seq1 = pF1KE0803.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0803/gi568815587r_3127864.tfa (gi568815587r:3127864_3328799), 200936 bp

>pF1KE0803 936
>gi568815587r:3127864_3328799 (Chr11)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGAGCCCAGAGAAGCTGGACAGCACGTGGGGGCCGCCAACGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGAGCCCAGAGAAGCTGGACAGCACGTGGGGGCCGCCAACGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGAGGATGTGGCCTTCAACCTCATCATCCTGTCCCTCACCGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGAGGATGTGGCCTTCAACCTCATCATCCTGTCCCTCACCGAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGCCTCGGTGGGCTGCTGGGGAATGGGGCAGTCCTCTGGCTGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGGCCTCGGTGGGCTGCTGGGGAATGGGGCAGTCCTCTGGCTGCTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAATGTCTACAGAAACCCCTTCGCCATCTACCTCCTGGACGTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAATGTCTACAGAAACCCCTTCGCCATCTACCTCCTGGACGTGGCCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCGGATCTCATCTTCCTTGGCTGCCACATGGTGGCCATCGTCCCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCGGATCTCATCTTCCTTGGCTGCCACATGGTGGCCATCGTCCCCGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTGCAAGGCCGGCTGGACTTCCCGGGCTTCGTGCAGACCAGCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTGCAAGGCCGGCTGGACTTCCCGGGCTTCGTGCAGACCAGCCTGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGCTGCGCTTCTTCTGCTACATCGTGGGCCTGAGTCTCCTGGCGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGCTGCGCTTCTTCTGCTACATCGTGGGCCTGAGTCTCCTGGCGGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCGTGGAGCAGTGCCTGGCCGCCCTCTTCCCAGCCTGGTACTCGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCGTGGAGCAGTGCCTGGCCGCCCTCTTCCCAGCCTGGTACTCGTGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCGCCCACGCCACCTGACCACCTGTGTGTGCGCCCTCACCTGGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCGCCCACGCCACCTGACCACCTGTGTGTGCGCCCTCACCTGGGCCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCCTGCTGCTGCACCTGCTGCTCAGCGGCGCCTGCACCCAGTTCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCCTGCTGCTGCACCTGCTGCTCAGCGGCGCCTGCACCCAGTTCTTCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGCCCAGCCGCCACTTGTGCCGGACGCTGTGGCTGGTGGCAGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGCCCAGCCGCCACTTGTGCCGGACGCTGTGGCTGGTGGCAGCGGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGGCTCTGCTGTGTTGCACCATGTGTGGGGCCAGCCTTATGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGGCTCTGCTGTGTTGCACCATGTGTGGGGCCAGCCTTATGCTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGCGGGTGGAGCGAGGCCCCCAGCGGCCCCCACCCCGGGGCTTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGCGGGTGGAGCGAGGCCCCCAGCGGCCCCCACCCCGGGGCTTCCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTCATCCTCCTCACCGTCCTCCTCTTCCTCTTCTGCGGCCTGCCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTCATCCTCCTCACCGTCCTCCTCTTCCTCTTCTGCGGCCTGCCCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCATCTACTGGCTGTCCCGGAACCTGCTCTGGTACATCCCCCACTACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCATCTACTGGCTGTCCCGGAACCTGCTCTGGTACATCCCCCACTACTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACCACTTCAGCTTCCTCATGGCCGCCGTGCACTGCGCGGCCAAGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACCACTTCAGCTTCCTCATGGCCGCCGTGCACTGCGCGGCCAAGCCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGTCTACTTCTGCCTGGGCAGTGCCCAGGGCCGCAGGCTGCCCCTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGTCTACTTCTGCCTGGGCAGTGCCCAGGGCCGCAGGCTGCCCCTCCGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTCCTCCAGCGAGCGCTGGGAGACGAGGCTGAGCTGGGGGCCGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTCCTCCAGCGAGCGCTGGGAGACGAGGCTGAGCTGGGGGCCGTCAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GAGACCTCCCGCCGGGGCCTGGTGGACATAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGACCTCCCGCCGGGGCCTGGTGGACATAGCAGCC