seq1 = pF1KE1106.tfa, 285 bp
seq2 = pF1KE1106/gi568815581f_37591.tfa (gi568815581f:37591_238404), 200814 bp

>pF1KE1106 285
>gi568815581f:37591_238404 (Chr17)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-255  (100613-100812)   99% ->
256-285  (101320-101349)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGGAGCCGTGCCCTCCTGCTGGTGGCCCTCACCCTGTTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGGGAGCCGTGCCCTCCTGCTGGTGGCCCTCACCCTGTTCTGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCC         GGATGGCCACAGGGGAGGACAACGATGAGTTTTTCA
        |||||>>>...>>>|||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCGTG...CAGGGATGGCCACGGGGGAGGACAACGATGAGTTTTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGACTTCCTGCAAACACTACTGGTGGGGACCCCAGAGGAGCTCTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100649 TGGACTTCCTGCAAACACTACTGGTGGGGACCCCAGAGGAGCTCTATGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGACCTTGGGCAAGTACAATGTCAACGAAGATGCCAAGGCAGCAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 GGGACCTTGGGCAAGTACAATGTCAACGAAGATGCCAAGGCAGCAATGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAACTCAAGTCCTGCAGAGATGGCCTGCAGCCAATGCACAAGGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 TGAACTCAAGTCCTGCAGAGATGGCCTGCAGCCAATGCACAAGGCGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTCAAGCTGCTG         GTGCAAGTGCTGGGCAGTCAGGACGGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100799 TGGTCAAGCTGCTGGTA...CAGGTGCAAGTGCTGGGCAGTCAGGACGGT

    300 
    283 GCC
        |||
 101347 GCC