seq1 = pF1KE1094.tfa, 2733 bp
seq2 = pF1KE1094/gi568815585r_108108536.tfa (gi568815585r:108108536_108311268), 202733 bp

>pF1KE1094 2733
>gi568815585r:108108536_108311268 (Chr13)

(complement)

1-2733  (100001-102733)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCTCACAAACTTCACAAACTGTTGCATCTCACGTTCCTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCTCACAAACTTCACAAACTGTTGCATCTCACGTTCCTTTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGATTTGTGTTCAACTTTAGAACGAATACAGAAAAGTAAAGGACGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGATTTGTGTTCAACTTTAGAACGAATACAGAAAAGTAAAGGACGTGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAAAATCAGACACTTCAGGGAATTTTTAGATTCTTGGAGAAAATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAAAATCAGACACTTCAGGGAATTTTTAGATTCTTGGAGAAAATTTCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGCTCTTCATAAGAACCACAAAGATGTCACAGACTCTTTTTATCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGCTCTTCATAAGAACCACAAAGATGTCACAGACTCTTTTTATCCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATGAGACTAATTCTTCCTCAGCTAGAAAGAGAGAGAATGGCCTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATGAGACTAATTCTTCCTCAGCTAGAAAGAGAGAGAATGGCCTATGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAAAGAAACTATGCTTGCTAAGCTTTATATTGAGTTGCTTAATTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTAAAGAAACTATGCTTGCTAAGCTTTATATTGAGTTGCTTAATTTACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGAGATGGAAAAGATGCCCTCAAACTTTTAAACTACAGAACACCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGAGATGGAAAAGATGCCCTCAAACTTTTAAACTACAGAACACCCACTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AACTCATGGAGATGCTGGAGACTTTGCAATGATTGCATATTTTGTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AACTCATGGAGATGCTGGAGACTTTGCAATGATTGCATATTTTGTGTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCCAAGATGTTTACAGAAAGGAAGTTTAACCATACAGCAAGTAAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCCAAGATGTTTACAGAAAGGAAGTTTAACCATACAGCAAGTAAACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTTTTAGACTCAATTGCCAGCAATAATTCTGCTAAAAGAAAAGACCTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTTTAGACTCAATTGCCAGCAATAATTCTGCTAAAAGAAAAGACCTAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAAAAGAGCCTTCTTCAACTTATAACTCAGAGTTCAGCACTTGAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAAAAGAGCCTTCTTCAACTTATAACTCAGAGTTCAGCACTTGAGCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTGGCTTATACGGATGATCATAAAGGATTTAAAGCTTGGTGTTAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTGGCTTATACGGATGATCATAAAGGATTTAAAGCTTGGTGTTAGTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAAACTATCTTTTCTGTTTTTCATAATGATGCTGCTGAGTTGCATAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAAACTATCTTTTCTGTTTTTCATAATGATGCTGCTGAGTTGCATAATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACTACAGATCTGGAAAAAGTCTGTAGGCAACTGCATGATCCTTCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACTACAGATCTGGAAAAAGTCTGTAGGCAACTGCATGATCCTTCTGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACTCAGTGATATTTCTATCACTTTATTTTCTGCATTTAAACCAATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GACTCAGTGATATTTCTATCACTTTATTTTCTGCATTTAAACCAATGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCTGCTATTGCAGATATTGAGCACATTGAGAAGGATATGAAACATCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCTGCTATTGCAGATATTGAGCACATTGAGAAGGATATGAAACATCAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTCTACATAGAAACCAAGCTAGATGGTGAACGTATGCAAATGCACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTCTACATAGAAACCAAGCTAGATGGTGAACGTATGCAAATGCACAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGGAGATGTATATAAATACTTCTCTCGAAATGGATATAACTACACTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATGGAGATGTATATAAATACTTCTCTCGAAATGGATATAACTACACTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGTTTGGTGCTTCTCCTACTGAAGGTTCTCTTACCCCATTCATTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGTTTGGTGCTTCTCCTACTGAAGGTTCTCTTACCCCATTCATTCATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCATTCAAAGCAGATATACAAATCTGTATTCTTGATGGTGAGATGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCATTCAAAGCAGATATACAAATCTGTATTCTTGATGGTGAGATGATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCTATAATCCTAATACACAAACTTTCATGCAAAAGGGAACTAAGTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCTATAATCCTAATACACAAACTTTCATGCAAAAGGGAACTAAGTTTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATTAAAAGAATGGTAGAGGATTCTGATCTGCAAACTTGTTATTGTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATTAAAAGAATGGTAGAGGATTCTGATCTGCAAACTTGTTATTGTGTTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGATGTATTGATGGTTAATAATAAAAAGCTAGGGCATGAGACTCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGATGTATTGATGGTTAATAATAAAAAGCTAGGGCATGAGACTCTGAGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAGGTATGAGATTCTTAGTAGTATTTTTACACCAATTCCAGGTAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAGGTATGAGATTCTTAGTAGTATTTTTACACCAATTCCAGGTAGAATA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAAATAGTGCAGAAAACACAAGCTCATACTAAGAATGAAGTAATTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GAAATAGTGCAGAAAACACAAGCTCATACTAAGAATGAAGTAATTGATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ATTGAATGAAGCAATAGATAAAAGAGAAGAGGGAATTATGGTAAAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ATTGAATGAAGCAATAGATAAAAGAGAAGAGGGAATTATGGTAAAACAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTCTATCCATCTACAAGCCAGACAAAAGAGGTGAAGGGTGGTTAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTCTATCCATCTACAAGCCAGACAAAAGAGGTGAAGGGTGGTTAAAAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAACCAGAGTATGTCAGTGGACTAATGGATGAATTGGACATTTTAATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAACCAGAGTATGTCAGTGGACTAATGGATGAATTGGACATTTTAATTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGAGGATATTGGGGTAAAGGATCACGGGGTGGAATGATGTCTCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGGAGGATATTGGGGTAAAGGATCACGGGGTGGAATGATGTCTCATTTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGTGTGCAGTAGCAGAGAAGCCCCCTCCTGGTGAGAAGCCATCTGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGTGTGCAGTAGCAGAGAAGCCCCCTCCTGGTGAGAAGCCATCTGTGTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CATACTCTCTCTCGTGTTGGGTCTGGCTGCACCATGAAAGAACTGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CATACTCTCTCTCGTGTTGGGTCTGGCTGCACCATGAAAGAACTGTATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCTGGGTTTGAAATTGGCCAAGTATTGGAAGCCTTTTCATAGAAAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCTGGGTTTGAAATTGGCCAAGTATTGGAAGCCTTTTCATAGAAAAGCTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CACCAAGCAGCATTTTATGTGGAACAGAGAAGCCAGAAGTATACATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CACCAAGCAGCATTTTATGTGGAACAGAGAAGCCAGAAGTATACATTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CCTTGTAATTCTGTCATTGTTCAGATTAAAGCAGCAGAGATCGTACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CCTTGTAATTCTGTCATTGTTCAGATTAAAGCAGCAGAGATCGTACCCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TGATATGTATAAAACTGGCTGCACCTTGCGTTTTCCACGAATTGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TGATATGTATAAAACTGGCTGCACCTTGCGTTTTCCACGAATTGAAAAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TAAGAGATGACAAGGAGTGGCATGAGTGCATGACCCTGGACGACCTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TAAGAGATGACAAGGAGTGGCATGAGTGCATGACCCTGGACGACCTAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CAACTTAGGGGGAAGGCATCTGGTAAGCTCGCATCTAAACACCTTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CAACTTAGGGGGAAGGCATCTGGTAAGCTCGCATCTAAACACCTTTATAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGGTGGTGATGATGAACCACAAGAAAAAAAGCGGAAAGCTGCCCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGGTGGTGATGATGAACCACAAGAAAAAAAGCGGAAAGCTGCCCCAAAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TGAAGAAAGTTATTGGAATTATTGAGCACTTAAAAGCACCTAACCTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TGAAGAAAGTTATTGGAATTATTGAGCACTTAAAAGCACCTAACCTTACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AACGTTAACAAAATTTCTAATATATTTGAAGATGTAGAGTTTTGTGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AACGTTAACAAAATTTCTAATATATTTGAAGATGTAGAGTTTTGTGTTAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GAGTGGAACAGATAGCCAGCCAAAGCCTGACCTGGAGAACAGAATTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GAGTGGAACAGATAGCCAGCCAAAGCCTGACCTGGAGAACAGAATTGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AATTTGGTGGTTATATAGTACAAAATCCAGGCCCAGACACGTACTGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AATTTGGTGGTTATATAGTACAAAATCCAGGCCCAGACACGTACTGTGTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 ATTGCAGGGTCTGAGAACATCAGAGTGAAAAACATAATTTTGTCAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 ATTGCAGGGTCTGAGAACATCAGAGTGAAAAACATAATTTTGTCAAATAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 ACATGATGTTGTCAAGCCTGCATGGCTTTTAGAATGTTTTAAGACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 ACATGATGTTGTCAAGCCTGCATGGCTTTTAGAATGTTTTAAGACCAAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GCTTTGTACCATGGCAGCCTCGCTTTATGATTCATATGTGCCCATCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GCTTTGTACCATGGCAGCCTCGCTTTATGATTCATATGTGCCCATCAACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 AAAGAACATTTTGCCCGTGAATATGATTGCTATGGTGATAGTTATTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 AAAGAACATTTTGCCCGTGAATATGATTGCTATGGTGATAGTTATTTCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 TGATACAGACTTGAACCAACTGAAGGAAGTATTCTCAGGAATTAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 TGATACAGACTTGAACCAACTGAAGGAAGTATTCTCAGGAATTAAAAATT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 CTAACGAGCAGACTCCTGAAGAAATGGCTTCTCTGATTGCTGATTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 CTAACGAGCAGACTCCTGAAGAAATGGCTTCTCTGATTGCTGATTTAGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 TATCGGTATTCCTGGGATTGCTCTCCTCTCAGTATGTTTCGACGCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 TATCGGTATTCCTGGGATTGCTCTCCTCTCAGTATGTTTCGACGCCACAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 CGTTTATTTGGACTCGTATGCTGTTATTAATGACCTGAGTACCAAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 CGTTTATTTGGACTCGTATGCTGTTATTAATGACCTGAGTACCAAAAATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 AGGGGACAAGGTTAGCTATTAAAGCCTTGGAGCTTCGGTTTCATGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 AGGGGACAAGGTTAGCTATTAAAGCCTTGGAGCTTCGGTTTCATGGAGCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 AAAGTAGTTTCTTGTTTAGCTGAGGGAGTGTCTCATGTAATAATTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 AAAGTAGTTTCTTGTTTAGCTGAGGGAGTGTCTCATGTAATAATTGGGGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 AGATCATAGTCGTGTTGCAGATTTTAAAGCTTTTAGAAGAACTTTTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 AGATCATAGTCGTGTTGCAGATTTTAAAGCTTTTAGAAGAACTTTTAAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 GAAAGTTTAAAATCCTAAAAGAAAGTTGGGTAACTGATTCAATAGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 GAAAGTTTAAAATCCTAAAAGAAAGTTGGGTAACTGATTCAATAGACAAG

   2700     .    :    .    :    .    :
   2701 TGTGAATTACAAGAAGAAAACCAGTATTTGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 TGTGAATTACAAGAAGAAAACCAGTATTTGATT