seq1 = pF1KE0895.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KE0895/gi568815579f_8993245.tfa (gi568815579f:8993245_9194183), 200939 bp

>pF1KE0895 939
>gi568815579f:8993245_9194183 (Chr19)

1-939  (100001-100939)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACCAAGAAACCAAACCAGTGCATCTCAATTCATCCTCCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACCAAGAAACCAAACCAGTGCATCTCAATTCATCCTCCTGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGAAAAGCCAGAGCAGGAGACGCTTCTCTTTTCCCTGTTCTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGAAAAGCCAGAGCAGGAGACGCTTCTCTTTTCCCTGTTCTTCTGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGTCATGGTCGTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGTCATGGTCGTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATAGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGGCCAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATAGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGGCCAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGTTGATTTCTGTCTGGCCACCAACACCATCCCTAAGATGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGTTGATTTCTGTCTGGCCACCAACACCATCCCTAAGATGCTGGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTTCAAACCGGGAGCAAGGCCATCTCTTATCCCTGCTGCCTGATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTTCAAACCGGGAGCAAGGCCATCTCTTATCCCTGCTGCCTGATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTACTTCTTCCATTTCTTTGGCATCGTGGACAGCGTCATAATCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTACTTCTTCCATTTCTTTGGCATCGTGGACAGCGTCATAATCGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCTTATGACCGGTTCGTGGCCATCTGCCACCCGTTGCACTACGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100351 GATGGCTTATGACCGGTTCGTGGCCATCTGCCACCCATTGCACTACGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGATCATGAGCCTACGCCTCTGTCGCCTGCTGGTCGGCGCCCTCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGATCATGAGCCTACGCCTCTGTCGCCTGCTGGTCGGCGCCCTCTGGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTTCCTGCTTCATCTCACTCACTCACATCCTCCTGATGGCCCGTCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTTCCTGCTTCATCTCACTCACTCACATCCTCCTGATGGCCCGTCTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGCGGCAGCCATGAGGTGCCTCACTACTTCTGCGACCTCACTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGCGGCAGCCATGAGGTGCCTCACTACTTCTGCGACCTCACTCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTCCGACTTTCGTGCACGGACACCTCTGTGAATAGGATCTTCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTCCGACTTTCGTGCACGGACACCTCTGTGAATAGGATCTTCATCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTGTGGCAGGGATGGTGATAGCCACGCCCTTTGTCTGCATCCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTGTGGCAGGGATGGTGATAGCCACGCCCTTTGTCTGCATCCTGGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGCTCGCATCCTTGTGGCCATCATGAAGGTCCCCTCTGCAGGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGCTCGCATCCTTGTGGCCATCATGAAGGTCCCCTCTGCAGGCGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAGAAAGCCTTCTCCACCTGCAGCTCCCACCTGTCTGTGGTTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAGAAAGCCTTCTCCACCTGCAGCTCCCACCTGTCTGTGGTTGCTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACCACCATTGGCGTCTATCTGTGTCCCTCCTCGGTCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACCACCATTGGCGTCTATCTGTGTCCCTCCTCGGTCCTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACTGTGAAGGAGAAAGCTTCTGCGGTGATGTACACAGCAGTCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACTGTGAAGGAGAAAGCTTCTGCGGTGATGTACACAGCAGTCACCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAATCCCTTCATCTACAGCTTGAGGAACAGAGACCTGAAAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAATCCCTTCATCTACAGCTTGAGGAACAGAGACCTGAAAGGGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTCAGGAAGCTGGTCAACAGAAAGATCACCTCATCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTCAGGAAGCTGGTCAACAGAAAGATCACCTCATCTTCC