seq1 = pF1KE1224.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KE1224/gi568815579r_10205094.tfa (gi568815579r:10205094_10408681), 203588 bp

>pF1KE1224 813
>gi568815579r:10205094_10408681 (Chr19)

(complement)

1-497  (100001-100497)   99% ->
498-604  (102730-102836)   100% ->
605-698  (103199-103292)   100% ->
699-813  (103474-103588)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGAACCTCAGGTGGGGTGTGTAGCCTGTCCAAGGGTACACAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGAACCTCAGGTGGGGTGTGTAGCCTGTCCAAGGGTACACAAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGCCCAAGTTGGAACCCCCTGGCCGGCTAAACCCAGGAGTCACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGCCCAAGTTGGAACCCCCTGGCCGGCTAAACCCAGGAGTCACCCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAAACGTGACCCCACTGCCCTTCTCCCCAGGTCCCTCTGGCCTGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAAACGTGACCCCACTGCCCTTCTCCCCAGGTCCCTCTGGCCTGCATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGAGTCGGTCACCGCCCTGTGCTTCCTCCAAGAGACAGTGGAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGAGTCGGTCACCGCCCTGTGCTTCCTCCAAGAGACAGTGGAGAGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGTCAGTCCCCTGCCCAGGACACCCCAGTCCTGGGGCCTTGCTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100201 GGGTCAGTCCCCTGCCCAGGACACCCCGGTCCTGGGGCCTTGCTGGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGATGGCTCTGGGGACTCAGGGCCGCCTGCTGCTGGACAGGGATTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGATGGCTCTGGGGACTCAGGGCCGCCTGCTGCTGGACAGGGATTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACACACAGACCAGGATCAGCCAAAAGGGCCGCCGTCTGCAGCCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACACACAGACCAGGATCAGCCAAAAGGGCCGCCGTCTGCAGCCCCCGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACTCCCTCGGCCCCACCCCAGAGAAGGCCCCGGAAACAGCTGAACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACTCCCTCGGCCCCACCCCAGAGAAGGCCCCGGAAACAGCTGAACCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGGGGCACCGAGAGAGTGGACCCTGGGTTCGAGGGGGTGACTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCGGGGCACCGAGAGAGTGGACCCTGGGTTCGAGGGGGTGACTCTGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTCAGATAAAGCCGGACTCCAGCCTGCAGATCATCCCCACGTACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100451 TTTCAGATAAAGCCGGACTCCAGCCTGCAGATCATCCCCACGTACAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    498       CCTGCCCTGCAGTAGCCGTTCTCAGGAATCCCCTGCAGATGCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ...CAGCCTGCCCTGCAGTAGCCGTTCTCAGGAATCCCCTGCAGATGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTGGGGGCCCTGCAGCCCACCCAGGAGGCACCGAGGCCCACTCAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102774 TTGGGGGCCCTGCAGCCCACCCAGGAGGCACCGAGGCCCACTCAGCAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGCGAGGCCCTGG         AGCCCCGGCGCTGTGCTTCCTGTCGGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102824 AGCGAGGCCCTGGGTG...CAGAGCCCCGGCGCTGTGCTTCCTGTCGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAGAGGACCCCGCTCTGGAGAGACGCTGAAGATGGGACCCCTCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103227 CCAGAGGACCCCGCTCTGGAGAGACGCTGAAGATGGGACCCCTCTCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGCCTGTGGGATCAG         GTACAAGAAATACGGCACTCGCTGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103277 ACGCCTGTGGGATCAGGTC...TAGGTACAAGAAATACGGCACTCGCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCAGCTGCTGGCTGGTGCCCAGGAAAAATGTCCAGCCCAAGAGGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103499 TCCAGCTGCTGGCTGGTGCCCAGGAAAAATGTCCAGCCCAAGAGGCTATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGGCAGATGTGGAGTGTCCCTGGACCCCATTCAGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103549 TGGCAGATGTGGAGTGTCCCTGGACCCCATTCAGGAAGGT