seq1 = pF1KE0807.tfa, 1083 bp
seq2 = pF1KE0807/gi568815595r_158741002.tfa (gi568815595r:158741002_158942084), 201083 bp

>pF1KE0807 1083
>gi568815595r:158741002_158942084 (Chr3)

(complement)

1-1083  (100001-101083)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGTCCATTTTGCTTCCTTCCAGGGGAAGCAGAAGCGGGAGCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGTCCATTTTGCTTCCTTCCAGGGGAAGCAGAAGCGGGAGCCGTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGCTCTGCTCCTGGAGGGAGCCTCCCGGGACATGGAGAAGGTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGCTCTGCTCCTGGAGGGAGCCTCCCGGGACATGGAGAAGGTGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAATACATCACAGGAACAAGGTCTCTGCCAGTTCTCAGAGAAGTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAATACATCACAGGAACAAGGTCTCTGCCAGTTCTCAGAGAAGTACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAGTCTACCTCTCCCTGGCCTACAGTATCATCTTTATCCTAGGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAAGTCTACCTCTCCCTGGCCTACAGTATCATCTTTATCCTAGGGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTAAATGGCACTGTCTTGTGGCACTCCTGGGGCCAAACCAAGCGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTAAATGGCACTGTCTTGTGGCACTCCTGGGGCCAAACCAAGCGCTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTGTGCCACCACCTATCTGGTGAACCTGATGGTGGCCGACCTGCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTGTGCCACCACCTATCTGGTGAACCTGATGGTGGCCGACCTGCTTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCTATTGCCCTTCCTCATCATCACCTACTCACTAGATGACAGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCTATTGCCCTTCCTCATCATCACCTACTCACTAGATGACAGGTGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCGGGGAGCTGCTCTGCAAGCTGGTGCACTTCCTGTTCTATATCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCGGGGAGCTGCTCTGCAAGCTGGTGCACTTCCTGTTCTATATCAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTACGGCAGCATCCTGCTGCTGACCTGCATCTCTGTGCACCAGTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTACGGCAGCATCCTGCTGCTGACCTGCATCTCTGTGCACCAGTTCCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGTGTGTGCCACCCACTGTGTTCGCTGCCCTACCGGACCCGCAGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGTGTGTGCCACCCACTGTGTTCGCTGCCCTACCGGACCCGCAGGCATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGGCTGGGCACCAGCACCACCTGGGCCCTGGTGGTCCTCCAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGGCTGGGCACCAGCACCACCTGGGCCCTGGTGGTCCTCCAGCTGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCACACTGGCCTTCTCCCACATGGACTACATCAATGGCCAGATGATCTGG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCACACTGGCCTTCTCCCACACGGACTACATCAATGGCCAGATGATCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TATGACATGACCAGCCAAGAGAATTTTGATCGGCTTTTTGCCTACGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TATGACATGACCAGCCAAGAGAATTTTGATCGGCTTTTTGCCTACGGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGTTCTGACATTGTCTGGCTTTCTTTCCCTCCTTGGTCATTTTGGTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGTTCTGACATTGTCTGGCTTTCTTTCCCTCCTTGGTCATTTTGGTGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TATTCACTGATGGTCAGGAGCCTGATCAAGCCAGAGGAGAACCTCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TATTCACTGATGGTCAGGAGCCTGATCAAGCCAGAGGAGAACCTCATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GACAGGCAACACAGCCCGAGCCAGGTCCATCCGGACCATCCTACTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GACAGGCAACACAGCCCGAGCCAGGTCCATCCGGACCATCCTACTGGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTGGCCTCTTCACCCTCTGTTTTGTGCCCTTCCATATCACTCGCTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTGGCCTCTTCACCCTCTGTTTTGTGCCCTTCCATATCACTCGCTCCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TACCTCACCATCTGCTTTCTGCTTTCTCAGGACTGCCAGCTCTTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TACCTCACCATCTGCTTTCTGCTTTCTCAGGACTGCCAGCTCTTGATGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCCAGTGTGGCCTACAAGATATGGAGGCCTCTGGTGAGTGTGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCCAGTGTGGCCTACAAGATATGGAGGCCTCTGGTGAGTGTGAGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCTCAACCCAGTCCTGTACTTTCTTTCAAGGGGGGCAAAAATAGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCTCAACCCAGTCCTGTACTTTCTTTCAAGGGGGGCAAAAATAGAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGCTCCTCCAGAAACTGAGGCAGAACAAGTTGGGTGAGCATCCAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGCTCCTCCAGAAACTGAGGCAGAACAAGTTGGGTGAGCATCCAGCTGGG

   1050     .    :    .    :    .    :
   1051 AGGAAGAGATGCCCAGGGTTGAACAGATCTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 AGGAAGAGATGCCCAGGGTTGAACAGATCTGGG