seq1 = pF1KE0935.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KE0935/gi568815579r_36348980.tfa (gi568815579r:36348980_36573461), 224482 bp

>pF1KE0935 1254
>gi568815579r:36348980_36573461 (Chr19)

(complement)

1-136  (99994-100130)   97% ->
137-232  (100456-100551)   100% ->
233-1254  (123461-124482)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTC AGGAGTCAGTGATGTTCAGTGATGTGTCCGTAGACTTCTCTC
        || | ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 ATTGTTCCAGGAGTCAGTGATGTTCAGTGATGTGTCCGTAGACTTCTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 AGGAGGAGTGGGAATGCCTGAATGATGATCAGAGAGATTTATACAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 AGGAGGAGTGGGAATGCCTGAATGATGATCAGAGAGATTTATACAGAGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 GTGATGTTGGAGAATTACAGCAACCTGGTTTCAATGG         GGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100094 GTGATGTTGGAGAATTACAGCAACCTGGTTTCAATGGGTA...CAGGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 TTCTATTTCTAAACCAAATGTGATCTCCTACTTGGAGCAAGGGAAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100460 TTCTATTTCTAAACCAAATGTGATCTCCTACTTGGAGCAAGGGAAGGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 CCTGGTTGGCTGACAGAGAGCTAACAAGAGGCCAGTGGCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100510 CCTGGTTGGCTGACAGAGAGCTAACAAGAGGCCAGTGGCCAGGTA...CA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233  TCCTGGAATCAAGATGTGAGACCAAGAAATTATTTCTGAAGAAAGAAAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123460 GTCCTGGAATCAAGATGTGAGACCAAGAAATTATTTCTGAAGAAAGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282 TTATGAAATAGAATCAACCCAGTGGGAAATAATGGAAAAACTCACAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123510 TTATGAAATAGAATCAACCCAGTGGGAAATAATGGAAAAACTCACAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332 GTGATTTTCAGTGCTCCAGTTTCAGAGATGATTGGGAATGTAATAGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 123560 GTGATTTTCAGTGCTCCAGTTTCAGAGATGATTGGGAATGTAATCGGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    382 TTTAAGAAAGAACTCGGCTCTCAGGGGGGACATTTCAATCAATTGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123610 TTTAAGAAAGAACTCGGCTCTCAGGGGGGACATTTCAATCAATTGGTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    432 CACTCATGAAGATCTGCCCACTTTGAGTCACCATCCATCCTTCACATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123660 CACTCATGAAGATCTGCCCACTTTGAGTCACCATCCATCCTTCACATTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    482 AGCAAATCATTAACAGTAAAAAGAAATTCTGTGCATCTAAAGAATATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123710 AGCAAATCATTAACAGTAAAAAGAAATTCTGTGCATCTAAAGAATATAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532 AAAACCTTTAGACATGGCTCACAGTTTGCTACACATGAGATAATTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123760 AAAACCTTTAGACATGGCTCACAGTTTGCTACACATGAGATAATTCATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    582 CATTGAGAAGCCTTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAGTCCTTTAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123810 CATTGAGAAGCCTTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAGTCCTTTAGACATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    632 CCTCAAGACTCACTCATCATCAGAAAATTCATACTGGCAAGAAACCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123860 CCTCAAGACTCACTCATCATCAGAAAATTCATACTGGCAAGAAACCCTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682 GAATGTAAGGAATGTGGAAAAACCTTTATTTGTGGCTCAGACCTTACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123910 GAATGTAAGGAATGTGGAAAAACCTTTATTTGTGGCTCAGACCTTACTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 ACATCACAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123960 ACATCACAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    782 GGAAAGCCTTTAGTAGTGGTTCAAACTTCACTCGACATCAGAGAATTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124010 GGAAAGCCTTTAGTAGTGGTTCAAACTTCACTCGACATCAGAGAATTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832 ACAGGTGAGAAGCCTTATGAATGCAAAGAATGCGGGAAGGCCTTTAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124060 ACAGGTGAGAAGCCTTATGAATGCAAAGAATGCGGGAAGGCCTTTAGTAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    882 TGGCTCAAACTTTACTCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124110 TGGCTCAAACTTTACTCAACATCAGAGAATTCATACTGGGGAAAAACCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932 ATGAATGTAAGGAATGTGGCAATGCCTTTAGTCAGAGCTCACAACTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124160 ATGAATGTAAGGAATGTGGCAATGCCTTTAGTCAGAGCTCACAACTTATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    982 AAACATCAAAGAATCCATACAGGTGAGAAACCTTACGAATGTAAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124210 AAACATCAAAGAATCCATACAGGTGAGAAACCTTACGAATGTAAGGAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032 TGAAAAGGCTTTTCGTTCTGGCTCAGACCTTACTAGACATCAGAGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124260 TGAAAAGGCTTTTCGTTCTGGCTCAGACCTTACTAGACATCAGAGAATTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1082 ATACTGGGGAGAAACCCTATGAATGTAAGATATGTGGGAAGGCTTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124310 ATACTGGGGAGAAACCCTATGAATGTAAGATATGTGGGAAGGCTTATTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1132 CAGAGTTCACAGCTTATTAGTCATCATAGAATTCATACTAGTGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124360 CAGAGTTCACAGCTTATTAGTCATCATAGAATTCATACTAGTGAGAAACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1182 CTATGAATATAGGGAATGTGGAAAGAACTTTAATTATGACCCACAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124410 CTATGAATATAGGGAATGTGGAAAGAACTTTAATTATGACCCACAACTTA

   1250     .    :    .    :
   1232 TTCAGCATCAAAATTTGTACTGG
        |||||||||||||||||||||||
 124460 TTCAGCATCAAAATTTGTACTGG