seq1 = pF1KE1378.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KE1378/gi568815579r_53123974.tfa (gi568815579r:53123974_53324665), 200692 bp

>pF1KE1378 747
>gi568815579r:53123974_53324665 (Chr19)

(complement)

1-50  (99782-99831)   90% <-
51-747  (100000-100692)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTTCTCCGCGGCGCTCCGGGCCCGGGCGGCTGGCCTCACCGCCCA
        | |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
  99782 AAGGCCTTCTCCGCGGCGCTCCGGGCCCGGGCCGCTGGCCTTACCGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51          CTGGGGAAGACATGTAAGGAATTTGCATAAGACAGTTATGC
        <<<...<<<|---||||||||||| |||||||-||||||||||| |||||
  99832 CTG...CACC   GGAAGACATGTGAGGAATT GCATAAGACAGCTATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAATGGAGCTGGAGGAGCTTTATTTGTGCACAGAGATACTCCTGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100037 AAAATGGAGCTGGAGGAGCTTTATTTGTGCACAGAGATACTCCTGAGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACCCTGATACTCCATTTGATTTCACACCAGAAAACTATAAGAGGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100087 AACCCTGATACTCCATTTGATTTCACACCAGAAAACTATAAGAGGATAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCAATTGTAAAAAACTATCCAGAAGGCCATAAAGCAGCAGCTGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100137 GGCAATTGTAAAAAACTATCCAGAAGGCCATAAAGCAGCAGCTGTTCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTCCTGGATTTAGCCCAAAGGCAGAATGGGTGGTTGCCCATCTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100187 CAGTCCTGGATTTAGCCCAAAGGCAGAATGGGTGGTTGCCCATCTCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGAACAAGGTTGCAGAAGTTTTACAAGTACCTCCAATGAGAGTATATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100237 ATGAACAAGGTTGCAGAAGTTTTACAAGTACCTCCAATAAGAGTATATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGTAGCAACTTTTTATACAATGTATAATCGAAAGCCAGTTGGAAAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100287 AGTAGCAACTTTTTATACAATGTATAATCGAAAGCCAGTTGAAAAGTATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACATTCAGGTCTGCACTACTACACCCTGCATGCTTCGAAACTCTGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100337 ACATTCAGGTCTGCACTACTACACCCTGCATGCTTCCAAACTCTGACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATACTGGAGGCCATTCAGAAAAAGCTTGGAATAAAGGTTGGGGAGACTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100387 ATACTGGAGGCCATTCAGAAAAAGCTTGGAATAAAGCTTGGGGAGACTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACCTGACAAACTTTTCACTCTTATAGAAGTGGAATGTTTAGGGGCCTGTG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100437 ACCTGACAAACTTTTCACTCTTGTAGAAGTGGAATGTTTAGGGGCCTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGAACGCACCAATGGTTCAAATAAATGACAATTACTATGAGGATTTGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100487 TGAACGCACCAATGGTTCAAATAAATGACAATTACTATGAAGATTTGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTAAGGATATTGAAGAAATTATTGATGAGCTCAAGGCTGGCAAAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100537 GCTAAGGATATTGAAGAAATTATTGATGAGCTCAAGGCTGGCAAAATCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AAAACCAGGGCCAAGGAGTGGACGCTTCTCTTGTGAGCCAGCTGGAGGTC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100587 AAAACCTGGGCCAAGGAGTGGACGCTTCTCTTGTGAGCCAGCTGGAGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTACCTCTTTGACTGAACCACCCAAGGGACCTGGATTTGGTGTACAAGCA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
 100637 TTACCCCTTTGACTGAACCACCCAAGGGACCTGGATTTGGCATACAAGCA

    750     .
    742 GGCCTT
        ||||||
 100687 GGCCTT