seq1 = pF1KE1104.tfa, 483 bp
seq2 = pF1KE1104/gi568815593r_135349457.tfa (gi568815593r:135349457_135549939), 200483 bp

>pF1KE1104 483
>gi568815593r:135349457_135549939 (Chr5)

(complement)

1-483  (100001-100483)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGCCCCTCACCGTCCTGCGAGTGAGCCTGTACCATCCCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGCCCCTCACCGTCCTGCGAGTGAGCCTGTACCATCCCACGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCCATCTGCCTTTGCCAATGTCCCACCACGGCTGCAGCATGATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCCATCTGCCTTTGCCAATGTCCCACCACGGCTGCAGCATGATACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCTCTGCTTCTCGGACGGGGGCAGGACGCCCACCTCCAGCTGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCCTCTGCTTCTCGGACGGGGGCAGGACGCCCACCTCCAGCTGCAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTCGCCTCTCCCGCCGTCACCTGTCCCTGGAGCCCTACCTGGAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTCGCCTCTCCCGCCGTCACCTGTCCCTGGAGCCCTACCTGGAGAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTGCCCTGCTGGCCTTCTGCCTCAAGGCCCTGAGCCGCAAGGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGTGCCCTGCTGGCCTTCTGCCTCAAGGCCCTGAGCCGCAAGGGCTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGGGTCAATGGGCTGACGCTGAGGTACCTGGAGCAGGTCCCCCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGGGTCAATGGGCTGACGCTGAGGTACCTGGAGCAGGTCCCCCTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCGTCAACAGGGTCTCCTTCTCAGGCATCCAGATGCTGGTTCGCGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCGTCAACAGGGTCTCCTTCTCAGGCATCCAGATGCTGGTTCGCGTAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGAAGGCACATCCCTGGAGGCTTTTGTCTGCTATTTCCATGTCAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAAGGCACATCCCTGGAGGCTTTTGTCTGCTATTTCCATGTCAGCCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACCCCTGATTTACAGACCTGAGGCTGAGGAAACTGACGAATGGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACCCCTGATTTACAGACCTGAGGCTGAGGAAACTGACGAATGGGAAGGC

    450     .    :    .    :    .    :
    451 ATCTCCCAGGGGCAGCCTCCCCCTGGTTCAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCTCCCAGGGGCAGCCTCCCCCTGGTTCAGGG