seq1 = pF1KE0778.tfa, 1542 bp
seq2 = pF1KE0778/gi568815587r_8292513.tfa (gi568815587r:8292513_8574905), 282393 bp

>pF1KE0778 1542
>gi568815587r:8292513_8574905 (Chr11)

(complement)

1-225  (100001-100225)   100% ->
226-339  (101630-101743)   100% ->
340-453  (110084-110197)   100% ->
454-558  (112997-113101)   100% ->
559-697  (117427-117565)   100% ->
698-786  (120074-120162)   100% ->
787-871  (122000-122084)   100% ->
872-947  (134153-134228)   100% ->
948-1060  (138767-138879)   100% ->
1061-1146  (139327-139412)   100% ->
1147-1344  (161214-161411)   100% ->
1345-1542  (182196-182393)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGATAGTGGCTTAGATAAAAAATCCACAAAATGCCCCGACTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGATAGTGGCTTAGATAAAAAATCCACAAAATGCCCCGACTGTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGCTTCTCAGAAAGATGTACTTTGTGTATGTTCCAGCAAAACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGCTTCTCAGAAAGATGTACTTTGTGTATGTTCCAGCAAAACAAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCCTCCAGTTTTGGTGGTGGAAATGTCACAGACATCAAGCATTGGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCCTCCAGTTTTGGTGGTGGAAATGTCACAGACATCAAGCATTGGTAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGAATCTTTAATTTCACTGGAGAGAAAAAAAGAAAAAAATATCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCAGAATCTTTAATTTCACTGGAGAGAAAAAAAGAAAAAAATATCAACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGATATAACCTCCAGGAAAGATTTG         CCCTCAAGAACCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100201 AGATATAACCTCCAGGAAAGATTTGGTA...CAGCCCTCAAGAACCTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGTAGAGAGAAAAGCATCTCAGCAACAATGGGGTCGGGGCAACTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101646 ATGTAGAGAGAAAAGCATCTCAGCAACAATGGGGTCGGGGCAACTTTACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAGGAAAAGTTCCTCACATAAGGATTGAGAATGGAGCTGCTATTGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101696 GAAGGAAAAGTTCCTCACATAAGGATTGAGAATGGAGCTGCTATTGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340        GAAATCTATACCTTTGGAAGAATATTGGGAAAAGGGAGCTTTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101746 A...CAGGAAATCTATACCTTTGGAAGAATATTGGGAAAAGGGAGCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAATAGTCATTGAAGCGACAGACAAGGAAACAGAAACGAAGTGGGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110127 GAATAGTCATTGAAGCGACAGACAAGGAAACAGAAACGAAGTGGGCAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAAAAGTGAACAAAGAAAAG         GCTGGAAGCTCTGCTGTGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110177 AAAAAAGTGAACAAAGAAAAGGTA...AAGGCTGGAAGCTCTGCTGTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTACTTGAACGAGAGGTGAACATTCTGAAAAGTGTAAAACATGAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113017 GTTACTTGAACGAGAGGTGAACATTCTGAAAAGTGTAAAACATGAACACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCATACATCTGGAACAAGTATTTGAAACGCCAAAG         AAAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 113067 TCATACATCTGGAACAAGTATTTGAAACGCCAAAGGTA...CAGAAAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCTTGTGATGGAGCTTTGTGAGGATGGAGAACTCAAAGAAATTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117433 TACCTTGTGATGGAGCTTTGTGAGGATGGAGAACTCAAAGAAATTCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAGGAAAGGGCATTTCTCAGAGAATGAGACAAGGTGGATCATTCAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117483 TAGGAAAGGGCATTTCTCAGAGAATGAGACAAGGTGGATCATTCAAAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCGCATCAGCTATAGCATATCTTCACAATAATG         ATATTGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117533 TCGCATCAGCTATAGCATATCTTCACAATAATGGTA...TAGATATTGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATAGAGATCTGAAACTGGAAAATATAATGGTTAAAAGCAGTCTTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120082 CATAGAGATCTGAAACTGGAAAATATAATGGTTAAAAGCAGTCTTATTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATAACAATGAAATAAACTTAAACATAAAG         GTGACTGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 120132 TGATAACAATGAAATAAACTTAAACATAAAGGTA...CAGGTGACTGATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGGCTTAGCGGTGAAGAAGCAAAGTAGGAGTGAAGCCATGCTGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122010 TTGGCTTAGCGGTGAAGAAGCAAAGTAGGAGTGAAGCCATGCTGCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ACATGTGGGACTCCTATCTATATGG         CCCCTGAAGTTATCAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 122060 ACATGTGGGACTCCTATCTATATGGGTA...CAGCCCCTGAAGTTATCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGCCCACGACTATAGCCAGCAGTGTGACATTTGGAGCATAGGCGTCGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134169 TGCCCACGACTATAGCCAGCAGTGTGACATTTGGAGCATAGGCGTCGTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGTACATGTT         ATTACGTGGAGAACCACCCTTTTTGGCAAGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 134219 TGTACATGTTGTA...CAGATTACGTGGAGAACCACCCTTTTTGGCAAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TCAGAAGAGAAGCTTTTTGAGTTAATAAGAAAAGGAGAACTACATTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138798 TCAGAAGAGAAGCTTTTTGAGTTAATAAGAAAAGGAGAACTACATTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 AAATGCAGTCTGGAATTCCATAAGTGACTGTG         CTAAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 138848 AAATGCAGTCTGGAATTCCATAAGTGACTGTGGTA...TAGCTAAAAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTTTGAAACAACTTATGAAAGTAGATCCTGCTCACAGAATCACAGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139336 TTTTGAAACAACTTATGAAAGTAGATCCTGCTCACAGAATCACAGCTAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAACTACTAGATAACCAGTGGTTAACA         GGCAATAAACTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 139386 GAACTACTAGATAACCAGTGGTTAACAGTA...TAGGGCAATAAACTTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTCGGTGAGACCAACCAATGTATTAGAGATGATGAAGGAATGGAAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161228 TTCGGTGAGACCAACCAATGTATTAGAGATGATGAAGGAATGGAAAAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACCCAGAAAGTGTTGAGGAAAACACAACAGAAGAGAAGAATAAGCCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161278 ACCCAGAAAGTGTTGAGGAAAACACAACAGAAGAGAAGAATAAGCCGTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ACTGAAGAAAAGTTGAAAAGTTACCAACCCTGGGGAAATGTCCCTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161328 ACTGAAGAAAAGTTGAAAAGTTACCAACCCTGGGGAAATGTCCCTGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAATTACACTTCAGATGAAGAGGAGGAAAAACAG         TCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 161378 CAATTACACTTCAGATGAAGAGGAGGAAAAACAGGTA...CAGTCTACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTTATGAAAAGCAATTTCCTGCAACCAGTAAGGACAACTTTGATATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182203 CTTATGAAAAGCAATTTCCTGCAACCAGTAAGGACAACTTTGATATGTGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AGTTCAAGTTTCACATCTAGCAAACTCCTTCCAGCTGAAATCAAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182253 AGTTCAAGTTTCACATCTAGCAAACTCCTTCCAGCTGAAATCAAGGGAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AATGGAGAAAACCCCTGTGACTCCAAGCCAAGGAACAGCAACCAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182303 AATGGAGAAAACCCCTGTGACTCCAAGCCAAGGAACAGCAACCAAGTACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CTGCTAAATCCGGCGCCCTGTCCAGAACCAAAAAGAAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182353 CTGCTAAATCCGGCGCCCTGTCCAGAACCAAAAAGAAACTC