seq1 = pF1KE1063.tfa, 1743 bp seq2 = pF1KE1063/gi568815575r_46399846.tfa (gi568815575r:46399846_46628912), 229067 bp >pF1KE1063 1743 >gi568815575r:46399846_46628912 (ChrX) (complement) 4-142 (99994-100130) 97% -> 143-253 (100468-100578) 100% -> 254-1743 (127578-129067) 100% 0 . : . : . : . : . : 4 GCCATGTCCCAGGAATCATTGACCTTCAAGGACGTGTTTGTGGACTTCAC ||| |-| |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99994 GCCGT TAC AGGAATCATTGACCTTCAAGGACGTGTTTGTGGACTTCAC 50 . : . : . : . : . : 54 CCTGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACTCTGCCCAGAAGAACCTCTACAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100042 CCTGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACTCTGCCCAGAAGAACCTCTACAGGG 100 . : . : . : . : . : 104 ATGTCATGCTTGAGAACTACAGCCACCTGGTGTCCGTGG GG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 100092 ATGTCATGCTTGAGAACTACAGCCACCTGGTGTCCGTGGGTG...CAGGG 150 . : . : . : . : . : 145 CATCTAGTTGGGAAGCCAGATGTGATCTTCAGGTTGGGACCAGGTGACGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100470 CATCTAGTTGGGAAGCCAGATGTGATCTTCAGGTTGGGACCAGGTGACGA 200 . : . : . : . : . : 195 GTCCTGGATGGCAGATGGAGGGACCCCGGTACGGACCTGTGCAGGTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100520 GTCCTGGATGGCAGATGGAGGGACCCCGGTACGGACCTGTGCAGGTGAGG 250 . : . : . : . : . : 245 ACAGGCCAG AAGTCTGGGAAGTTGACGAGCAGATAGATCAC |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 100570 ACAGGCCAGGTG...TAGAAGTCTGGGAAGTTGACGAGCAGATAGATCAC 300 . : . : . : . : . : 286 TACAAGGAAAGCCAAGACAAATTTCTGTGGCAAGCTGCATTCATAGGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127610 TACAAGGAAAGCCAAGACAAATTTCTGTGGCAAGCTGCATTCATAGGCAA 350 . : . : . : . : . : 336 GGAAACACTGAAGGATGAAAGTGGTCAAGAATGTAAAATATGTAGAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127660 GGAAACACTGAAGGATGAAAGTGGTCAAGAATGTAAAATATGTAGAAAAA 400 . : . : . : . : . : 386 TCATTTATCTCAACACAGACTTTGTTTCTGTAAAACAAAGACTCCCTAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127710 TCATTTATCTCAACACAGACTTTGTTTCTGTAAAACAAAGACTCCCTAAA 450 . : . : . : . : . : 436 TATTATTCATGGGAAAGGTGTTCAAAACATCATTTAAACTTTCTTGGTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127760 TATTATTCATGGGAAAGGTGTTCAAAACATCATTTAAACTTTCTTGGTCA 500 . : . : . : . : . : 486 AAATAGAAGCTATGTAAGAAAGAAAGATGATGGATGTAAGGCATATTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127810 AAATAGAAGCTATGTAAGAAAGAAAGATGATGGATGTAAGGCATATTGGA 550 . : . : . : . : . : 536 AAGTATGCCTCCATTATAATCTTCATAAAGCTCAACCTGCAGAGAGATTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127860 AAGTATGCCTCCATTATAATCTTCATAAAGCTCAACCTGCAGAGAGATTT 600 . : . : . : . : . : 586 TTTGACCCTAATCAACGAGGGAAAGCCCTCCACCAAAAGCAAGCCCTTAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127910 TTTGACCCTAATCAACGAGGGAAAGCCCTCCACCAAAAGCAAGCCCTTAG 650 . : . : . : . : . : 636 AAAAAGTCAGAGAAGTCAAACTGGGGAGAAACTCTACAAATGTACTGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 127960 AAAAAGTCAGAGAAGTCAAACTGGGGAGAAACTCTACAAATGTACTGAAT 700 . : . : . : . : . : 686 GTGGAAAAGTGTTTATCCAGAAAGCAAACTTAGTTGTACATCAAAGAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128010 GTGGAAAAGTGTTTATCCAGAAAGCAAACTTAGTTGTACATCAAAGAACT 750 . : . : . : . : . : 736 CACACCGGAGAGAAACCTTATGAATGCTGCGAATGTGCAAAAGCCTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128060 CACACCGGAGAGAAACCTTATGAATGCTGCGAATGTGCAAAAGCCTTCAG 800 . : . : . : . : . : 786 CCAGAAGTCAACCCTCATAGCACACCAGAGAACTCACACAGGGGAGAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128110 CCAGAAGTCAACCCTCATAGCACACCAGAGAACTCACACAGGGGAGAAGC 850 . : . : . : . : . : 836 CCTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAACCTTTATCCAGAAGTCAACTCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128160 CCTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAAACCTTTATCCAGAAGTCAACTCTG 900 . : . : . : . : . : 886 ATTAAACATCAACGAACTCATACAGGAGAGAAACCATTTGTATGTGACAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128210 ATTAAACATCAACGAACTCATACAGGAGAGAAACCATTTGTATGTGACAA 950 . : . : . : . : . : 936 ATGTCCAAAAGCCTTTAAGAGTTCATATCATCTTATTAGACATGAAAAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128260 ATGTCCAAAAGCCTTTAAGAGTTCATATCATCTTATTAGACATGAAAAAA 1000 . : . : . : . : . : 986 CACACATTAGACAAGCATTTTATAAAGGTATTAAATGTACTACGTCCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128310 CACACATTAGACAAGCATTTTATAAAGGTATTAAATGTACTACGTCCAGC 1050 . : . : . : . : . : 1036 CTTATATATCAAAGAATTCACACAAGTGAGAAACCTCAGTGCAGTGAACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128360 CTTATATATCAAAGAATTCACACAAGTGAGAAACCTCAGTGCAGTGAACA 1100 . : . : . : . : . : 1086 TGGGAAAGCCTCTGATGAGAAGCCCAGTCCCACTAAACATTGGAGAACTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128410 TGGGAAAGCCTCTGATGAGAAGCCCAGTCCCACTAAACATTGGAGAACTC 1150 . : . : . : . : . : 1136 ATACAAAAGAGAACATTTATGAGTGTAGTAAATGTGGGAAAAGCTTCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128460 ATACAAAAGAGAACATTTATGAGTGTAGTAAATGTGGGAAAAGCTTCAGA 1200 . : . : . : . : . : 1186 GGAAAGTCACACCTCTCTGTTCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128510 GGAAAGTCACACCTCTCTGTTCATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAAACC 1250 . : . : . : . : . : 1236 CTATGAATGTAGTATATGTGGGAAGACTTTCAGTGGAAAGTCACACCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128560 CTATGAATGTAGTATATGTGGGAAGACTTTCAGTGGAAAGTCACACCTCT 1300 . : . : . : . : . : 1286 CTGTCCATCATAGAACTCATACAGGAGAGAAACCTTATGAATGCAGAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128610 CTGTCCATCATAGAACTCATACAGGAGAGAAACCTTATGAATGCAGAAGA 1350 . : . : . : . : . : 1336 TGTGGGAAAGCCTTTGGGGAGAAGTCAACCCTTATTGTACATCAGAGAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128660 TGTGGGAAAGCCTTTGGGGAGAAGTCAACCCTTATTGTACATCAGAGAAT 1400 . : . : . : . : . : 1386 GCATACAGGAGAGAAACCCTATAAATGCAACGAATGTGGGAAAGCCTTTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128710 GCATACAGGAGAGAAACCCTATAAATGCAACGAATGTGGGAAAGCCTTTA 1450 . : . : . : . : . : 1436 GTGAGAAGTCACCACTGATTAAACATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128760 GTGAGAAGTCACCACTGATTAAACATCAGAGAATTCATACAGGAGAGAGA 1500 . : . : . : . : . : 1486 CCCTATGAATGCACTGACTGTAAAAAAGCCTTCAGTAGGAAGTCAACTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128810 CCCTATGAATGCACTGACTGTAAAAAAGCCTTCAGTAGGAAGTCAACTCT 1550 . : . : . : . : . : 1536 CATCAAACATCAGAGAATTCATACAGGAGAAAAACCTTACAAATGTAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128860 CATCAAACATCAGAGAATTCATACAGGAGAAAAACCTTACAAATGTAGTG 1600 . : . : . : . : . : 1586 AATGTGGGAAGGCCTTCAGTGTGAAATCAACTCTCATTGTGCATCACAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128910 AATGTGGGAAGGCCTTCAGTGTGAAATCAACTCTCATTGTGCATCACAGA 1650 . : . : . : . : . : 1636 ACTCATACAGGAGAGAAACCTTATGAATGCAGAGACTGTGGGAAAGCATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 128960 ACTCATACAGGAGAGAAACCTTATGAATGCAGAGACTGTGGGAAAGCATT 1700 . : . : . : . : . : 1686 CAGTGGGAAGTCAACTCTCATTAAACATCAGAGAAGTCACACAGGAGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129010 CAGTGGGAAGTCAACTCTCATTAAACATCAGAGAAGTCACACAGGAGATA 1750 . 1736 AAAACCTA |||||||| 129060 AAAACCTA