seq1 = pF1KE1400.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE1400/gi568815592f_26003948.tfa (gi568815592f:26003948_26204256), 200309 bp

>pF1KE1400 309
>gi568815592f:26003948_26204256 (Chr6)

1-309  (100001-100309)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGGACGCGGCAAAGGCGGAAAAGGCTTGGGGAAGGGTGGTGCTAA
        ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGTCGCGGCAAAGGCGGAAAAGGCTTGGGGAAGGGTGGTGCTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCATCGTAAGGTGCTCCGGGATAACATCCAGGGCATTACAAAACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCCATCGTAAGGTGCTCCGGGATAACATCCAGGGCATTACAAAACCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTATTCGCCGTTTGGCTCGGCGCGGTGGCGTCAAGCGCATTTCCGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTATTCGCCGTTTGGCTCGGCGCGGTGGCGTCAAGCGCATTTCCGGTCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTATGAGGAGACTCGAGGTGTGCTTAAGGTTTTCTTAGAGAACGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCTATGAGGAGACTCGAGGTGTGCTTAAGGTTTTCTTAGAGAACGTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCGAGACGCCGTCACCTATACGGAGCACGCCAAGCGCAAAACTGTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCGAGACGCCGTCACCTATACGGAGCACGCCAAGCGCAAAACTGTCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCATGGATGTAGTATATGCCCTAAAACGTCAGGGGCGCACTCTGTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCATGGATGTAGTATATGCCCTAAAACGTCAGGGGCGCACTCTGTATGGC

    300     .
    301 TTCGGCGGC
        |||||||||
 100301 TTCGGCGGC