seq1 = pF1KE1390.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KE1390/gi568815583r_34690415.tfa (gi568815583r:34690415_34894808), 204394 bp

>pF1KE1390 1131
>gi568815583r:34690415_34894808 (Chr15)

(complement)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-454  (101240-101564)   100% ->
455-616  (102240-102401)   100% ->
617-808  (102528-102719)   100% ->
809-990  (103514-103695)   100% ->
991-1131  (104254-104394)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGTGACGACGAGGAGACCACCGCCCTGGTGTGCGACAACGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGTGACGACGAGGAGACCACCGCCCTGGTGTGCGACAACGGCTCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGTGAAGGCCGGCTTTGCGGGCGATGACGCGCCCCGCGCTGTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGTGAAGGCCGGCTTTGCGGGCGATGACGCGCCCCGCGCTGTCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCCATCGTGGGCCGCCCGCGGCACCAG         GGAGTTATGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 CGTCCATCGTGGGCCGCCCGCGGCACCAGGTA...TAGGGAGTTATGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTAGGTGATGAAGCCCAGAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101252 GGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTAGGTGATGAAGCCCAGAGCAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGCATCCTGACCCTGAAGTATCCCATCGAGCATGGTATCATCACCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101302 AGGCATCCTGACCCTGAAGTATCCCATCGAGCATGGTATCATCACCAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGACGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101352 GGGACGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAGCTCCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGCTCCCGAGGAGCACCCCACCCTGCTCACAGAGGCCCCGCTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101402 GTGGCTCCCGAGGAGCACCCCACCCTGCTCACAGAGGCCCCGCTGAACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGGCCAACCGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACCTTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 CAAGGCCAACCGGGAGAAGATGACTCAGATCATGTTTGAGACCTTCAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCCTGCCATGTACGTGGCCATCCAGGCAGTGCTATCCCTGTATGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101502 TCCCTGCCATGTACGTGGCCATCCAGGCAGTGCTATCCCTGTATGCTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGCCGTACCACAG         GCATTGTTCTGGACTCTGGGGATGGTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101552 GGCCGTACCACAGGTA...CAGGCATTGTTCTGGACTCTGGGGATGGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AACTCACAATGTCCCCATCTATGAGGGCTACGCTTTGCCCCATGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102268 AACTCACAATGTCCCCATCTATGAGGGCTACGCTTTGCCCCATGCCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCGTCTGGATCTGGCTGGTCGGGACCTCACTGACTACCTCATGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102318 TGCGTCTGGATCTGGCTGGTCGGGACCTCACTGACTACCTCATGAAGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCACTGAGCGTGGCTACTCCTTTGTCACCACTG         CTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102368 CTCACTGAGCGTGGCTACTCCTTTGTCACCACTGGTG...TAGCTGAACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGAAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAGCTGTGCTATGTCGCCCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102535 TGAAATTGTCCGTGACATTAAAGAGAAGCTGTGCTATGTCGCCCTGGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TTGAGAATGAGATGGCCACAGCTGCCTCTTCCTCCTCCCTGGAGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102585 TTGAGAATGAGATGGCCACAGCTGCCTCTTCCTCCTCCCTGGAGAAGAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TATGAACTGCCTGATGGCCAAGTCATCACTATTGGCAATGAGCGCTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102635 TATGAACTGCCTGATGGCCAAGTCATCACTATTGGCAATGAGCGCTTCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTGTCCTGAGACACTCTTCCAGCCCTCCTTCATTG         GTATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102685 CTGTCCTGAGACACTCTTCCAGCCCTCCTTCATTGGTG...CAGGTATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AATCTGCTGGCATCCATGAAACAACTTACAATAGCATCATGAAGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103520 AATCTGCTGGCATCCATGAAACAACTTACAATAGCATCATGAAGTGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATTGATATCCGCAAGGACCTGTATGCCAACAATGTCTTATCTGGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103570 ATTGATATCCGCAAGGACCTGTATGCCAACAATGTCTTATCTGGAGGCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACTATGTACCCTGGTATTGCTGATCGTATGCAGAAGGAAATCACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103620 CACTATGTACCCTGGTATTGCTGATCGTATGCAGAAGGAAATCACTGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGCTCCTAGCACCATGAAGATTAAG         ATTATTGCTCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103670 TGGCTCCTAGCACCATGAAGATTAAGGTA...CAGATTATTGCTCCCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGCGTAAATACTCTGTCTGGATTGGGGGCTCCATCCTGGCCTCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104269 GAGCGTAAATACTCTGTCTGGATTGGGGGCTCCATCCTGGCCTCTCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CACCTTCCAGCAAATGTGGATTAGCAAGCAAGAGTACGATGAGGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104319 CACCTTCCAGCAAATGTGGATTAGCAAGCAAGAGTACGATGAGGCAGGCC

   1150     .    :    .    :    .
   1106 CATCCATTGTCCACCGCAAATGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||
 104369 CATCCATTGTCCACCGCAAATGCTTC