seq1 = pF1KE0855.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE0855/gi568815587r_123938069.tfa (gi568815587r:123938069_124139001), 200933 bp

>pF1KE0855 933
>gi568815587r:123938069_124139001 (Chr11)

(complement)

1-933  (100001-100933)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAACGCCACCCTACTGACAGCGTTCATCCTCACGGGCCTTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAACGCCACCCTACTGACAGCGTTCATCCTCACGGGCCTTCCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCCCCAGGGCTGGACGCCCCACTCTTTGGAGTCTTCCTGGTGGTTTACG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
 100051 TGCCCCAGGGCTGGACGCCCCCCTCTTTGGAATCTTCCTGGTGGTTTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTCACTGTGCTGGGGAACCTCCTCATCCTGCTGGTGATCAGGGTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCACCTCCACACCCCCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTCACCTCCACACCCCCATGTACTACTTCCTCACCAACCTGTCCTTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACATGTGGTTCTCCACTGTCACGGTGCCCAAAATGCTGATGACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGACATGTGGTTCTCCACTGTCACGGTGCCCAAAATGCTGATGACCTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTCCCCAAGCGGCAGGACTATCTCCTTCCACAGCTGCGTGGCTCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTCCCCAAGCGGCAGGACTATCTCCTTCCACAGCTGCGTGGCTCAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TATTTTTTCCACTTCCTGGGGAGCACCGAGTGTTTCCTCTACACAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TATTTTTTCCACTTCCTGGGGAGCACCGAGTGTTTCCTCTACACAGTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCTATGATCGCTACCTGGCCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCCTATGATCGCTACCTGGCCATCAGTTACCCGCTCAGGTACACCAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATGACTGGGCGCTCGTGTGCCCTCCTGGCCACCGGCACTTGGCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATGACTGGGCGCTCGTGTGCCCTCCTGGCCACCGGCACTTGGCTCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGACCATATTGACTTTCCATTTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTCTCTGCACTCTGCTGTCCAGACCATATTGACTTTCCATTTGCCCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGGACCCAACCAGATCCAGCACTACTTCTGTGACGCACCGCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTGGACCCAACCAGATCCAGCACTACTTCTGTGACGCACCGCCCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCAACGAGATGGTCATCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAACTGGCCTGTGCAGACACCTCAGCCAACGAGATGGTCATCTTTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AATATTGGGCTAGTGGCCTCGGGCTGCTTTGTCCTGATAGTGCTGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AATATTGGGCTAGTGGCCTCGGGCTGCTTTGTCCTGATAGTGCTGTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGTCCATCGTCTGTTCCATCCTGCGGATCCGCACCTCAGAGGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGTCCATCGTCTGTTCCATCCTGCGGATCCGCACCTCAGAGGGGAGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGTATCGTGGTCCTTTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACAGAGCCTTTCAGACCTGTGCCTCCCACTGTATCGTGGTCCTTTGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGCCCTGGTCTTTTCATTTACCTGAGGCCAGGCTCCAGGGACGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCCCTGGTCTTTTCATTTACCTGAGGCCAGGCTCCAGGGACGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCATGGGGTTGTGGCCGTTTTCTACACCACGCTGACTCCTCTTTTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCATGGGGTTGTGGCCGTTTTCTACACCACGCTGACTCCTCTTTTCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTTGTGTACACCCTGAGAAACAAGGAGGTAAAGAAAGCTCTGTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTTGTGTACACCCTGAGAAACAAGGAGGTAAAGAAAGCTCTGTTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTGAAAAATGGGTCAGTATTTGCTCAGGGTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGAAAAATGGGTCAGTATTTGCTCAGGGTGAA