seq1 = pF1KE0890.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KE0890/gi568815589f_122419141.tfa (gi568815589f:122419141_122620079), 200939 bp

>pF1KE0890 939
>gi568815589f:122419141_122620079 (Chr9)

1-939  (100001-100939)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAGGGAGAATCAGAGCAGTGTGTCTGAGTTCCTCCTCCTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAGGGAGAATCAGAGCAGTGTGTCTGAGTTCCTCCTCCTGGACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCATCTGGCCAGAGCAGCAGGCTGTGTTCTTCACCCTGTTCTTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCATCTGGCCAGAGCAGCAGGCTGTGTTCTTCACCCTGTTCTTGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGATCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGCTCATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGATCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGCTCATCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTTCTTCTTCCTCAGCCACTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGACTCTCACCTTCACACCCCCATGTTCTTCTTCCTCAGCCACTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCACTGACATCTCCCTTTCATCTGTCACTGTCCCAAAGATGTTATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCACTGACATCTCCCTTTCATCTGTCACTGTCCCAAAGATGTTATTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATGCAAACTCAGGATCAATCCATTCTTTATGCAGGGTGTGTAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATGCAAACTCAGGATCAATCCATTCTTTATGCAGGGTGTGTAACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTATTTTTTCATATTTTTCACTGATCTAGACAATTTCCTTCTCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTATTTTTTCATATTTTTCACTGATCTAGACAATTTCCTTCTCACTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCATACGATCGGTATGTGGCCATCTGTCACCCCCTCCGCTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCATACGATCGGTATGTGGCCATCTGTCACCCCCTCCGCTACACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTATCATGAAAGAGGGACTGTGTAACTTACTAGTCACTGTGTCCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTATCATGAAAGAGGGACTGTGTAACTTACTAGTCACTGTGTCCTGGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTCCTGTACCAATGCCCTGTCTCACACTCTCCTCCTGGCCCAGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTCCTGTACCAATGCCCTGTCTCACACTCTCCTCCTGGCCCAGCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTTTGTGCTGACAACACCATCCCCCATTTCTTCTGTGATCTTGTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTTTGTGCTGACAACACCATCCCCCATTTCTTCTGTGATCTTGTTGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TACTCAAGCTCTCATGCTCAGACATCTCCCTCAATGAGCTGGTCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TACTCAAGCTCTCATGCTCAGACATCTCCCTCAATGAGCTGGTCATTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGTGGGACAGGCAGTCATTACTCTACCACTAATATGCATCTTGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACAGTGGGACAGGCAGTCATTACTCTACCACTAATATGCATCTTGATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATGGCCACATTGGGGTCACCATCCTCAAGGCTCCATCTACTAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATGGCCACATTGGGGTCACCATCCTCAAGGCTCCATCTACTAAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTTCAAAGCTTTGTCCACCTGTGGCTCTCACCTCTCTGTGGTGTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTTCAAAGCTTTGTCCACCTGTGGCTCTCACCTCTCTGTGGTGTCTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATTATGGCACAATTATTGGACTGTATTTTCTCCCCTCATCCAGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATTATGGCACAATTATTGGACTGTATTTTCTCCCCTCATCCAGTGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAGTGACAAGGACGTAATTGCCTCTGTGATGTACACGGTGATCACCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAGTGACAAGGACGTAATTGCCTCTGTGATGTACACGGTGATCACCCCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAATCCCTTCATTTATAGCCTAAGGAACAGGGACATAAAGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAATCCCTTCATTTATAGCCTAAGGAACAGGGACATAAAGGGAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 CTGGAGAGACTCTTCAACAGGGCAACAGTCTTATCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGGAGAGACTCTTCAACAGGGCAACAGTCTTATCTCAA