCGGACCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 CCGGAATCCTGGCCCCCCAGCCCCCCGATGTGGGCTCCTCGGACCCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    583 AGCATGGTGGGACCTTCCCAGGGCCGAAGCCCCAGCTACGCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 AGCATGGTGGGACCTTCCCAGGGCCGAAGCCCCAGCTACGCTTCC