seq1 = pF1KE1321.tfa, 321 bp
seq2 = pF1KE1321/gi568815594r_73938092.tfa (gi568815594r:73938092_74199120), 261029 bp

>pF1KE1321 321
>gi568815594r:73938092_74199120 (Chr4)

(complement)

1-100  (160510-160609)   100% ->
101-224  (160708-160831)   100% ->
225-314  (160945-161033)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCACGCCACGCTCTCCGCCGCCCCCAGCAATCCCCGGCTCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160510 ATGGCCCACGCCACGCTCTCCGCCGCCCCCAGCAATCCCCGGCTCCTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGCGCTGCTGCTCCTGCTCCTGGTGGCCGCCAGCCGGCGCGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160560 GGTGGCGCTGCTGCTCCTGCTCCTGGTGGCCGCCAGCCGGCGCGCAGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          GAGCGTCCGTGGTCACTGAACTGCGCTGCCAGTGCTTGCAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160610 GTG...TAGGAGCGTCCGTGGTCACTGAACTGCGCTGCCAGTGCTTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACACTGCAGGGAATTCACCTCAAGAACATCCAAAGTGTGAATGTAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160749 ACACTGCAGGGAATTCACCTCAAGAACATCCAAAGTGTGAATGTAAGGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCGGACCCCACTGCGCCCAAACCGAAGTCAT         AGCCACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 160799 CCCCGGACCCCACTGCGCCCAAACCGAAGTCATGTA...CAGAGCCACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAAGAATGGGAAGAAAGCTTGTCTCAACCCCGCATCCCCCATGGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160953 TCAAGAATGGGAAGAAAGCTTGTCTCAACCCCGCATCCCCCATGGTTCAG

    300     .    :    .    :    .    :
    283 AAAATCATCGAAAAGATACTGAACAAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||| |-||
 161003 AAAATCATCGAAAAGATACTGAACAAGTG AG