seq1 = pF1KE0726.tfa, 1251 bp
seq2 = pF1KE0726/gi568815579f_48182369.tfa (gi568815579f:48182369_48386875), 204507 bp

>pF1KE0726 1251
>gi568815579f:48182369_48386875 (Chr19)

1-136  (99996-100129)   97% ->
137-1251  (103393-104507)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCAGGACTCGGTGACCTTCGCAGACGTGGCTGTGAACTTCACCAA
        || | --|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATTTT  AGGACTCGGTGACCTTCGCAGACGTGGCTGTGAACTTCACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGAGTGGACCCTGCTGGACCCAGCTCAGAGGAATCTCTACAGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100044 AGAGGAGTGGACCCTGCTGGACCCAGCTCAGAGGAATCTCTACAGAGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAG         ATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100094 TGATGCTGGAAAATTCTAGGAACTTGGCATTCATAGGTA...CAGATTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAACTCCATGTAAAACCAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103398 GCAACTCCATGTAAAACCAAAGACGCAACCCCTCAGCCGGATATTCTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGAGTGTGTCTCACGAGCATCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103448 TAAAAGAACATTTCCTGAAGCCAACAGAGTGTGTCTCACGAGCATCAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103498 CCCAGCACTCCACATTAAGAGAAGACTGGAGATGCCCCAAAACAGAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCACACAGGCAGGGGGTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103548 CCACACAGGCAGGGGGTGAATAATGTGAAGCCACCTGCAGTTGCCCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTGAAGATCATGAAATGAGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103598 GAAAGATGAATCTCCTGTTAGCATTTGTGAAGATCATGAAATGAGGAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103648 ACTCTAAACCTACCTGCAGGCTTGTGCCTTCACAGGGAGATTCCATAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAATGTATCCTAACACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103698 CAATGTATCCTAACACGTGACTCAAGTATTTTCAAGTATAATCCTGTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAACAACGAAGACGATGGAGTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103748 AAACGATAGTCAAAAAACACATGAAAACAACGAAGACGATGGAGTCTTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103798 GGTGGAACATTCAGTGGGTTCCGTGTGGGAGAAAAACAGAGCTGAAATCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGCACATGGACTGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103848 AGCACATGGACTGGCAGTCAGAACACTGTGCATCATATACGTGATGAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGATACGGGGGCCAACAGGCACCAGCGGAATCCATTTGGAAAAGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103898 TGATACGGGGGCCAACAGGCACCAGCGGAATCCATTTGGAAAAGCTTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103948 GTGAAGACGGATCCCTTAGGGCACACAACACTCATGGTCGAGAGAAAATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TATGATTTTACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103998 TATGATTTTACTCAGTGCGAGAACACCTCCAGAAATAACTCAATTCACGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CATGCAGATGCAGTTGTATACCGCAGAGACAAACAAGAAGGATTGTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104048 CATGCAGATGCAGTTGTATACCGCAGAGACAAACAAGAAGGATTGTCAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104098 CTGGGGCAACCTCTGCCAACGCTCCAAATTCCGGTTCACACAAGAGTCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TGCACTGGAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104148 TGCACTGGAGAGAAAACCCATAAATGCCCCGAATGTGGGAGAGCCTTTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TTATCAGTCATTCCTTATGAGACATATGAAAATTCACACTGGAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104198 TTATCAGTCATTCCTTATGAGACATATGAAAATTCACACTGGAGAGAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTACACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104248 CGTATGAATGTGGGAAATGTGGGAAAGCCTTTAGATATTCCTTACACCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AATAAACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104298 AATAAACATTTAAGAAAGCATGTTGTGCAGAAGAAGCCCTACGAATGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGAATGTGGGAAAGTCATTCGGGAGTCCTCAAAATATACACATATAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104348 AGAATGTGGGAAAGTCATTCGGGAGTCCTCAAAATATACACATATAAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAAAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104398 GCCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGACATGTGGAAAAGACTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GCAAAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104448 GCAAAGTCGTCAGGACTTAAAAAACATCTTAAGACTCACAAAGATGAGAA

   1250     .    :
   1242 GCCCTGTGAA
        ||||||||||
 104498 GCCCTGTGAA