seq1 = pF1KE0859.tfa, 987 bp
seq2 = pF1KE0859/gi568815597r_159213673.tfa (gi568815597r:159213673_159414659), 200987 bp

>pF1KE0859 987
>gi568815597r:159213673_159414659 (Chr1)

(complement)

1-987  (100001-100987)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAAGCTAAATTCCACTTTTGTGACTGAGTTCCTCTTTGAAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAAAGCTAAATTCCACTTTTGTGACTGAGTTCCTCTTTGAAGGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCAGCTTCAGGCGGCAGCACAAACTTGTCTTCTTTGTTGTCTTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCAGCTTCAGGCGGCAGCACAAACTTGTCTTCTTTGTTGTCTTCCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTTGTACCTGCTGACTCTCTCTGGCAATGTGATTATCATGACCATTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTTGTACCTGCTGACTCTCTCTGGCAATGTGATTATCATGACCATTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCTGGACCATCATCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGTGCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCTGGACCATCATCTTCACACCCCCATGTACTTCTTCCTGTGCATGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCCATCTCTGAGACCTGCTACACTGTGGCCATCATTCCCCATATGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCCATCTCTGAGACCTGCTACACTGTGGCCATCATTCCCCATATGCTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGGTCTCTTGAATCCTCATCAGCCCATTGCCACCCAAAGCTGTGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGGTCTCTTGAATCCTCATCAGCCCATTGCCACCCAAAGCTGTGCCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCTCTTCTTCTATCTCACCTTTGGCATCAACAACTGCTTCCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGCTCTTCTTCTATCTCACCTTTGGCATCAACAACTGCTTCCTGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTCATGGGATATGACCGCTATGTGGCCATCTGCAACCCCCTAAGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTCATGGGATATGACCGCTATGTGGCCATCTGCAACCCCCTAAGGTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGTCATCATGGGTAAGAGGGCCTGTATCCAACTGGCCTCTGGATCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGTCATCATGGGTAAGAGGGCCTGTATCCAACTGGCCTCTGGATCACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGATTGGCCTTGGCATGGCCATTGTCCAAGTAACATCTGTGTTTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGATTGGCCTTGGCATGGCCATTGTCCAAGTAACATCTGTGTTTGGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCATTCTGTGATGCCTTTGTCATCTCCCACTTCTTCTGTGATGTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCATTCTGTGATGCCTTTGTCATCTCCCACTTCTTCTGTGATGTGAGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTGCTGAAGCTGGCCTGCACAGACACCACTGTCAATGAGATAATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTGCTGAAGCTGGCCTGCACAGACACCACTGTCAATGAGATAATCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGTTGTCAGCGTCTGTGTCCTTGTTCTACCTATGGGCCTGGTCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGTTGTCAGCGTCTGTGTCCTTGTTCTACCTATGGGCCTGGTCTTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTATGTCCTCATCATCTCCACCATTCTTAAGATTGCCTCAGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTATGTCCTCATCATCTCCACCATTCTTAAGATTGCCTCAGCTGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCAGAAGAAGGCCTTTGCCACCTGCGCCTCCCACCTCACAGTGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCAGAAGAAGGCCTTTGCCACCTGCGCCTCCCACCTCACAGTGGTCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCCACTATGGCTGTGCCTCCATCATCTACCTGAAGCCTAAGTCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCCACTATGGCTGTGCCTCCATCATCTACCTGAAGCCTAAGTCCCAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCCCTGGGACAGGACAGACTCATCTCAGTGACCTACACTCATCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCCCTGGGACAGGACAGACTCATCTCAGTGACCTACACTCATCACTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTACTGAACCCTGTTGTGTACAGCCTGAAGAACAAGGAGGTCAAAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTACTGAACCCTGTTGTGTACAGCCTGAAGAACAAGGAGGTCAAAGATGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCTGCACAGAGCCGTGGGGCAAAAAACTCTGTCTCCTTAATGAAGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCTGCACAGAGCCGTGGGGCAAAAAACTCTGTCTCCTTAATGAAGAGAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .
    951 TTGTGAAGGCTTTTCCTTTGCGTTTATAAATATGTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTGTGAAGGCTTTTCCTTTGCGTTTATAAATATGTAC