seq1 = pF1KE1351.tfa, 1911 bp
seq2 = pF1KE1351/gi568815584r_22820907.tfa (gi568815584r:22820907_23029361), 208455 bp

>pF1KE1351 1911
>gi568815584r:22820907_23029361 (Chr14)

(complement)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-229  (100747-100865)   100% ->
230-315  (101151-101236)   100% ->
316-450  (101702-101836)   100% ->
451-563  (102548-102660)   100% ->
564-613  (102807-102856)   100% ->
614-777  (103066-103229)   100% ->
778-939  (104322-104483)   100% ->
940-1017  (104653-104730)   100% ->
1018-1076  (104825-104883)   100% ->
1077-1199  (104970-105092)   100% ->
1200-1375  (105179-105354)   100% ->
1376-1485  (106202-106311)   100% ->
1486-1579  (106527-106620)   100% ->
1580-1696  (106803-106919)   100% ->
1697-1761  (107122-107186)   100% ->
1762-1911  (108306-108455)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGATGGCGGTCGGGGGTGCTGGTGGGAGCCGCGTGTCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGATGGCGGTCGGGGGTGCTGGTGGGAGCCGCGTGTCCAGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGGGACCTGAATTGCGTCCCCGAAATAGCTGACACACTAGGGGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGGGACCTGAATTGCGTCCCCGAAATAGCTGACACACTAGGGGCTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGCAGGG         GTTTGATTTCCTCTGCATGCCTGTCTTCCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGCAGGGGTG...TAGGTTTGATTTCCTCTGCATGCCTGTCTTCCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCGCGTTTCAAGAGGGAGTTCATTCAGGAACCTGCTAAGAATCGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100778 CCGCGTTTCAAGAGGGAGTTCATTCAGGAACCTGCTAAGAATCGGCCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCCCAGACACGATCAGACCTACTGCTGTCAGGAAGGG         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100828 TCCCCAGACACGATCAGACCTACTGCTGTCAGGAAGGGGTA...CAGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAATACGCTAATTGTGGGAAAGCTTTCTCCATGGATTCGTCCAGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101154 GGAATACGCTAATTGTGGGAAAGCTTTCTCCATGGATTCGTCCAGACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGTGGAGAAGATTCGCAGGAACTCCGAGGCG         GCCATGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101204 AAAGTGGAGAAGATTCGCAGGAACTCCGAGGCGGTA...CAGGCCATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACAGGAGCTGAATTTTGGTGCATATTTGGGTCTTCCAGCTTTCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101710 ACAGGAGCTGAATTTTGGTGCATATTTGGGTCTTCCAGCTTTCCTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCTTAATCAGGAAGATAACACCAACCTGGCCAGAGTTTTGACCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101760 CCCTTAATCAGGAAGATAACACCAACCTGGCCAGAGTTTTGACCAACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCCACACTGGCCATCACTCTTCCATG         TTCTGGATGCGGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101810 ATCCACACTGGCCATCACTCTTCCATGGTA...CAGTTCTGGATGCGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACCCTTGGTGGCACCAGAGGACCTGAGAGATGATATAATTGAGAATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102562 ACCCTTGGTGGCACCAGAGGACCTGAGAGATGATATAATTGAGAATGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAACTACACACACAGAGGAGTACAGTGGGGAGGAGAAAACGTGGATGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102612 CAACTACACACACAGAGGAGTACAGTGGGGAGGAGAAAACGTGGATGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564         GTGGCACAACTTCCGGACTTTGTGTGACTATAGTAAGAGGAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102662 TA...CAGGTGGCACAACTTCCGGACTTTGTGTGACTATAGTAAGAGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCAGTGG         CTCTTGAAATTGGGGCTGACCTCCCATCTAATC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102849 TGCAGTGGGTG...TAGCTCTTGAAATTGGGGCTGACCTCCCATCTAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGTCATTGATCGCTGGCTTGGGGAGCCCATCAAAGCAGCCATTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103099 ATGTCATTGATCGCTGGCTTGGGGAGCCCATCAAAGCAGCCATTCTCCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACTAGCATTTTCCTGACCAATAAGAAGGGATTTCCTGTTCTTTCTAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103149 ACTAGCATTTTCCTGACCAATAAGAAGGGATTTCCTGTTCTTTCTAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCACCAGAGGCTCATCTTCCGGCTCCTCAAG         TTGGAGGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103199 GCACCAGAGGCTCATCTTCCGGCTCCTCAAGGTG...CAGTTGGAGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGTTCATCATCACAGGCACCAACCACCACTCAGAGAAGGAGTTCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104332 AGTTCATCATCACAGGCACCAACCACCACTCAGAGAAGGAGTTCTGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TACCTCCAATACCTGGAATACTTAAGCCAGAACCGTCCTCCACCTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104382 TACCTCCAATACCTGGAATACTTAAGCCAGAACCGTCCTCCACCTAATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATGAACTCTTTGCCAAGGGCTATGAAGACTATCTGCAGTCCCCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104432 CTATGAACTCTTTGCCAAGGGCTATGAAGACTATCTGCAGTCCCCGCTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AG         CCACTGATGGACAATCTGGAATCTCAGACATATGAAGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104482 AGGTG...CAGCCACTGATGGACAATCTGGAATCTCAGACATATGAAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTTGAAAAGGACCCCATCAAATACTCTCAGTACCAGCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104692 TTTGAAAAGGACCCCATCAAATACTCTCAGTACCAGCAGGTA...CAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CATCTATAAATGTCTGCTAGACCGAGTACCAGAAGAGGAGAAGGATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104827 CATCTATAAATGTCTGCTAGACCGAGTACCAGAAGAGGAGAAGGATACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGTCCA         GGTACTGATGGTGCTGGGAGCAGGACGGGGACCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104877 ATGTCCAGTG...TAGGGTACTGATGGTGCTGGGAGCAGGACGGGGACCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTGGTGAACGCTTCCCTGCGGGCAGCCAAGCAGGCCGACCGGCGGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105004 CTGGTGAACGCTTCCCTGCGGGCAGCCAAGCAGGCCGACCGGCGGATAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GCTGTATGCTGTGGAGAAAAACCCAAATGCCGTGGTGAC         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 105054 GCTGTATGCTGTGGAGAAAAACCCAAATGCCGTGGTGACGTG...CAGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TAGAGAACTGGCAGTTTGAAGAATGGGGAAGCCAAGTGACCGTAGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105181 TAGAGAACTGGCAGTTTGAAGAATGGGGAAGCCAAGTGACCGTAGTCTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCAGACATGAGGGAATGGGTGGCTCCAGAGAAAGCAGACATCATTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105231 TCAGACATGAGGGAATGGGTGGCTCCAGAGAAAGCAGACATCATTGTCAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TGAGCTTCTGGGCTCATTTGCTGACAATGAATTGTCGCCTGAGTGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105281 TGAGCTTCTGGGCTCATTTGCTGACAATGAATTGTCGCCTGAGTGCCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ATGGAGCCCAGCACTTCCTAAAAG         ATGATGGTGTGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105331 ATGGAGCCCAGCACTTCCTAAAAGGTG...CAGATGATGGTGTGAGCATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCCGGGGAGTACACTTCCTTTCTGGCTCCCATCTCTTCCTCCAAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106219 CCCGGGGAGTACACTTCCTTTCTGGCTCCCATCTCTTCCTCCAAGCTGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CAATGAGGTCCGAGCCTGTAGGGAGAAGGACCGTGACCCTGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106269 CAATGAGGTCCGAGCCTGTAGGGAGAAGGACCGTGACCCTGAGGTA...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1486   GCCCAGTTTGAGATGCCTTATGTGGTACGGCTGCACAACTTCCACCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106525 AGGCCCAGTTTGAGATGCCTTATGTGGTACGGCTGCACAACTTCCACCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CTCTCTGCACCCCAGCCCTGTTTCACCTTCAGCCATCCCAACAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106575 CTCTCTGCACCCCAGCCCTGTTTCACCTTCAGCCATCCCAACAGAGGTA.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1580      ATCCTATGATTGACAACAACCGCTATTGCACCTTGGAATTTCCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106625 ..CAGATCCTATGATTGACAACAACCGCTATTGCACCTTGGAATTTCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGAGGTGAACACAGTACTACATGGCTTTGCCGGCTACTTTGAGACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106848 TGGAGGTGAACACAGTACTACATGGCTTTGCCGGCTACTTTGAGACTGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CTTTATCAGGACATCACTCTGA         GTATCCGTCCAGAGACTCA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 106898 CTTTATCAGGACATCACTCTGAGTG...CAGGTATCCGTCCAGAGACTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 CTCTCCTGGGATGTTCTCATGGTTTCCCATCCTCTTCCCTATTAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107141 CTCTCCTGGGATGTTCTCATGGTTTCCCATCCTCTTCCCTATTAAGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1762      CAGCCCATAACGGTACGTGAAGGCCAAACCATCTGTGTGCGTTTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107191 ..CAGCAGCCCATAACGGTACGTGAAGGCCAAACCATCTGTGTGCGTTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 TGGCGATGCAGCAATTCCAAGAAGGTGTGGTATGAGTGGGCTGTGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108351 TGGCGATGCAGCAATTCCAAGAAGGTGTGGTATGAGTGGGCTGTGACAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 ACCAGTCTGTTCTGCTATTCATAACCCCACAGGCCGCTCATATACCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108401 ACCAGTCTGTTCTGCTATTCATAACCCCACAGGCCGCTCATATACCATTG

   2050     .
   1907 GCCTC
        |||||
 108451 GCCTC