seq1 = pF1KE0829.tfa, 828 bp
seq2 = pF1KE0829/gi568815587r_59291482.tfa (gi568815587r:59291482_59492309), 200828 bp

>pF1KE0829 828
>gi568815587r:59291482_59492309 (Chr11)

(complement)

1-828  (100001-100828)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCAAGCAGATCCATGGAAGTGAGTGGGAACCACACCTCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCAAGCAGATCCATGGAAGTGAGTGGGAACCACACCTCTGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGTTTGTTCTCCTAGGACTCTCAGATGAAAAAGAGCTGCAGCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGTTTGTTCTCCTAGGACTCTCAGATGAAAAAGAGCTGCAGCTCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTTCCAGTCTTCCTGGTGATCTACCTTGTGACCCTGATTTGGAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTTCCAGTCTTCCTGGTGATCTACCTTGTGACCCTGATTTGGAACATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTCTTATCATCCTCATCAGAATAGACTCTCACCTGAACACACCCATGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100151 GGTCTTATCATCCTCATCAGAATAGACTCTCATCTGAACACACCCATGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTTTTCTCAGTTTCCTCTCATTTACAGACATCTGCTATTCTTCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTTTTCTCAGTTTCCTCTCATTTACAGACATCTGCTATTCTTCTACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAGCCCAAGGATGCTTTCAGACTTCTTAAAAGATAAGAAGACAATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAGCCCAAGGATGCTTTCAGACTTCTTAAAAGATAAGAAGACAATTTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCTTGCCTGTGCCACTCAGTATTTTCTTGGGGCCTGGATGAGTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCTTGCCTGTGCCACTCAGTATTTTCTTGGGGCCTGGATGAGTCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGTGCTGCCTCTTGGTCATCATGGCCTGTGACAGATATGTGGCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGTGCTGCCTCTTGGTCATCATGGCCTGTGACAGATATGTGGCCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAGCCCCCTGCAGTACTCAGCAATCATGGTCCCTAGTATCTGTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAGCCCCCTGCAGTACTCAGCAATCATGGTCCCTAGTATCTGTTGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGTAGCTGGAGTCTGTGGGGGTGGATTCCTTAGTAGCTTAGTTCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGTAGCTGGAGTCTGTGGGGGTGGATTCCTTAGTAGCTTAGTTCATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTCCCTTGCTTTAATCTCTACTACTGTGGGCCAAATATCATTCAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTCCCTTGCTTTAATCTCTACTACTGTGGGCCAAATATCATTCAACATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTTCTGTAACACACTTCAGATTATTTCCTTGTCTTGCTCCAACCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTTCTGTAACACACTTCAGATTATTTCCTTGTCTTGCTCCAACCCCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGCCAAATGATTCTTTTTCTGGAAGCTATTTTTGTTGGGTTGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGCCAAATGATTCTTTTTCTGGAAGCTATTTTTGTTGGGTTGGGCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTTGCTTGTTATCCTTTTGTCTTATGGTTTCATTGTAGCTTCCATACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTTGCTTGTTATCCTTTTGTCTTATGGTTTCATTGTAGCTTCCATACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAATATCATCAACCAAATGTTGTGCCAAGGCCTTCAATACCTGTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAATATCATCAACCAAATGTTGTGCCAAGGCCTTCAATACCTGTGCCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CACCTGGCAGCTGTGGCTCTCTTCTATGGCACAGCCCTTTCTGTGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CACCTGGCAGCTGTGGCTCTCTTCTATGGCACAGCCCTTTCTGTGTACAT

    800     .    :    .    :    .
    801 GCATCCTAGCTCTAGCCACTCCATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCATCCTAGCTCTAGCCACTCCATGAAG