seq1 = pF1KE0787.tfa, 1059 bp
seq2 = pF1KE0787/gi568815584r_67287332.tfa (gi568815584r:67287332_67512059), 224728 bp

>pF1KE0787 1059
>gi568815584r:67287332_67512059 (Chr14)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-207  (114234-114398)   100% ->
208-389  (116477-116658)   100% ->
390-481  (118819-118910)   100% ->
482-669  (119211-119398)   100% ->
670-771  (119633-119734)   100% ->
772-855  (121314-121397)   100% ->
856-934  (123758-123836)   100% ->
935-1059  (124604-124728)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGACGGCGTGCTCAAGGAGGGCTTCCTGGTCAAGAGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGAGGACGGCGTGCTCAAGGAGGGCTTCCTGGTCAAGAGGGTG...TA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GGCCACATTGTCCACAACTGGAAGGCGCGATGGTTCATCCTTCGGCAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114233 GGGCCACATTGTCCACAACTGGAAGGCGCGATGGTTCATCCTTCGGCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACACGCTGGTGTACTACAAGCTTGAGGGGGGTCGGAGAGTGACCCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114283 ACACGCTGGTGTACTACAAGCTTGAGGGGGGTCGGAGAGTGACCCCTCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGGCCGGATCCTCCTGGATGGCTGCACCATCACCTGCCCCTGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114333 AAGGGCCGGATCCTCCTGGATGGCTGCACCATCACCTGCCCCTGCCTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTATGAAAACCGACCG         CTCCTCATTAAGCTGAAGACTCAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114383 GTATGAAAACCGACCGGTA...CAGCTCCTCATTAAGCTGAAGACTCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATCCACGGAGTACTTCCTGGAGGCCTGTTCTCGAGAGGAGCGGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116502 CATCCACGGAGTACTTCCTGGAGGCCTGTTCTCGAGAGGAGCGGGATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGGGCCTTTGAGATCACCGGGGCTATTCATGCAGGGCAGCCGGGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116552 TGGGCCTTTGAGATCACCGGGGCTATTCATGCAGGGCAGCCGGGGAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGCAGCTGCACAGCCTGAGAAACTCCTTCAAGCTGCCCCCGCACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116602 CCAGCAGCTGCACAGCCTGAGAAACTCCTTCAAGCTGCCCCCGCACATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCTGCA         TCGCATTGTGGACAAGATGCACGATAGCAACACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116652 GCCTGCAGTG...TAGTCGCATTGTGGACAAGATGCACGATAGCAACACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGAATCCGTTCAAGCCCCAACATGGAGCAGGGAAGCACCTATAAAAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118853 GGAATCCGTTCAAGCCCCAACATGGAGCAGGGAAGCACCTATAAAAAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCCTCG         GCTCCTCCCTGGTGGACTGGCTCATCTCCAACA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 118903 CTTCCTCGGTG...CAGGCTCCTCCCTGGTGGACTGGCTCATCTCCAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCTTCACGGCCAGCCGTCTGGAGGCGGTGACCCTGGCCTCCATGCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119244 GCTTCACGGCCAGCCGTCTGGAGGCGGTGACCCTGGCCTCCATGCTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGGAGAACTTCCTCAGGCCTGTGGGTGTCCGAAGCATGGGAGCCATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119294 GAGGAGAACTTCCTCAGGCCTGTGGGTGTCCGAAGCATGGGAGCCATTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTCTGGGGATCTGGCCGAGCAGTTCCTGGATGACTCCACAGCCCTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119344 CTCTGGGGATCTGGCCGAGCAGTTCCTGGATGACTCCACAGCCCTGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTTTT         GCTGAGAGCTACAAAAAGAAGATAAGCCCCAAGGAA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119394 CTTTTGTA...TAGGCTGAGAGCTACAAAAAGAAGATAAGCCCCAAGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAATTAGCCTGAGCACTGTGGAGTTAAGTGGCACGGTGGTGAAACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119669 GAAATTAGCCTGAGCACTGTGGAGTTAAGTGGCACGGTGGTGAAACAAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTACCTGGCCAAGCAG         GGACACAAGAGGAAAAACTGGAAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119719 CTACCTGGCCAAGCAGGTA...CAGGGACACAAGAGGAAAAACTGGAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCGTCGCTTTGTTCTAAGGAAGGATCCAGCTTTCCTGCATTACTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121339 TGCGTCGCTTTGTTCTAAGGAAGGATCCAGCTTTCCTGCATTACTATGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCTTCCAAA         GAAGAGAACAGGCCAGTGGGTGGGTTTTCTCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121389 CCTTCCAAAGTG...CAGGAAGAGAACAGGCCAGTGGGTGGGTTTTCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCGTGGTTCACTCGTGTCTGCTCTGGAAGATAATGGCGTTCCCACTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 123790 TCGTGGTTCACTCGTGTCTGCTCTGGAAGATAATGGCGTTCCCACTGGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    935       GGGTTAAAGGGAATGTCCAGGGAAACCTCTTCAAAGTGATTACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123840 ...TAGGGGTTAAAGGGAATGTCCAGGGAAACCTCTTCAAAGTGATTACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGGATGACACACACTATTACATTCAGGCCAGCAGCAAGGCTGAGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124648 AAGGATGACACACACTATTACATTCAGGCCAGCAGCAAGGCTGAGCGAGC

   1100     .    :    .    :    .    :
   1029 CGAGTGGATTGAAGCTATCAAAAAGCTAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 124698 CGAGTGGATTGAAGCTATCAAAAAGCTAACA