seq1 = pF1KE0908.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KE0908/gi568815587r_67265139.tfa (gi568815587r:67265139_67467629), 202491 bp

>pF1KE0908 675
>gi568815587r:67265139_67467629 (Chr11)

(complement)

6-183  (99993-100170)   98% ->
184-675  (102000-102491)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CCT CCGAGCAGGGGACTCGTGGGGGATGTTAGCGTGCCTGTGCACGGTG
        |||-|| |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 CCTGCCCA CAGGGGACTCGTGGGGGATGTTAGCGTGCCTGTGCACGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     55 CTCTGGCACCTCCCTGCAGTGCCAGCTCTCAATCGCACAGGGGACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100042 CTCTGGCACCTCCCTGCAGTGCCAGCTCTCAATCGCACAGGGGACCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    105 GCCTGGCCCCTCCATCCAGAAAACCTATGACCTCACCCGCTACCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100092 GCCTGGCCCCTCCATCCAGAAAACCTATGACCTCACCCGCTACCTGGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    155 ACCAACTCCGCAGCTTGGCTGGGACCTAT         CTGAACTACCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100142 ACCAACTCCGCAGCTTGGCTGGGACCTATGTG...CAGCTGAACTACCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196 GGCCCCCCTTTCAACGAGCCAGACTTCAACCCTCCCCGCCTGGGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102012 GGCCCCCCTTTCAACGAGCCAGACTTCAACCCTCCCCGCCTGGGGGCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    246 GACTCTGCCCAGGGCCACTGTTGACTTGGAGGTGTGGCGAAGCCTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102062 GACTCTGCCCAGGGCCACTGTTGACTTGGAGGTGTGGCGAAGCCTCAATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    296 ACAAACTGCGGCTGACCCAGAACTACGAGGCCTACAGCCACCTTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 ACAAACTGCGGCTGACCCAGAACTACGAGGCCTACAGCCACCTTCTGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    346 TACTTGCGTGGCCTCAACCGTCAGGCTGCCACTGCTGAGCTGCGCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102162 TACTTGCGTGGCCTCAACCGTCAGGCTGCCACTGCTGAGCTGCGCCGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    396 CCTGGCCCACTTCTGCACCAGCCTCCAGGGCCTGCTGGGCAGCATTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102212 CCTGGCCCACTTCTGCACCAGCCTCCAGGGCCTGCTGGGCAGCATTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    446 GCGTCATGGCAGCTCTGGGCTACCCACTGCCCCAGCCGCTGCCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 GCGTCATGGCAGCTCTGGGCTACCCACTGCCCCAGCCGCTGCCTGGGACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    496 GAACCCACTTGGACTCCTGGCCCTGCCCACAGTGACTTCCTCCAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102312 GAACCCACTTGGACTCCTGGCCCTGCCCACAGTGACTTCCTCCAGAAGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546 GGACGACTTCTGGCTGCTGAAGGAGCTGCAGACCTGGCTGTGGCGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102362 GGACGACTTCTGGCTGCTGAAGGAGCTGCAGACCTGGCTGTGGCGCTCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    596 CCAAGGACTTCAACCGGCTCAAGAAGAAGATGCAGCCTCCAGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102412 CCAAGGACTTCAACCGGCTCAAGAAGAAGATGCAGCCTCCAGCAGCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :
    646 GTCACCCTGCACCTGGGGGCTCATGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 102462 GTCACCCTGCACCTGGGGGCTCATGGCTTC