seq1 = pF1KE1027.tfa, 3105 bp
seq2 = pF1KE1027/gi568815591r_100581722.tfa (gi568815591r:100581722_100788111), 206390 bp

>pF1KE1027 3105
>gi568815591r:100581722_100788111 (Chr7)

(complement)

1-35  (99874-99908)   100% ->
36-165  (100002-100131)   100% ->
166-261  (100229-100324)   100% ->
262-373  (100496-100607)   100% ->
374-482  (100706-100814)   100% ->
483-523  (101066-101106)   100% ->
524-694  (101293-101463)   100% ->
695-948  (101679-101932)   100% ->
949-1054  (102033-102138)   100% ->
1055-1192  (102631-102768)   100% ->
1193-1290  (102966-103063)   100% ->
1291-1462  (103218-103389)   100% ->
1463-1629  (103496-103662)   100% ->
1630-1730  (103775-103875)   100% ->
1731-1868  (103955-104092)   100% ->
1869-1969  (104194-104294)   100% ->
1970-2052  (104480-104562)   100% ->
2053-2193  (104668-104808)   100% ->
2194-2412  (104882-105100)   100% ->
2413-2600  (105335-105522)   100% ->
2601-2761  (105630-105790)   100% ->
2762-2925  (105877-106040)   100% ->
2926-3055  (106119-106248)   100% ->
3056-3105  (106341-106390)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCAGAGACACTCAACTTTGGGCCTGAGTG         GCTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  99874 ATGGCAGCAGAGACACTCAACTTTGGGCCTGAGTGGTG...CAGGCTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCCCTGTCCGGGGGCGGCAGCGTGGCCTCCCCACCCCCGTCCCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100008 GGCCCTGTCCGGGGGCGGCAGCGTGGCCTCCCCACCCCCGTCCCCTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCCCAAATACAAGCTGGCTGACTACCGTTATGGGCGAGAGGAAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100058 TGCCCAAATACAAGCTGGCTGACTACCGTTATGGGCGAGAGGAAATGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTCTCTACGTCAAGGAGAACAAG         GTCCCGGAAGAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100108 GCTCTCTACGTCAAGGAGAACAAGGTG...CAGGTCCCGGAAGAGCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACAAGGAGTTCGCCGCGGTGCTGCAGGACGAGCCACTGCAGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100246 GGACAAGGAGTTCGCCGCGGTGCTGCAGGACGAGCCACTGCAGCCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCTGGAGCCGCTGACTGAGGAGGAACAG         AGAAACTTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100296 CTCTGGAGCCGCTGACTGAGGAGGAACAGGTG...CAGAGAAACTTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGTCAGTGAACAGCGTGGCTGTGCTGAGGCTGATGGGGAAAGGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100508 CTGTCAGTGAACAGCGTGGCTGTGCTGAGGCTGATGGGGAAAGGGGCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCCCCCCCTGGCTGGCACCTCCCGAGGCAGGGGCAGCACGCGGAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100558 CCCCCCCCTGGCTGGCACCTCCCGAGGCAGGGGCAGCACGCGGAGCCGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374          GCCGCGGCCGTGGTGACAGCTGCTTTTACCAAAGAAGCATC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100608 GTA...TAGGCCGCGGCCGTGGTGACAGCTGCTTTTACCAAAGAAGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAGAAGGCGATGGGGCCTTTGGACGAAGCCCCCGGGAAATCCAGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100747 GAAGAAGGCGATGGGGCCTTTGGACGAAGCCCCCGGGAAATCCAGCGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGAGCTGGGATGACAG         AGGCGAGAGGCGGTTTGAGAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100797 CCAGAGCTGGGATGACAGGTG...CAGAGGCGAGAGGCGGTTTGAGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGCAAGGCGGGATGGAG         CACGATGTGGCTTTGAGGAGGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101089 CAGCAAGGCGGGATGGAGGTA...CAGCACGATGTGGCTTTGAGGAGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GGGGCTGGCCCAAGGAAGGAGCACGCCCGCTCAGACAGCGAGAACTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 GGGGCTGGCCCAAGGAAGGAGCACGCCCGCTCAGACAGCGAGAACTGGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCCCTACGGGAGGAACAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCAGCTGGAGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101366 CTCCCTACGGGAGGAACAGGAGGAGGAGGAGGAGGGCAGCTGGAGGCTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGCAGGGCCCCGGCGAGACGGCGACCGCTGGCGCTCCGCCAGCCCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101416 GAGCAGGGCCCCGGCGAGACGGCGACCGCTGGCGCTCCGCCAGCCCTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695        ATGGTGGTCCCCGCTCTGCTGGCTGGCGGGAACATGGGGAACG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101466 G...CAGATGGTGGTCCCCGCTCTGCTGGCTGGCGGGAACATGGGGAACG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCGGCGCAAGTTTGAATTTGATTTGCGAGGGGATCGAGGAGGGTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101722 GCGGCGCAAGTTTGAATTTGATTTGCGAGGGGATCGAGGAGGGTGTGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAGAGGAGGGGCGGGGAGGGGGAGGCAGCTCTCACCTGCGGCGGTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101772 AAGAGGAGGGGCGGGGAGGGGGAGGCAGCTCTCACCTGCGGCGGTGCCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCGCCTGAAGGCTTTGAGGAGGACAAGGATGGGCTCCCAGAGTGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101822 GCGCCTGAAGGCTTTGAGGAGGACAAGGATGGGCTCCCAGAGTGGTGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGACGATGAGGATGAAGAAATGGGCACCTTTGATGCCTCTGGGGCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101872 GGACGATGAGGATGAAGAAATGGGCACCTTTGATGCCTCTGGGGCCTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGCCTCTCAAG         AAGGGCCCCAAGGAGCCCATTCCTGAGGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101922 TGCCTCTCAAGGTA...CAGAAGGGCCCCAAGGAGCCCATTCCTGAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CAGGAGCTGGACTTCCAAGGGTTGGAGGAGGAGGAGGAACCTTCCGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102063 CAGGAGCTGGACTTCCAAGGGTTGGAGGAGGAGGAGGAACCTTCCGAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCTAGAGGAGGAAGGGCCTGAGGCAG         GTGGGAAAGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102113 GCTAGAGGAGGAAGGGCCTGAGGCAGGTG...TAGGTGGGAAAGAGCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCCCACTGCCTCCTCAGGAGGAGAAGTCCAGCTCCCCATCCCCACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102646 CCCCACTGCCTCCTCAGGAGGAGAAGTCCAGCTCCCCATCCCCACTGCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACCCTGGGCCCACTCTGGGGGACAAACGGGGATGGGGACGAAACTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102696 ACCCTGGGCCCACTCTGGGGGACAAACGGGGATGGGGACGAAACTGCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAAAGAGCCCCCAGCGGCCGAAG         ATGATATTCGGGGGATCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102746 GAAAGAGCCCCCAGCGGCCGAAGGTA...CAGATGATATTCGGGGGATCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGCTGAGTCCCGGGGTGGGCTCCTCTGCTGGCCCACCCGGAGATCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102984 AGCTGAGTCCCGGGGTGGGCTCCTCTGCTGGCCCACCCGGAGATCTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GATGATGAAGGCTTGAAGCACCTGCAGCAG         GAGGCGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103034 GATGATGAAGGCTTGAAGCACCTGCAGCAGGTG...CAGGAGGCGGAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GCTGGTGGCCTCCCTGCAGGACAGCTCCTTGGAGGAGGAGCAGTTCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103229 GCTGGTGGCCTCCCTGCAGGACAGCTCCTTGGAGGAGGAGCAGTTCACGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTGCCATGCAGACCCAGGGCCTGCGCCACTCTGCAGCCGCCACTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103279 CTGCCATGCAGACCCAGGGCCTGCGCCACTCTGCAGCCGCCACTGCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCGCTCAGCCATGGGGCTGCCCGGAAGTGGTTCTACAAGGACCCACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103329 CCGCTCAGCCATGGGGCTGCCCGGAAGTGGTTCTACAAGGACCCACAGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CGAGATCCAAG         GCCCCTTCACGACACAGGAGATGGCAGAGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 CGAGATCCAAGGTA...CAGGCCCCTTCACGACACAGGAGATGGCAGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 GGTTCCAGGCCGGCTACTTTTCCATGTCACTGCTGGTGAAGCGGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 GGTTCCAGGCCGGCTACTTTTCCATGTCACTGCTGGTGAAGCGGGGCTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GATGAGGGCTTCCAGCCGCTGGGCGAGGTGATCAAGATGTGGGGCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103576 GATGAGGGCTTCCAGCCGCTGGGCGAGGTGATCAAGATGTGGGGCCGCGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCCCTTTGCCCCAGGGCCCTCACCTCCCCCACTGCTG         GGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103626 GCCCTTTGCCCCAGGGCCCTCACCTCCCCCACTGCTGGTG...CAGGGAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACATGGACCAGGAGCGGCTGAAGAAGCAACAGGAGCTGGCCGCGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103779 ACATGGACCAGGAGCGGCTGAAGAAGCAACAGGAGCTGGCCGCGGCGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTGTACCAGCAGCTGCAGCACCAGCAGTTTCTCCAGCTGGTCAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103829 TTGTACCAGCAGCTGCAGCACCAGCAGTTTCTCCAGCTGGTCAGCAGGTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1731       CCGCCAGCTCCCACAGTGCGCGCTCCGAGAAAAGGCAGCTCTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103879 ...CAGCCGCCAGCTCCCACAGTGCGCGCTCCGAGAAAAGGCAGCTCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GGGACCTGACACCGCCACCACCGCCGCCGCCACAGCAGCAGCAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103999 GGGACCTGACACCGCCACCACCGCCGCCGCCACAGCAGCAGCAGCAGCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTCACGGCATTCCTGCAGCAGCTCCAGGCGCTCAAACCCCCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104049 CTCACGGCATTCCTGCAGCAGCTCCAGGCGCTCAAACCCCCCAGGTG...

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1869    AGGCGGGGACCAGAACCTGCTCCCGACGATGAGCCGGTCCTTGTCGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104191 CAGAGGCGGGGACCAGAACCTGCTCCCGACGATGAGCCGGTCCTTGTCGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 TGCCAGATTCGGGCCGCCTCTGGGACGTACATACCTCAGCCTCATCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104241 TGCCAGATTCGGGCCGCCTCTGGGACGTACATACCTCAGCCTCATCACAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 TCAG         GTGGTGAGGCCAGTCTTTGGGACATACCAATTAACTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104291 TCAGGTG...CAGGTGGTGAGGCCAGTCTTTGGGACATACCAATTAACTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 TTCGACTCAGGGTCCAATTCTAGAACAACTCCAGCTGCAACATAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104517 TTCGACTCAGGGTCCAATTCTAGAACAACTCCAGCTGCAACATAAAGTG.

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2053      TTCCAGGAGCGCAGAGAAGTGGAGCTCAGGGCGAAGCGGGAGGAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104567 ..CAGTTCCAGGAGCGCAGAGAAGTGGAGCTCAGGGCGAAGCGGGAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGGAACGCAAGCGTCGAGAGGAGAAGCGCCGCCAGCAGCAGCAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104713 GAGGAACGCAAGCGTCGAGAGGAGAAGCGCCGCCAGCAGCAGCAGGAGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GCAGAAGCGGCGGCAGGAGGAGGAAGAGCTGTTTCGGCGCAAGCAC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104763 GCAGAAGCGGCGGCAGGAGGAGGAAGAGCTGTTTCGGCGCAAGCACGTG.

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2194      GTGCGGCAGCAGGAGCTATTGCTGAAGTTGCTACAGCAGCAGCAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104813 ..TAGGTGCGGCAGCAGGAGCTATTGCTGAAGTTGCTACAGCAGCAGCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GCGGTCCCTGTGCCCCCCGCACCCAGCTCCCCGCCCCCACTCTGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104927 GCGGTCCCTGTGCCCCCCGCACCCAGCTCCCCGCCCCCACTCTGGGCTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CCTGGCCAAGCAGGGGCTGTCCATGAAGACGCTCCTGGAGTTGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104977 CCTGGCCAAGCAGGGGCTGTCCATGAAGACGCTCCTGGAGTTGCAGCTGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AGGGCGAGCGGCAGCTGCACAAACAGCCCCCACCTCGGGAGCCAGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105027 AGGGCGAGCGGCAGCTGCACAAACAGCCCCCACCTCGGGAGCCAGCTCGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GCCCAGGCCCCCAACCACCGAGTG         CAGCTTGGGGGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105077 GCCCAGGCCCCCAACCACCGAGTGGTG...TAGCAGCTTGGGGGCCTGGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 CACTGCCCCCCTGAACCAGTGGGTGTCTGAGGCTGGGCCACTGTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105352 CACTGCCCCCCTGAACCAGTGGGTGTCTGAGGCTGGGCCACTGTGGGGCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GGCCAGACAAGAGTGGGGGCGGCAGCAGCGGCCTGGGGCTCTGGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105402 GGCCAGACAAGAGTGGGGGCGGCAGCAGCGGCCTGGGGCTCTGGGAGGAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 ACCCCCAAGAGCGGCGGGAGCCTGGTCCGTGGCCTCGGCCTGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105452 ACCCCCAAGAGCGGCGGGAGCCTGGTCCGTGGCCTCGGCCTGAAGAACAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 CCGGAGCAGCCCATCTCTCAG         TGACTCATACAGCCACCTAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105502 CCGGAGCAGCCCATCTCTCAGGTG...CAGTGACTCATACAGCCACCTAT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 CGGGTCGGCCCATTCGCAAAAAGACGGAGGAAGAAGAGAAGCTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105650 CGGGTCGGCCCATTCGCAAAAAGACGGAGGAAGAAGAGAAGCTGCTGAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 CTGCTGCAGGGCATTCCCAGGCCCCAGGACGGCTTCACCCAGTGGTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105700 CTGCTGCAGGGCATTCCCAGGCCCCAGGACGGCTTCACCCAGTGGTGCGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GCAGATGCTGCACACGCTGAGCGCCACGGGCAGCCTGGACG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105750 GCAGATGCTGCACACGCTGAGCGCCACGGGCAGCCTGGACGGTG...CAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 TGCCCATGGCTGTAGCGATCCTCAAGGAGGTGGAATCCCCCTATGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105877 TGCCCATGGCTGTAGCGATCCTCAAGGAGGTGGAATCCCCCTATGATGTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 CACGATTATATCCGTTCCTGCCTGGGGGACACGCTGGAAGCCAAAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105927 CACGATTATATCCGTTCCTGCCTGGGGGACACGCTGGAAGCCAAAGAATT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 TGCCAAACAATTCCTGGAGCGGAGGGCCAAGCAGAAAGCCAGCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105977 TGCCAAACAATTCCTGGAGCGGAGGGCCAAGCAGAAAGCCAGCCAGCAGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 GGCAGCAGCAGCAG         GAGGCATGGCTGAGCAGCGCCTCGCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 106027 GGCAGCAGCAGCAGGTG...TAGGAGGCATGGCTGAGCAGCGCCTCGCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 CAGACGGCCTTCCAGGCCAACCACAGCACCAAACTCGGCCCCGGGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106146 CAGACGGCCTTCCAGGCCAACCACAGCACCAAACTCGGCCCCGGGGAGGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 CAGCAAGGCCAAGAGGCGGGCACTGATGCTGCACTCAGACCCCAGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106196 CAGCAAGGCCAAGAGGCGGGCACTGATGCTGCACTCAGACCCCAGCATCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 TGG         GGTACTCCCTGCACGGATCTTCTGGTGAGATCGAGAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 TGGGTG...CAGGGTACTCCCTGCACGGATCTTCTGGTGAGATCGAGAGC

   3300     .    :
   3094 GTGGATGACTAC
        ||||||||||||
 106379 GTGGATGACTAC