seq1 = pF1KE0952.tfa, 1422 bp
seq2 = pF1KE0952/gi568815579r_49879097.tfa (gi568815579r:49879097_50116162), 237066 bp

>pF1KE0952 1422
>gi568815579r:49879097_50116162 (Chr19)

(complement)

1-139  (100001-100139)   100% ->
140-289  (106778-106927)   100% ->
290-547  (108337-108594)   100% ->
548-612  (115309-115373)   100% ->
613-679  (118593-118659)   100% ->
680-764  (120888-120972)   100% ->
765-870  (121244-121349)   100% ->
871-963  (123211-123303)   100% ->
964-1096  (126392-126524)   100% ->
1097-1217  (127671-127791)   100% ->
1218-1276  (135150-135208)   100% ->
1277-1422  (136921-137066)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCTCCTTCTGTCCAGACTGTGGCAAAAGTATCCAAGCGGCATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCTCCTTCTGTCCAGACTGTGGCAAAAGTATCCAAGCGGCATTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTCTGCCCCTACTGTGGAAATTCTTTGCCTGTAGAGGAGCATGTAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTCTGCCCCTACTGTGGAAATTCTTTGCCTGTAGAGGAGCATGTAGGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGACCTTTGTCAATCCACATGTGTCATCCTTCCAAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100101 CCCAGACCTTTGTCAATCCACATGTGTCATCCTTCCAAGGTA...TAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAAGAGAGGGCTGAACTCCAGTTTTGAAACCTCTCCTAAGAAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106780 TCAAAGAGAGGGCTGAACTCCAGTTTTGAAACCTCTCCTAAGAAAGTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATGGTCCAGCACCGTCACCTCTCCCCGATTATCCCTCTTCTCAGATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106830 ATGGTCCAGCACCGTCACCTCTCCCCGATTATCCCTCTTCTCAGATGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAGTTCTGAGTCTGAAGATACTCTGAGTTCCTCTGAGAGATCCAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106880 ACAGTTCTGAGTCTGAAGATACTCTGAGTTCCTCTGAGAGATCCAAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        GCTCCGGGAGCAGACCCCCAACCCCCAAAAGCAGCCCTCAGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106930 A...CAGGCTCCGGGAGCAGACCCCCAACCCCCAAAAGCAGCCCTCAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACCAGGAAGAGCCCTCAGGTGACCAGGGGTAGCCCTCAGAAGACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108380 GACCAGGAAGAGCCCTCAGGTGACCAGGGGTAGCCCTCAGAAGACCAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTAGCCCTCAGAAGACCAGGCAGAGCCCTCAGACGCTGAAGCGGAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108430 GTAGCCCTCAGAAGACCAGGCAGAGCCCTCAGACGCTGAAGCGGAGCCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGACCACCTCACTTGAAGCTTTGCCCACAGGGACAGTGCTGACAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108480 GTGACCACCTCACTTGAAGCTTTGCCCACAGGGACAGTGCTGACAGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGTGGGCGACAGTGGAAGCTGAAGTCCTTCCAGACCAGGGACAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108530 GAGTGGGCGACAGTGGAAGCTGAAGTCCTTCCAGACCAGGGACAACCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCATTCTCTATGAAG         CTGCACCCACCTCCACCCTCACCTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108580 GCATTCTCTATGAAGGTA...CAGCTGCACCCACCTCCACCCTCACCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACTCAGGACCACAGAAGCAAAAGTTCTCACTCAAACTG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 115335 GACTCAGGACCACAGAAGCAAAAGTTCTCACTCAAACTGGTA...CAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCCAAGGATGGGCGCTTGTTCAATGAGCAGAACTTCTTCCAGCGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118595 TGCCAAGGATGGGCGCTTGTTCAATGAGCAGAACTTCTTCCAGCGGGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAAGCCTCTGCAAG         TCAACAAGTGGAAGAAGCTGTACTCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 118645 CCAAGCCTCTGCAAGGTA...CAGTCAACAAGTGGAAGAAGCTGTACTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCCCACTGCTGGCCATCCCTACCTGCATGGGTTTCGGTGTTCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120914 ACCCCACTGCTGGCCATCCCTACCTGCATGGGTTTCGGTGTTCACCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAATACAG         GTTCTTGGTGTTACCCAGCCTGGGGAGGAGCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120964 CAAATACAGGTG...CAGGTTCTTGGTGTTACCCAGCCTGGGGAGGAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTCAGTCGGCCCTGGATGTCAGCCCAAAGCATGTGCTGTCAGAGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121276 TTCAGTCGGCCCTGGATGTCAGCCCAAAGCATGTGCTGTCAGAGAGGTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTGCTGCAGGTGGCCTGCCGGCTG         CTGGATGCCCTGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 121326 GTGCTGCAGGTGGCCTGCCGGCTGGTG...CAGCTGGATGCCCTGGAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTCCATGAGAATGAGTATGTTCATGGAAATGTGACAGCTGAAAATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123228 CCTCCATGAGAATGAGTATGTTCATGGAAATGTGACAGCTGAAAATATCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTGTGGATCCAGAGGACCAGAGTCAG         GTGACTTTGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 123278 TTGTGGATCCAGAGGACCAGAGTCAGGTA...CAGGTGACTTTGGCAGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TATGGCTTCGCCTTCCGCTATTGCCCAAGTGGCAAACACGTGGCCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126407 TATGGCTTCGCCTTCCGCTATTGCCCAAGTGGCAAACACGTGGCCTACGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGAAGGCAGCAGGAGCCCTCACGAGGGGGACCTTGAGTTCATTAGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126457 GGAAGGCAGCAGGAGCCCTCACGAGGGGGACCTTGAGTTCATTAGCATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ACCTGCACAAGGGATGCG         GGCCCTCCCGCCGCAGCGACCTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 126507 ACCTGCACAAGGGATGCGGTA...CAGGGCCCTCCCGCCGCAGCGACCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAGAGCCTGGGCTACTGCATGCTGAAGTGGCTCTACGGGTTTCTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127694 CAGAGCCTGGGCTACTGCATGCTGAAGTGGCTCTACGGGTTTCTGCCATG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GACAAATTGCCTTCCCAACACTGAGGACATCATGAAGCAAAAACAGAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 127744 GACAAATTGCCTTCCCAACACTGAGGACATCATGAAGCAAAAACAGAAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1218        GTTTGTTGATAAGCCGGGGCCCTTCGTGGGACCCTGCGGTCAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127794 G...CAGGTTTGTTGATAAGCCGGGGCCCTTCGTGGGACCCTGCGGTCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TGGATCAGGCCCTCAG         AGACCCTGCAGAAGTACCTGAAGGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 135193 TGGATCAGGCCCTCAGGTA...CAGAGACCCTGCAGAAGTACCTGAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGTGATGGCCCTCACGTATGAGGAGAAGCCGCCCTACGCCATGCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136946 GGTGATGGCCCTCACGTATGAGGAGAAGCCGCCCTACGCCATGCTGAGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACAACCTAGAAGCTTTGCTGCAGGATCTGCGTGTGTCTCCATATGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136996 ACAACCTAGAAGCTTTGCTGCAGGATCTGCGTGTGTCTCCATATGACCCC

   1500     .    :    .    :
   1402 ATTGGCCTCCCGATGGTGCCC
        |||||||||||||||||||||
 137046 ATTGGCCTCCCGATGGTGCCC