seq1 = pF1KE0993.tfa, 1935 bp seq2 = pF1KE0993/gi568815595f_130929709.tfa (gi568815595f:130929709_131449773), 520065 bp >pF1KE0993 1935 >gi568815595f:130929709_131449773 (Chr3) 1-170 (100001-100170) 100% -> 171-336 (150715-150880) 100% -> 337-455 (180095-180213) 100% -> 456-520 (203037-203101) 100% -> 521-647 (204122-204248) 100% -> 648-797 (222680-222829) 100% -> 798-876 (222923-223001) 100% -> 877-962 (225328-225413) 100% -> 963-1082 (232700-232819) 100% -> 1083-1176 (235718-235811) 100% -> 1177-1284 (239122-239229) 100% -> 1285-1399 (241065-241179) 100% -> 1400-1560 (298820-298980) 100% -> 1561-1621 (313728-313788) 100% -> 1622-1718 (343770-343866) 100% -> 1719-1935 (419849-420065) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGCTGAAATTCCAAGAGGCAGCTAAGTGTGTGAGTGGATCAACAGCCAT 50 . : . : . : . : . : 51 TTCCACTTATCCAAAGACCTTGATTGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TTCCACTTATCCAAAGACCTTGATTGCAAGAAGATACGTGCTTCAACAAA 100 . : . : . : . : . : 101 AACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 AACTTGGCAGTGGAAGTTTTGGAACTGTCTATCTGGTTTCAGACAAGAAA 150 . : . : . : . : . : 151 GCCAAACGAGGAGAGGAATT AAAGGTACTTAAGGAAATATC ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 100151 GCCAAACGAGGAGAGGAATTGTA...CAGAAAGGTACTTAAGGAAATATC 200 . : . : . : . : . : 192 TGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTACAGGCCAATTTGGAAGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150736 TGTTGGAGAACTAAATCCAAATGAAACTGTACAGGCCAATTTGGAAGCCC 250 . : . : . : . : . : 242 AACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150786 AACTCCTCTCCAAGCTGGACCACCCAGCCATTGTCAAGTTCCATGCAAGT 300 . : . : . : . : . : 292 TTTGTGGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 150836 TTTGTGGAGCAAGATAATTTCTGCATTATCACGGAGTACTGTGAGGTG.. 350 . : . : . : . : . : 337 GGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAA .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150886 .CAGGGCCGAGATCTGGACGATAAAATTCAGGAATATAAACAAGCTGGAA 400 . : . : . : . : . : 383 AAATCTTTCCAGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 180141 AAATCTTTCCAGAAAATCAAATAATAGAATGGTTTATCCAGCTGCTGCTG 450 . : . : . : . : . : 433 GGAGTTGACTACATGCATGAGAG GAGGATACTTCATCGAGA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 180191 GGAGTTGACTACATGCATGAGAGGTA...TAGGAGGATACTTCATCGAGA 500 . : . : . : . : . : 474 CTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 203055 CTTAAAGTCAAAGAATGTATTTCTGAAAAATAATCTCCTTAAAATTGGTA 550 . : . : . : . : . : 521 GAGATTTTGGAGTTTCTCGACTTCTAATGGGATCCTGTGACCTG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 203105 ...AAGGAGATTTTGGAGTTTCTCGACTTCTAATGGGATCCTGTGACCTG 600 . : . : . : . : . : 565 GCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 204166 GCCACAACTTTAACTGGAACTCCCCATTATATGAGTCCTGAGGCTCTGAA 650 . : . : . : . : . : 615 ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTG GTCACTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 204216 ACACCAAGGCTATGACACAAAGTCGGACATCTGGTG...CAGGTCACTGG 700 . : . : . : . : . : 656 CATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATCATGCATTCGCTGGCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222688 CATGCATTTTGTATGAGATGTGCTGCATGAATCATGCATTCGCTGGCTCC 750 . : . : . : . : . : 706 AATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222738 AATTTCTTATCCATTGTTTTAAAAATTGTTGAAGGTGACACACCTTCTCT 800 . : . : . : . : . : 756 CCCTGAGAGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 222788 CCCTGAGAGATATCCAAAAGAACTAAATGCCATCATGGAAAGGTA...CA 850 . : . : . : . : . : 798 CATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTATCGAAATTTTA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 222922 GCATGTTGAACAAGAATCCTTCATTAAGACCATCTGCTATCGAAATTTTA 900 . : . : . : . : . : 847 AAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAG AACCTAATGTG ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 222972 AAAATCCCTTACCTTGATGAGCAGCTACAGGTA...CAGAACCTAATGTG 950 . : . : . : . : . : 888 TAGATATTCAGAAATGACTCTGGAAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 225339 TAGATATTCAGAAATGACTCTGGAAGACAAAAATTTGGATTGTCAGAAGG 1000 . : . : . : . : . : 938 AGGCTGCTCATATAATTAATGCCAT GCAAAAAAGGATCCAC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 225389 AGGCTGCTCATATAATTAATGCCATGTA...TAGGCAAAAAAGGATCCAC 1050 . : . : . : . : . : 979 CTGCAGACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232716 CTGCAGACTCTGAGGGCACTGTCAGAAGTACAGAAAATGACGCCAAGAGA 1100 . : . : . : . : . : 1029 AAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGCTGATGAGAAAGCCAGGAAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232766 AAGGATGCGGCTGAGGAAGCTCCAGGCGGCTGATGAGAAAGCCAGGAAGC 1150 . : . : . : . : . : 1079 TGAA AAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAA ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 232816 TGAAGTA...CAGAAAGATTGTGGAAGAAAAATATGAAGAAAATAGCAAA 1200 . : . : . : . : . : 1120 CGAATGCAAGAATTGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 235755 CGAATGCAAGAATTGAGATCTCGGAACTTTCAGCAGCTGAGTGTTGATGT 1250 . : . : . : . : . : 1170 ACTCCAT GAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAAAAGG |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 235805 ACTCCATGTA...TAGGAAAAAACACATTTAAAAGGAATGGAAGAAAAGG 1300 . : . : . : . : . : 1211 AGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 239156 AGGAGCAACCTGAGGGAAGACTTTCTTGTTCACCCCAGGACGAGGATGAA 1350 . : . : . : . : . : 1261 GAGAGGTGGCAAGGCAGGGAAGAG GAATCTGATGAACCAAC ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 239206 GAGAGGTGGCAAGGCAGGGAAGAGGCA...AAGGAATCTGATGAACCAAC 1400 . : . : . : . : . : 1302 TTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 241082 TTTAGAGAACCTGCCTGAGTCTCAGCCTATTCCTTCCATGGACCTCCACG 1450 . : . : . : . : . : 1352 AACTTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 241132 AACTTGAATCAATTGTAGAGGATGCCACATCTGACCTTGGATACCATGGT 1500 . : . : . : . : . : 1400 AGATCCCAGAAGACCCACTTGTGGCTGAAGAGTACTACGCTGA >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 241182 A...CAGAGATCCCAGAAGACCCACTTGTGGCTGAAGAGTACTACGCTGA 1550 . : . : . : . : . : 1443 TGCATTTGATTCCTATTGTGAAGAGAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAATAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 298863 TGCATTTGATTCCTATTGTGAAGAGAGTGATGAGGAGGAAGAAGAAATAG 1600 . : . : . : . : . : 1493 CGTTAGAAAGACCAGAGAAAGAAATCAGGAATGAGGGATCCCAGCCTGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 298913 CGTTAGAAAGACCAGAGAAAGAAATCAGGAATGAGGGATCCCAGCCTGCT 1650 . : . : . : . : . : 1543 TACAGAACAAACCAACAG GACAGTGATATCGAAGCGTTGGC ||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 298963 TACAGAACAAACCAACAGGTA...CAGGACAGTGATATCGAAGCGTTGGC 1700 . : . : . : . : . : 1584 CAGGTGTTTGGAAAATGTCCTGGGTTGCACTTCTCTAG ACA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 313751 CAGGTGTTTGGAAAATGTCCTGGGTTGCACTTCTCTAGGTG...CAGACA 1750 . : . : . : . : . : 1625 CAAAGACCATCACCACCATGGCTGAAGACATGTCCCCAGGACCACCAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 343773 CAAAGACCATCACCACCATGGCTGAAGACATGTCCCCAGGACCACCAATT 1800 . : . : . : . : . : 1675 TTCAACAGTGTGATGGCCAGGACCAAGATGAAACGCATGAGGGA ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>... 343823 TTCAACAGTGTGATGGCCAGGACCAAGATGAAACGCATGAGGGAGTA... 1850 . : . : . : . : . : 1719 ATCAGCCATGCAGAAGCTGGGGACAGAAGTATTTGAAGAGGTCTATA >>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 419846 CAGATCAGCCATGCAGAAGCTGGGGACAGAAGTATTTGAAGAGGTCTATA 1900 . : . : . : . : . : 1766 ATTACCTCAAGAGAGCAAGGCATCAGAATGCTAGCGAAGCAGAGATCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 419896 ATTACCTCAAGAGAGCAAGGCATCAGAATGCTAGCGAAGCAGAGATCCGC 1950 . : . : . : . : . : 1816 GAGTGTTTGGAAAAAGTGGTGCCTCAAGCCAGCGACTGTTTTGAAGTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 419946 GAGTGTTTGGAAAAAGTGGTGCCTCAAGCCAGCGACTGTTTTGAAGTGGA 2000 . : . : . : . : . : 1866 CCAGCTCCTGTACTTTGAAGAGCAGTTGCTGATCACGATGGGAAAAGAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 419996 CCAGCTCCTGTACTTTGAAGAGCAGTTGCTGATCACGATGGGAAAAGAAC 2050 . : . : 1916 CTACTCTCCAGAACCATCTC |||||||||||||||||||| 420046 CTACTCTCCAGAACCATCTC