seq1 = pF1KE1288.tfa, 2706 bp
seq2 = pF1KE1288/gi568815597r_77465643.tfa (gi568815597r:77465643_77733354), 267712 bp

>pF1KE1288 2706
>gi568815597r:77465643_77733354 (Chr1)

(complement)

1-1505  (100001-101505)   100% ->
1506-1644  (148700-148838)   100% ->
1645-1792  (151229-151376)   100% ->
1793-1905  (151467-151579)   100% ->
1906-1977  (152286-152357)   100% ->
1978-2079  (153727-153828)   100% ->
2080-2175  (154486-154581)   100% ->
2176-2328  (157135-157287)   100% ->
2329-2463  (164889-165023)   100% ->
2464-2564  (167174-167274)   100% ->
2565-2706  (167571-167712)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTTCCCGATCTACTCGTGTTACAAGATCAACAGTGGGGTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTTCCCGATCTACTCGTGTTACAAGATCAACAGTGGGGTTAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTTGGATGAATCTTTTTGTGGTAGAACTTTAAGGAATCGTAGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTTGGATGAATCTTTTTGTGGTAGAACTTTAAGGAATCGTAGCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCATCCTGAAGAAATCTCTTCTAATTCTCAAGTACGATCAAGATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCATCCTGAAGAAATCTCTTCTAATTCTCAAGTACGATCAAGATCACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGAGACCAGAGCCTGTGCCAATTCAGAAAGGAAATAATAATGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGAAGAGACCAGAGCCTGTGCCAATTCAGAAAGGAAATAATAATGGGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACCACTGATTTAAAACAGCAGAGTACCCGAGAATCATGGGTAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACCACTGATTTAAAACAGCAGAGTACCCGAGAATCATGGGTAAGCCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAAAAGAGGACTTTCTTCTTCAGAAAAGGATAACATAGAAAGGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAAAAGAGGACTTTCTTCTTCAGAAAAGGATAACATAGAAAGGCAGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATAGAAAATTGTGAGAGAAGGCAAACAGAACCTGTTTCACCAGTTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATAGAAAATTGTGAGAGAAGGCAAACAGAACCTGTTTCACCAGTTTTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGAATTAAGCGTTGTCTTAGATCTGAAGCACCAAACAGTTCAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAGAATTAAGCGTTGTCTTAGATCTGAAGCACCAAACAGTTCAGAAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATTCTCCTATAAAATCAGACAAGGAGTCAGTAGAACAGAGGAGTACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATTCTCCTATAAAATCAGACAAGGAGTCAGTAGAACAGAGGAGTACAGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGACAATGATGCAGATTTTCAAGGGACTAAACGAGCTTGTCGATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGACAATGATGCAGATTTTCAAGGGACTAAACGAGCTTGTCGATGTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATACTGGATGATTGTGAGAAAAGGGAAATTAAAAAGGTGAATGTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATACTGGATGATTGTGAGAAAAGGGAAATTAAAAAGGTGAATGTCAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAAGGGCCACTTAATTCTGCAGTAGTTGAAGAAATCACAGGCTATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGAAGGGCCACTTAATTCTGCAGTAGTTGAAGAAATCACAGGCTATTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGTCAATGGTGTTGATGACAGTGATTCAGCTGTTATAAACTGTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGTCAATGGTGTTGATGACAGTGATTCAGCTGTTATAAACTGTGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGTCAGCCTGATGGGAACACTAAACAAAATAGCATTGGTTCCTATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGTCAGCCTGATGGGAACACTAAACAAAATAGCATTGGTTCCTATGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TACAGGAAAAATCAGTAGCTGAAAATGGGGATACGGATACCCAAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TACAGGAAAAATCAGTAGCTGAAAATGGGGATACGGATACCCAAACTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGTTCCTTGATAGTAGGAAGGAGGACAGTTATATAGACCATAAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGTTCCTTGATAGTAGGAAGGAGGACAGTTATATAGACCATAAGGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTGCACAGATTCACAAGTGCAGGTCAAGTTGGAGGACCACAAAATAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTGCACAGATTCACAAGTGCAGGTCAAGTTGGAGGACCACAAAATAGTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGCCTGCTTGCCTGTGGAACATGTTAATCAGCTGACTACTGAGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGCCTGCTTGCCTGTGGAACATGTTAATCAGCTGACTACTGAGCCAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACAGGGCCCTTTTCTGAAACTCAGTCATCTTTAAGGGATTCTGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACAGGGCCCTTTTCTGAAACTCAGTCATCTTTAAGGGATTCTGAGGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGTAGATGTGGTGGGAGATAGCAGTGCCTCAAAAGAGCAGTGTAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGTAGATGTGGTGGGAGATAGCAGTGCCTCAAAAGAGCAGTGTAAAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACACCAATAACGAACTGGACACAAGTCTTGAGAGTATGCCAGCCTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACACCAATAACGAACTGGACACAAGTCTTGAGAGTATGCCAGCCTCCGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAACCTGAACCATCTCCTGTTCTAGACTGTGTTTCAGCTCAAATGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAACCTGAACCATCTCCTGTTCTAGACTGTGTTTCAGCTCAAATGATGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TTTATCAGAACCTCAAGAACATCGTTATACTCTGAGAACCTCACCACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TTTATCAGAACCTCAAGAACATCGTTATACTCTGAGAACCTCACCACGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGCAGCCCCTACCAGAGGTAGTCCCACTAAAAACAGTTCTCCTTACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGGCAGCCCCTACCAGAGGTAGTCCCACTAAAAACAGTTCTCCTTACAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAAAATGGACAATTTGAGGAGAATAATCTTAGTCCTAATGAAACAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAAAATGGACAATTTGAGGAGAATAATCTTAGTCCTAATGAAACAAATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AACTGTTAGTGATAATGTAAGTCAATCTCCTACAAATCCTGGTGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AACTGTTAGTGATAATGTAAGTCAATCTCCTACAAATCCTGGTGAAATTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTCAAAATGAAAAAGGGATATGTTGTGACTCTCAAAATAATGGAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTCAAAATGAAAAAGGGATATGTTGTGACTCTCAAAATAATGGAAGTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGAGTAAGTAAACCACCCTCAGAGGCAAGACTCAATATTGGACATTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGAGTAAGTAAACCACCCTCAGAGGCAAGACTCAATATTGGACATTTGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 ATCTGCCAAAGAGAGTGCCAGTCAGCACATTACAGAAGAGGAAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 ATCTGCCAAAGAGAGTGCCAGTCAGCACATTACAGAAGAGGAAGATGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ATCCTGATGTTTATTACTTTGAATCAGATCATGTGGCACTGAAACACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ATCCTGATGTTTATTACTTTGAATCAGATCATGTGGCACTGAAACACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AAAGA         TTATCAGAGACTATTACAGACGATTGCTGTACTCGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AAAGAGTA...TAGTTATCAGAGACTATTACAGACGATTGCTGTACTCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGCTCAGCGTTCTCAAGCAGTCCAAGACCTTGAAAGTTTAGGCAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148736 GGCTCAGCGTTCTCAAGCAGTCCAAGACCTTGAAAGTTTAGGCAGGCACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 AGAGAGAAGCACTGAAAAATCCCATTGGATTTGTGGAAAAACTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148786 AGAGAGAAGCACTGAAAAATCCCATTGGATTTGTGGAAAAACTCCAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AAG         GCTGATATTGGGCTTCCATATCCACAGAGAGTTGTTCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148836 AAGGTA...CAGGCTGATATTGGGCTTCCATATCCACAGAGAGTTGTTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 ATTGCCTGAGATCGTATGGGACCAATATACCCATAGCCTTGGGAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151267 ATTGCCTGAGATCGTATGGGACCAATATACCCATAGCCTTGGGAATTTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AAAGAGAATTTAAAAATCGTAAAAGACATACTAGAAGAGTTAAGCTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151317 AAAGAGAATTTAAAAATCGTAAAAGACATACTAGAAGAGTTAAGCTAGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 TTTGATAAAG         GTTTACCTGCTAGACCAAAAAGTCCTTTAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 151367 TTTGATAAAGGTA...TAGGTTTACCTGCTAGACCAAAAAGTCCTTTAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 TCCTAAGAAGGATGGAGAGTCCCTTTCATATTCTATGTTGCCTTTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151498 TCCTAAGAAGGATGGAGAGTCCCTTTCATATTCTATGTTGCCTTTGAGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 ATGGTCCAGAAGGCTCAAGCAGTCGTCCTCAG         ATGATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 151548 ATGGTCCAGAAGGCTCAAGCAGTCGTCCTCAGGTA...CAGATGATAAGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 GGACGCTTGTGTGATGATACCAAACCTGAAACATTTAACCAGTTGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152295 GGACGCTTGTGTGATGATACCAAACCTGAAACATTTAACCAGTTGTGGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 TGTTGAAGAACAG         AAAAAGCTGGAACAGCTACTCATCAAAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 152345 TGTTGAAGAACAGGTA...TAGAAAAAGCTGGAACAGCTACTCATCAAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 ACCCTCCTGAAGAAGTAGAATCTCGACGCTGGCAGAAGATAGCAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153755 ACCCTCCTGAAGAAGTAGAATCTCGACGCTGGCAGAAGATAGCAGATGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 TTGGGCAACAGGACAGCAAAACAG         GTTGCCAGCCGAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 153805 TTGGGCAACAGGACAGCAAAACAGGTA...TAGGTTGCCAGCCGAGTACA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 GAAGTATTTCATAAAGCTAACTAAAGCTGGCATTCCAGTACCAGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154503 GAAGTATTTCATAAAGCTAACTAAAGCTGGCATTCCAGTACCAGGCAGAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 CACCAAACTTATATATATACTCCAAAAAG         TCTTCAACAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 154553 CACCAAACTTATATATATACTCCAAAAAGGTA...TAGTCTTCAACAAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 AGACGACAGCACCCTCTTAATAAGCATCTCTTTAAGCCTTCCACTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157147 AGACGACAGCACCCTCTTAATAAGCATCTCTTTAAGCCTTCCACTTTCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 GACTTCACATGAACCGCCAGTGTATATGGATGAAGATGATGACCGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157197 GACTTCACATGAACCGCCAGTGTATATGGATGAAGATGATGACCGATCTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 GTTTTCATAGCCACATGAACACTGCTGTTGAAGATGCATCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 157247 GTTTTCATAGCCACATGAACACTGCTGTTGAAGATGCATCAGTA...TAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 GATGACGAAAGTATTCCTATCATGTATAGGAATTTACCTGAATATAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164889 GATGACGAAAGTATTCCTATCATGTATAGGAATTTACCTGAATATAAAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2379 ACTATTACAGTTTAAAAAGTTAAAGAAGCAGAAACTTCAGCAAATGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164939 ACTATTACAGTTTAAAAAGTTAAAGAAGCAGAAACTTCAGCAAATGCAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 CTGAAAGTGGATTTGTGCAACATGTGGGCTTTAAG         TGTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 164989 CTGAAAGTGGATTTGTGCAACATGTGGGCTTTAAGGTA...TAGTGTGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 AACTGTGGCATAGAACCCATCCAGGGTGTTCGGTGGCATTGCCAGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167180 AACTGTGGCATAGAACCCATCCAGGGTGTTCGGTGGCATTGCCAGGATTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 TCCTCCAGAAATGTCTTTGGATTTCTGTGATTCTTGTTCAGACTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 167230 TCCTCCAGAAATGTCTTTGGATTTCTGTGATTCTTGTTCAGACTGGTA..

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2565     TCTACATGAAACAGATATTCACAAGGAAGATCACCAATTAGAACCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167280 .CAGTCTACATGAAACAGATATTCACAAGGAAGATCACCAATTAGAACCT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 ATTTATAGGTCAGAGACATTCTTAGACAGAGACTACTGTGTGTCTCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167617 ATTTATAGGTCAGAGACATTCTTAGACAGAGACTACTGTGTGTCTCAGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2661 CACCAGTTACAATTACCTTGACCCAAACTACTTTCCAGCAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167667 CACCAGTTACAATTACCTTGACCCAAACTACTTTCCAGCAAACAGA