seq1 = pF1KE1047.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE1047/gi568815584r_103598801.tfa (gi568815584r:103598801_103811087), 212287 bp

>pF1KE1047 1038
>gi568815584r:103598801_103811087 (Chr14)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-193  (102429-102566)   100% ->
194-406  (103873-104085)   100% ->
407-561  (107761-107915)   100% ->
562-774  (111512-111724)   100% ->
775-821  (111909-111955)   100% ->
822-1038  (112071-112287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTTGGATCTACTGGACCTGAATCCCAGAATTATTGCTGCAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTTGGATCTACTGGACCTGAATCCCAGAATTATTGCTGCAATTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAG         CCAAACTGAAATCGGTAAAGGAGGTTTTACACTTTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAAGGTA...CAGCCAAACTGAAATCGGTAAAGGAGGTTTTACACTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGGACCAGACTTGAAGAGACTGACCAACCTCTCCAGCCCCGAGGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102465 CTGGACCAGACTTGAAGAGACTGACCAACCTCTCCAGCCCCGAGGTCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACTTGCTGAGAACGGCCTCCTTACACTTGCGGGGAAGCAGCATCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102515 CACTTGCTGAGAACGGCCTCCTTACACTTGCGGGGAAGCAGCATCCTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AG         CACTGCAGCTGCACCAGCAGAAGGAGCGGTTCCCCACGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102565 AGGTA...TAGCACTGCAGCTGCACCAGCAGAAGGAGCGGTTCCCCACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGCACCAGCGCCTGAGCCTGGGCTGCCCGGTGCTGGACGCGCTGCTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103912 AGCACCAGCGCCTGAGCCTGGGCTGCCCGGTGCTGGACGCGCTGCTCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTGGCCTGCCCCTGGACGGCATCACTGAGCTGGCCGGACGCAGCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103962 GGTGGCCTGCCCCTGGACGGCATCACTGAGCTGGCCGGACGCAGCTCGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGGGAAGACCCAGCTGGCGCTGCAGCTCTGCCTGGCTGTGCAGTTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104012 AGGGAAGACCCAGCTGGCGCTGCAGCTCTGCCTGGCTGTGCAGTTCCCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCAGCACGGAGGCCTGGAGGCTG         GAGCCGTCTACATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104062 GGCAGCACGGAGGCCTGGAGGCTGGTG...CAGGAGCCGTCTACATCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGAAGACGCCTTCCCGCACAAGCGCCTGCAGCAGCTCATGGCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107778 ACGGAAGACGCCTTCCCGCACAAGCGCCTGCAGCAGCTCATGGCCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCGCGGCTGCGCACTGACGTTCCAGGAGAGCTGCTTCAGAAGCTCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107828 GCCGCGGCTGCGCACTGACGTTCCAGGAGAGCTGCTTCAGAAGCTCCGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGGCAGCCAGATCTTCATCGAGCACGTGGCCGATGTG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107878 TTGGCAGCCAGATCTTCATCGAGCACGTGGCCGATGTGGTG...CAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCTTGTTGGAGTGTGTGAATAAGAAGGTCCCCGTACTGCTGTCTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111515 ACCTTGTTGGAGTGTGTGAATAAGAAGGTCCCCGTACTGCTGTCTCGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATGGCTCGCCTGGTGGTCATCGACTCGGTGGCAGCCCCATTCCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111565 CATGGCTCGCCTGGTGGTCATCGACTCGGTGGCAGCCCCATTCCGCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AATTTGACAGCCAGGCCTCCGCCCCCAGGGCCAGGCATCTGCAGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111615 AATTTGACAGCCAGGCCTCCGCCCCCAGGGCCAGGCATCTGCAGTCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGGGCCACGCTGCGTGAGCTGAGCAGTGCCTTCCAGAGCCCTGTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111665 GGGGCCACGCTGCGTGAGCTGAGCAGTGCCTTCCAGAGCCCTGTGCTGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATCAACCAG         GTGACAGAGGCCATGGAGGAGCAGGGCGCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 111715 CATCAACCAGGTG...CAGGTGACAGAGGCCATGGAGGAGCAGGGCGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CACACGGGCCGCTGGG         GTTCTGGGACGAACGTGTTTCCCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 111940 CACACGGGCCGCTGGGGTG...CAGGTTCTGGGACGAACGTGTTTCCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCCCTTGGCATAACCTGGGCTAACCAGCTCCTGGTGAGACTGCTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112096 GCCCTTGGCATAACCTGGGCTAACCAGCTCCTGGTGAGACTGCTGGCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCGGCTCCGCGAGGAAGAGGCTGCCCTCGGCTGCCCAGCCCGGACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112146 CCGGCTCCGCGAGGAAGAGGCTGCCCTCGGCTGCCCAGCCCGGACCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGGTGCTCTCTGCCCCCCACCTGCCCCCCTCCTCCTGTTCCTACACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112196 GGGTGCTCTCTGCCCCCCACCTGCCCCCCTCCTCCTGTTCCTACACGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGTGCCGAAGGGGTGCGAGGGACACCTGGGACCCAGTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112246 AGTGCCGAAGGGGTGCGAGGGACACCTGGGACCCAGTCCCAC