seq1 = pF1KE1061.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE1061/gi568815596r_218976384.tfa (gi568815596r:218976384_219258362), 281979 bp

>pF1KE1061 897
>gi568815596r:218976384_219258362 (Chr2)

(complement)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-390  (100679-100891)   100% ->
391-529  (110568-110706)   100% ->
530-588  (111625-111683)   100% ->
589-706  (180157-180274)   100% ->
707-825  (180999-181117)   100% ->
826-897  (181908-181979)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAACTGGAGCAAGGCCTGTTGATGCAGCCATGGGCGTGGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAACTGGAGCAAGGCCTGTTGATGCAGCCATGGGCGTGGCTACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTGCAGAGAACTCCCTCTTGGCCAAGGTTTTTATCACCAAGCAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTGCAGAGAACTCCCTCTTGGCCAAGGTTTTTATCACCAAGCAGGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGCCTTGTTGGTTTCAGATCTTCAACAGGTGTGGCATGAACAGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGCCTTGTTGGTTTCAGATCTTCAACAGGTGTGGCATGAACAGGTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTAGTGTGGTCAGCCAGCGAGCCAAG         GAGCTGAACAAGCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 ACTAGTGTGGTCAGCCAGCGAGCCAAGGTA...TAGGAGCTGAACAAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCACTGCTCCTCCTGCAGCTTTCCTCTGTCATTTGGATAATCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 GCTCACTGCTCCTCCTGCAGCTTTCCTCTGTCATTTGGATAATCTCCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCCATTGTTGAAGGACGCTGCTCACCCTAGCGAAGCTACCTTCTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 GCCCATTGTTGAAGGACGCTGCTCACCCTAGCGAAGCTACCTTCTCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GATTGTGTGGCAGATGCACTGATTCTACGGGTGCGAAGTGAGCTCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 GATTGTGTGGCAGATGCACTGATTCTACGGGTGCGAAGTGAGCTCTCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCCCCTTCTATTGGAATTTCCACTGCATGCTAGCTAGTCCTTCCCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100843 CCTCCCCTTCTATTGGAATTTCCACTGCATGCTAGCTAGTCCTTCCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    391         GTCTCCCAACATTTGATTCGTCCTCTGATGGGCATGAGTCTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100893 TA...AAGGTCTCCCAACATTTGATTCGTCCTCTGATGGGCATGAGTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCATTACAGTGCCAAGTGAGGGAGCTAGCAACGTTACTTCATATGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110610 GCATTACAGTGCCAAGTGAGGGAGCTAGCAACGTTACTTCATATGAAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTAGAGATCCAAGACTACCAGGAGAGTGGGGCTACGCTGATTCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 110660 CCTAGAGATCCAAGACTACCAGGAGAGTGGGGCTACGCTGATTCGAGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    530       ATCGATTGAAGACAGAACCATTTGAAGAAAATTCCTTCTTGGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110710 ...CAGATCGATTGAAGACAGAACCATTTGAAGAAAATTCCTTCTTGGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAATTTATGATAGAG         AAACTGCCAGAGGCATGCAGCATTGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111669 CAATTTATGATAGAGGTA...CAGAAACTGCCAGAGGCATGCAGCATTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGATGGAAAGCCCTTTGTCATGAATCTGCAGGATCTGTATATGGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180183 TGATGGAAAGCCCTTTGTCATGAATCTGCAGGATCTGTATATGGCAGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCACACAAGAGGTCCAAGTGGGACAGAAGCATCAAGGCGCTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 180233 CCACACAAGAGGTCCAAGTGGGACAGAAGCATCAAGGCGCTGGTG...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    707  GAGATCCTCATACCTCAAACAGTGCTTCCCTGCAAGGAATCGATAGCCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180998 GGAGATCCTCATACCTCAAACAGTGCTTCCCTGCAAGGAATCGATAGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATGTGTAAACCAGCCAGAACAACTGGTCTCCTCAGCCCCAACCCTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181048 ATGTGTAAACCAGCCAGAACAACTGGTCTCCTCAGCCCCAACCCTCTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CACCTGAGAAAGAGTCCACG         GGTACTTCAGGCCCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 181098 CACCTGAGAAAGAGTCCACGGTG...TAGGGTACTTCAGGCCCTCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AGACCTCAGCTGTCAAAGGTCAAGAGGAAGAAGCCAAGGGGTCTCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181929 AGACCTCAGCTGTCAAAGGTCAAGAGGAAGAAGCCAAGGGGTCTCTTCAG

    950 
    897 T
        |
 181979 T