seq1 = pF1KE1072.tfa, 2313 bp
seq2 = pF1KE1072/gi568815595r_170367058.tfa (gi568815595r:170367058_170626936), 259879 bp

>pF1KE1072 2313
>gi568815595r:170367058_170626936 (Chr3)

(complement)

1-304  (100001-100304)   100% ->
305-541  (125592-125828)   100% ->
542-759  (128053-128270)   100% ->
760-906  (140569-140715)   100% ->
907-1115  (143415-143623)   100% ->
1116-1993  (145771-146648)   100% ->
1994-2313  (159560-159879)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGCTTCTTCACCTCGCTGGACCCCCGGCGGGTGCAGTGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGCTTCTTCACCTCGCTGGACCCCCGGCGGGTGCAGTGGGGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCTGGTATGCAATGCACTCCAGGATCCTACGCACCAAACCAGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCCTGGTATGCAATGCACTCCAGGATCCTACGCACCAAACCAGTGGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATGCTAGAGGGAACTGGGACCACCACGGCACATGGAACTAAGCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATGCTAGAGGGAACTGGGACCACCACGGCACATGGAACTAAGCTAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGTACTCACCACAGTGGACCTCATCTCTCTTGGCGTTGGCAGCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGTACTCACCACAGTGGACCTCATCTCTCTTGGCGTTGGCAGCTGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCACTGGCATGTATGTGGTCTCTGGCCTGGTGGCCAAGGAAATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCACTGGCATGTATGTGGTCTCTGGCCTGGTGGCCAAGGAAATGGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACCTGGTGTCATTGTGTCCTTCATCATTGCAGCCGTCGCATCCATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GACCTGGTGTCATTGTGTCCTTCATCATTGCAGCCGTCGCATCCATATTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCAG         GCGTCTGCTATGCAGAGTTTGGAGTTCGAGTCCCCAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCAGGTA...CAGGCGTCTGCTATGCAGAGTTTGGAGTTCGAGTCCCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GACCACAGGATCTGCCTACACCTACAGCTATGTCACTGTTGGGGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125629 GACCACAGGATCTGCCTACACCTACAGCTATGTCACTGTTGGGGAATTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGCATTTTTCATTGGCTGGAACCTGATCCTGGAGTACCTGATTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125679 TGGCATTTTTCATTGGCTGGAACCTGATCCTGGAGTACCTGATTGGCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCGGCCGGAGCCAGTGCTCTGAGCAGCATGTTTGACTCACTAGCCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125729 GCGGCCGGAGCCAGTGCTCTGAGCAGCATGTTTGACTCACTAGCCAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCATCAGCCGCTGGATGGCGGACAGCGTGGGAACCCTCAATGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125779 CACCATCAGCCGCTGGATGGCGGACAGCGTGGGAACCCTCAATGGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542          GGAAAGGTGAAGAATCATACCCAGACCTTCTGGCTCTGTTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125829 GTG...TAGGGAAAGGTGAAGAATCATACCCAGACCTTCTGGCTCTGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATCGCGGTCATCGTGACCATCATTGTTGCTCTGGGGGTGAAGAATTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128094 ATCGCGGTCATCGTGACCATCATTGTTGCTCTGGGGGTGAAGAATTCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AGGCTTCAACAATGTTCTCAATGTGCTGAACCTGGCAGTATGGGTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128144 AGGCTTCAACAATGTTCTCAATGTGCTGAACCTGGCAGTATGGGTGTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCATGATCGCAGGCCTCTTCTTCATCAATGGGAAATACTGGGCGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128194 TCATGATCGCAGGCCTCTTCTTCATCAATGGGAAATACTGGGCGGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAGTTCTTGCCCCACGGCTGGTCAGGG         GTGCTGCAAGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 128244 CAGTTCTTGCCCCACGGCTGGTCAGGGGTA...CAGGTGCTGCAAGGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGCAACATGCTTCTACGCTTTCATTGGCTTTGACATCATCGCCACCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140583 AGCAACATGCTTCTACGCTTTCATTGGCTTTGACATCATCGCCACCACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GAGAGGAAGCCAAGAATCCCAACACGTCCATCCCTTATGCTATCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140633 GAGAGGAAGCCAAGAATCCCAACACGTCCATCCCTTATGCTATCACTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCCCTGGTCATCTGCCTGACAGCATATGTGTCT         GTGAGCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 140683 TCCCTGGTCATCTGCCTGACAGCATATGTGTCTGTA...CAGGTGAGCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GATCTTAACTCTGATGGTGCCATATTATACCATTGACACGGAATCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143423 GATCTTAACTCTGATGGTGCCATATTATACCATTGACACGGAATCCCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCATGGAGATGTTTGTGGCTCATGGGTTCTATGCTGCCAAATTCGTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143473 TCATGGAGATGTTTGTGGCTCATGGGTTCTATGCTGCCAAATTCGTAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GCCATTGGGTCGGTTGCAGGACTGACAGTCAGCTTGCTGGGGTCCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143523 GCCATTGGGTCGGTTGCAGGACTGACAGTCAGCTTGCTGGGGTCCCTCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCCGATGCCGAGGGTCATTTATGCCATGGCTGGTGACGGGCTCCTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143573 CCCGATGCCGAGGGTCATTTATGCCATGGCTGGTGACGGGCTCCTTTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 G         GTTCCTGGCTCACGTCAGCTCCTACACAGAGACACCAGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143623 GGTA...CAGGTTCCTGGCTCACGTCAGCTCCTACACAGAGACACCAGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GTGGCCTGCATCGTGTCGGGGTTCCTGGCAGCGCTCCTCGCACTGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145811 GTGGCCTGCATCGTGTCGGGGTTCCTGGCAGCGCTCCTCGCACTGTTGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CAGCTTGAGAGACCTGATAGAGATGATGTCTATCGGCACGCTCCTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145861 CAGCTTGAGAGACCTGATAGAGATGATGTCTATCGGCACGCTCCTGGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACACCTTGGTCTCTGTCTGTGTCTTGCTCCTTCGATACCAACCTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145911 ACACCTTGGTCTCTGTCTGTGTCTTGCTCCTTCGATACCAACCTGAGAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GACATTGATGGTTTTGTCAAGTTCTTGTCTGAGGAGCACACCAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145961 GACATTGATGGTTTTGTCAAGTTCTTGTCTGAGGAGCACACCAAGAAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GGAGGGCATTCTGGCTGACTGTGAGAAGGAAGCTTGTTCTCCTGTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146011 GGAGGGCATTCTGGCTGACTGTGAGAAGGAAGCTTGTTCTCCTGTGAGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGGGGGATGAGTTTTCTGGCCCAGCCACCAACACATGTGGGGCCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146061 AGGGGGATGAGTTTTCTGGCCCAGCCACCAACACATGTGGGGCCAAGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TTACCATCCTTGGGAGACAATGAGATGCTCATAGGGAAATCAGACAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146111 TTACCATCCTTGGGAGACAATGAGATGCTCATAGGGAAATCAGACAAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AACCTACAACGTCAACCACCCCAATTACGGCACCGTGGACATGACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146161 AACCTACAACGTCAACCACCCCAATTACGGCACCGTGGACATGACCACAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 GCATAGAAGCTGATGAATCCGAAAATATTTATCTCATCAAGTTAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146211 GCATAGAAGCTGATGAATCCGAAAATATTTATCTCATCAAGTTAAAGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CTGATTGGGCCTCATTATTACACCATGAGAATCCGGCTGGGCCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146261 CTGATTGGGCCTCATTATTACACCATGAGAATCCGGCTGGGCCTTCCAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 CAAAATGGACCGGCCCACAGCAGCGACGGGGCACACGGTGACCATCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146311 CAAAATGGACCGGCCCACAGCAGCGACGGGGCACACGGTGACCATCTGCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TGCTCCTGCTCTTCATCCTCATGTTCATCTTCTGCTCCTTCATCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146361 TGCTCCTGCTCTTCATCCTCATGTTCATCTTCTGCTCCTTCATCATCTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1756 GGTTCTGACTACATCTCAGAGCAGAGCTGGTGGGCCATCCTTCTGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146411 GGTTCTGACTACATCTCAGAGCAGAGCTGGTGGGCCATCCTTCTGGTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1806 TCTGATGGTGCTGCTGATCAGCACCCTGGTGTTTGTGATCCTGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146461 TCTGATGGTGCTGCTGATCAGCACCCTGGTGTTTGTGATCCTGCAGCAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 CAGAGAACCCCAAGAAGCTGCCCTACATGGCCCCTTGCCTCCCCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146511 CAGAGAACCCCAAGAAGCTGCCCTACATGGCCCCTTGCCTCCCCTTTGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 CCTGCCTTTGCCATGCTGGTGAACATCTATCTCATGCTAAAGCTCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146561 CCTGCCTTTGCCATGCTGGTGAACATCTATCTCATGCTAAAGCTCTCCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CATCACATGGATCCGGTTTGCGGTCTGGTGCTTTGTGG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 146611 CATCACATGGATCCGGTTTGCGGTCTGGTGCTTTGTGGGTA...CAGGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1997 TGCTCATTTATTTTGGATATGGCATCTGGAACAGCACCCTGGAAATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159563 TGCTCATTTATTTTGGATATGGCATCTGGAACAGCACCCTGGAAATCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GCTCGAGAAGAGGCCCTGCACCAAAGCACGTACCAACGCTACGACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159613 GCTCGAGAAGAGGCCCTGCACCAAAGCACGTACCAACGCTACGACGTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 TGACCCCTTCTCAGTGGAGGAGGGTTTCTCCTACGCCACAGAGGGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159663 TGACCCCTTCTCAGTGGAGGAGGGTTTCTCCTACGCCACAGAGGGCGAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 GCCAGGAGGACTGGGGCGGGCCCACTGAAGACAAAGGCTTCTATTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159713 GCCAGGAGGACTGGGGCGGGCCCACTGAAGACAAAGGCTTCTATTACCAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 CAGATGTCAGATGCGAAGGCAAACGGCCGGACAAGTAGCAAAGCGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159763 CAGATGTCAGATGCGAAGGCAAACGGCCGGACAAGTAGCAAAGCGAAGAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2247 CAAAAGCAAACACAAACAGAACTCAGAGGCCCTGATTGCAAATGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159813 CAAAAGCAAACACAAACAGAACTCAGAGGCCCTGATTGCAAATGATGAGT

   2350     .    :    .
   2297 TAGATTACTCTCCAGAG
        |||||||||||||||||
 159863 TAGATTACTCTCCAGAG