seq1 = pF1KE1103.tfa, 411 bp
seq2 = pF1KE1103/gi568815582f_29896311.tfa (gi568815582f:29896311_30101041), 204731 bp

>pF1KE1103 411
>gi568815582f:29896311_30101041 (Chr16)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-152  (100237-100307)   100% ->
153-205  (100498-100550)   100% ->
206-284  (104448-104526)   100% ->
285-396  (104619-104730)   100% ->
397-411  (104902-104916)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGGGCCGGCGGACGGCGAAGTGGACTACAAAAAAAAATACCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGGGCCGGCGGACGGCGAAGTGGACTACAAAAAAAAATACCGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGAAGCGGAAGCTCAAGTTCCTCATCTAC         GAGCACGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 TCTGAAGCGGAAGCTCAAGTTCCTCATCTACGTG...CAGGAGCACGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTTCCAGGAGGAGCTGAGGAAAGCGCAAAGGAAATTACTGAAGGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100247 GCTTCCAGGAGGAGCTGAGGAAAGCGCAAAGGAAATTACTGAAGGTGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGACAAGAG         TTTCCTCCTAGACCGACTTCTGCAGTACGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100297 CGGGACAAGAGGTG...CAGTTTCCTCCTAGACCGACTTCTGCAGTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAACGTGGATGAAGACTCTTCGG         ACTCAGATGCCACTGCAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100528 GAACGTGGATGAAGACTCTTCGGGTG...CAGACTCAGATGCCACTGCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CATCAGATAACAGCGAGACGGAGGGGACACCCAAGTTGTCTGACACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104466 CATCAGATAACAGCGAGACGGAGGGGACACCCAAGTTGTCTGACACACCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCCCCTAAGAG         GAAGAGAAGCCCTCCGCTGGGGGGCGCCCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104516 GCCCCTAAGAGGTG...CAGGAAGAGAAGCCCTCCGCTGGGGGGCGCCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CTCTCCCTCCAGCCTCTCCCTGCCTCCTTCAACAGGGTTTCCCCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104649 CTCTCCCTCCAGCCTCTCCCTGCCTCCTTCAACAGGGTTTCCCCTTCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCTCCGGGGTCCCCTCCCCATACCTGAGCTCG         GAACGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104699 CCTCCGGGGTCCCCTCCCCATACCTGAGCTCGGTG...TAGGAACGGGGC

    450     .
    406 CAGGCC
        ||||||
 104911 CAGGCC