seq1 = pF1KE0872.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KE0872/gi568815584f_20123710.tfa (gi568815584f:20123710_20324699), 200990 bp

>pF1KE0872 990
>gi568815584f:20123710_20324699 (Chr14)

1-990  (100001-100990)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTTTATTATTCATTCTTTGGTTACTTCTGTTTTTCTAACAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTTTATTATTCATTCTTTGGTTACTTCTGTTTTTCTAACAGCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGACCCCAGAACAGAACAATGCATTTTGTGACTGAGTTTGTCCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGACCCCAGAACAGAACAATGCATTTTGTGACTGAGTTTGTCCTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTTTCCATGGTCAAAGGGAGATGCAGAGCTGCTTCTTCTCATTCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTTTCCATGGTCAAAGGGAGATGCAGAGCTGCTTCTTCTCATTCATCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTCTCTATCTCCTGACACTGCTAGGGAATGGAGCTATTGTCTGTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTCTCTATCTCCTGACACTGCTAGGGAATGGAGCTATTGTCTGTGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAATTGGACAGGCGGCTCCACACACCCATGTACATCCTTCTGGGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAATTGGACAGGCGGCTCCACACACCCATGTACATCCTTCTGGGAAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGCCTTTCTAGAGATCTGGTACATTTCCTCCACTGTCCCAAACATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGCCTTTCTAGAGATCTGGTACATTTCCTCCACTGTCCCAAACATGCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCAATATCCTCTCTGAGATTAAAACCATCTCCTTCTCTGGTTGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCAATATCCTCTCTGAGATTAAAACCATCTCCTTCTCTGGTTGCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAATTCTATTTCTTTTTTTCACTGGGTACAACAGAGTGTTTCTTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAATTCTATTTCTTTTTTTCACTGGGTACAACAGAGTGTTTCTTTTTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTTATGGCTTATGATCGGTACCTGGCCATCTGTCGTCCATTACACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTTATGGCTTATGATCGGTACCTGGCCATCTGTCGTCCATTACACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCTCCATCATGACTGGGAAGTTCTGTATAATTCTGGTCTGTGTATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCTCCATCATGACTGGGAAGTTCTGTATAATTCTGGTCTGTGTATGCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTAGGCGGATTTCTCTGCTATCCAGTCCCTATTGTTCTTATCTCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTAGGCGGATTTCTCTGCTATCCAGTCCCTATTGTTCTTATCTCCCAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCCCTTCTGTGGGCCCAACATCATTGACCACTTGGTGTGTGACCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCCCTTCTGTGGGCCCAACATCATTGACCACTTGGTGTGTGACCCAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCATTGTTTGCACTGGCCTGCATCTCTGCTCCTTCCACTGAGCTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCATTGTTTGCACTGGCCTGCATCTCTGCTCCTTCCACTGAGCTTATCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACACCTTCAACTCGATGATTATCTTTGGGCCCTTCCTCTCCATCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACACCTTCAACTCGATGATTATCTTTGGGCCCTTCCTCTCCATCTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GATCTTACACTCTGGTCATCAGAGCTGTGCTTTGTATTCCCTCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GATCTTACACTCTGGTCATCAGAGCTGTGCTTTGTATTCCCTCTGGTGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTCGAACTAAAGCTTTCTCCACATGTGGGTCCCACCTAATGGTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTCGAACTAAAGCTTTCTCCACATGTGGGTCCCACCTAATGGTGGTGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTATTCTATGGAACCCTTATGGTGATGTATGTGAGCCCAACATCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTATTCTATGGAACCCTTATGGTGATGTATGTGAGCCCAACATCAGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCAGCAGGAATGCAGAAGATCATCACTCTGGTATACACAGCAATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCAGCAGGAATGCAGAAGATCATCACTCTGGTATACACAGCAATGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCATTCTTAAATCCCCTTATCTATAGTCTTCGAAACAAAGACATGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCATTCTTAAATCCCCTTATCTATAGTCTTCGAAACAAAGACATGAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCTCTAAAGAGAGTCCTGGGGTTAACAGTTAGCCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCTCTAAAGAGAGTCCTGGGGTTAACAGTTAGCCAAAAC