seq1 = pF1KE1365.tfa, 1170 bp
seq2 = pF1KE1365/gi568815591r_75056797.tfa (gi568815591r:75056797_75271943), 215147 bp

>pF1KE1365 1170
>gi568815591r:75056797_75271943 (Chr7)

(complement)

1-74  (100001-100076)   97% ->
75-153  (103234-103312)   100% ->
154-229  (105067-105142)   100% ->
230-395  (105242-105407)   99% ->
396-451  (106765-106820)   100% ->
452-574  (108925-109047)   98% ->
575-682  (109511-109618)   99% ->
683-800  (111168-111285)   100% ->
801-905  (113974-114078)   98% ->
906-1051  (114549-114694)   99% ->
1052-1170  (115029-115147)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGACACCTTCATCCGTCACATCGCCCTGCTGGGCTTTGAGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGACACCTTCATCCGTCACATCGCCCTGCTGGGCTTTGAGAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCGTACCCAGCCAGCACTATGT           GTACATGTTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||-->>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CTTCGTACCCAGCCAGCACTATGTGAGTA...CAGGTACATGTTCCTGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     90 GAAATGGCAGGACCTGTCGGAGAAGGTGGTCTACCGGCGCTTCACCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103249 GAAATGGCAGGACCTGTCGGAGAAGGTGGTCTACCGGCGCTTCACCGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 TCTACGAGTTCCAT         AAAACCTTAAAAGAAATGTTCCCTATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103299 TCTACGAGTTCCATGTG...TAGAAAACCTTAAAAGAAATGTTCCCTATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181 GAGGCAGGGGCGATCAATCCAGAGAACAGGATCATCCCCCACCTCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 105094 GAGGCAGGGGCGATCAATCCAGAGAACAGGATCATCCCCCACCTCCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230         CTCCCAAGTGGTTTGACGGGCAGCGGGCCGCCGAGAACCGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 105144 TG...CAGCTCCCAAGTGGTTTGACGGGCAGCGGGCCGCCGAGAACCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    272 AGGGCACACTTACCGAGTACTGCAGCACGCTCATGAGCCTGCCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105284 AGGGCACACTTACCGAGTACTGCAGCACGCTCATGAGCCTGCCCACCAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 ATCTCCCGCTGTCCCCACCTCCTCGACTTCTTCAAGGTGCGCCCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105334 ATCTCCCGCTGTCCCCACCTCCTCGACTTCTTCAAGGTGCGCCCTGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372 CCTCAAGCTCCCCACGGACAACCA         GACAAAAAAGCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105384 CCTCAAGCTCCCCACGGACAACCAGTG...CAGGACAAAAAAGCCAGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    413 CATACTTGATGCCCAAAGATGGCAAGAGTACCGCGACAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106782 CATACTTGATGCCCAAAGATGGCAAGAGTACCGCGACAGGTG...CAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    454 ATCACCGGCCCCATCATCCTGCAGACGTACCGCGCCATTGCCAACTACGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 108927 ATCACCGGCCCCATCATCCTGCAGACGTACCGCGCCATTGCCGACTACGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    504 GAAGACCTCGGGCTCCGAGATGGCTCTGTCCACGGGGGACGTGGTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108977 GAAGACCTCGGGCTCCGAGATGGCTCTGTCCACGGGGGACGTGGTGGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    554 TCGTAGAGAAGAGCGAGAGCG         GTTGGTGGTTCTGTCAGATG
        |||| ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 109027 TCGTGGAGAAGAGCGAGAGCGGTC...CAGGTTGGTGGTTCTGTCAGATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595 AAAGCAAAGCGAGGCTGGATCCCAGCGTCCTTCCTCGAGCCCCTGGACAG
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 109531 AAAGCAAAGCGAGGCTGGATCCCAGCATCCTTCCTCGAGCCCCTGGACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    645 TCCTGACGAGACGGAAGACCCTGAGCCCAACTATGCAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109581 TCCTGACGAGACGGAAGACCCTGAGCCCAACTATGCAGGTG...CAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    686 AGCCATACGTCGCCATCAAGGCCTACACTGCTGTGGAGGGGGACGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111171 AGCCATACGTCGCCATCAAGGCCTACACTGCTGTGGAGGGGGACGAGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    736 TCCCTGCTCGAGGGTGAAGCTGTTGAGGTCATTCACAAGCTCCTGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111221 TCCCTGCTCGAGGGTGAAGCTGTTGAGGTCATTCACAAGCTCCTGGACGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    786 CTGGTGGGTCATCAG         GAAAGACGACGTCACAGGCTACTTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| |
 111271 CTGGTGGGTCATCAGGTA...CAGGAAAGACGACGTCACAGGCTACTTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    827 CGTCCATGTACCTGCAAAAGTCAGGGCAAGACGTGTCCCAGGCCCAACGC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 114000 CGTCCATGTACCTGCAAAAGTCGGGGCAAGACGTGTCCCAGGCCCAACGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    877 CAGATCAAGCGGGGGGCGCCGCCCCGCAG         GTCGTCCATCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114050 CAGATCAAGCGGGGGGCGCCGCCCCGCAGGTA...CAGGTCGTCCATCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    918 CAACGCGCACAGCATCCACCAGCGGTCGCGGAAGCGCCTCAGCCAGGACG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 114561 CAACGCGCACAGCATCCATCAGCGGTCGCGGAAGCGCCTCAGCCAGGACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    968 CCTATCGCCGCAACAGCGTCCGTTTTCTGCAGCAGCGACGCCGCCAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114611 CCTATCGCCGCAACAGCGTCCGTTTTCTGCAGCAGCGACGCCGCCAGGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1018 CGGCCGGGACCGCAGAGCCCCGGGAGCCCGCTCG         AGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114661 CGGCCGGGACCGCAGAGCCCCGGGAGCCCGCTCGGTG...CAGAGGAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1059 GCGGCAGACGCAGCGCTCTAAACCGCAGCCGGCGGTGCCCCCGCGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115036 GCGGCAGACGCAGCGCTCTAAACCGCAGCCGGCGGTGCCCCCGCGGCCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1109 GCGCCGACCTCATCCTGAACCGCTGCAGCGAGAGCACCAAGCGGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115086 GCGCCGACCTCATCCTGAACCGCTGCAGCGAGAGCACCAAGCGGAAGCTG

   1250     .    :
   1159 GCGTCTGCCGTC
        ||||||||||||
 115136 GCGTCTGCCGTC