seq1 = pF1KE1297.tfa, 378 bp
seq2 = pF1KE1297/gi568815577r_5872956.tfa (gi568815577r:5872956_6073333), 200378 bp

>pF1KE1297 378
>gi568815577r:5872956_6073333 (Chr21)

(complement)

1-378  (100001-100378)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGAGCCAGCGAAGTCCGCTCCCGCGCCCAAGAAGGGCTCGAAGAA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGAGCCAGCGAAGTCCGCTCCCGCGCCCAAGAAGGGCTCGAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCGTGACTAAGGCGCAGAAGAAGGACGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100051 AGCCGTGACTAAGGCGCAGAAGAAGGACGGCAGGAAGCGCAAGCGCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAAGGAGAGCTACTCCGTATACGTGTACAAGGTGCTGAAGCAGGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAAGGAGAGCTACTCCGTATACGTGTACAAGGTGCTGAAGCAGGTCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGACACCGGCATCTCCTCTAAGGCCATGGGAATCATGAACTCCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGACACCGGCATCTCCTCTAAGGCCATGGGAATCATGAACTCCTTCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACGACATCTTCGAACGCATCGCGGGTGAGGCTTCCCGCCTGGCGCATT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
 100201 CAACGACATCTTCGAACGCATCGCAGGTGAGGCTTCCCGCCTGCCGCATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACAAGCGCTCGACCATCACCTCCAGGGAGATCCAGACGGCCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACAAGCGCTCGACCATCACCTCCAGGGAGATCCAGACGGCCGTGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCTGCTGCCCGGGGAGTTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCTGCTGCCCGGGGAGTTGGCCAAGCACGCCGTGTCCGAGGGCACCAA

    350     .    :    .    :    .
    351 GGCCGTCACCAAGTACACCAGCGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCGTCACCAAGTACACCAGCGCTAAG