seq1 = pF1KE0683.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KE0683/gi568815581r_28511556.tfa (gi568815581r:28511556_28714161), 202606 bp

>pF1KE0683 822
>gi568815581r:28511556_28714161 (Chr17)

(complement)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-324  (100474-100722)   100% ->
325-408  (100817-100900)   100% ->
409-477  (101016-101084)   100% ->
478-547  (101475-101544)   100% ->
548-652  (101796-101900)   100% ->
653-693  (102078-102118)   100% ->
694-721  (102367-102394)   100% ->
722-822  (102506-102606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGCAGTAAGCTGTCGGCAGGGGCAGCACACCCAGCAGGGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGCAGTAAGCTGTCGGCAGGGGCAGCACACCCAGCAGGGGGAACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCCGGGTGGCTGTCCCTCACAAG         CAGGGTGGCAACATCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 CACCCGGGTGGCTGTCCCTCACAAGGTA...CAGCAGGGTGGCAACATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGGTCCCTGGGCCCGAGGCTGGAAGAGCCTCTGGACAGGTTTGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100490 GGGGTCCCTGGGCCCGAGGCTGGAAGAGCCTCTGGACAGGTTTGGGAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCAGGTCAGATCTGGAAGAACTCTGGGAACTACGGGGGCACCACTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100540 ATCAGGTCAGATCTGGAAGAACTCTGGGAACTACGGGGGCACCACTATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCACCAGGAATCCCTAAAGCCAGCCCCAGTACTGGTAGAGAAGCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100590 GCACCAGGAATCCCTAAAGCCAGCCCCAGTACTGGTAGAGAAGCCTCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGTGGCCAGTGCCTCAGTTCATCAACCTCTTTCTACCAGAGTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100640 CAGAGTGGCCAGTGCCTCAGTTCATCAACCTCTTTCTACCAGAGTTTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTAGGCCCATTAGGGGGCAGCAGCAGCTGAAG         ATTTTAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100690 ATTAGGCCCATTAGGGGGCAGCAGCAGCTGAAGGTA...CAGATTTTAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGTGGCTAAAGGCTCCTTTGGAACTGTCCTCAAGGTGCTAGATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100825 CCTCGTGGCTAAAGGCTCCTTTGGAACTGTCCTCAAGGTGCTAGATTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCAGAAAGCTGTATTTGCAGTGAAG         GTGGTGCCCAAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100875 CCCAGAAAGCTGTATTTGCAGTGAAGGTA...TAGGTGGTGCCCAAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGTCCTACAGAGGGATACCGTGAGGCAGTGCAAAGAGGAGGTTAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101031 AAGGTCCTACAGAGGGATACCGTGAGGCAGTGCAAAGAGGAGGTTAGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAG         CGACAGATCAACCATCCCTTTGTACACAGCTTGGGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101081 CCAGGTA...TAGCGACAGATCAACCATCCCTTTGTACACAGCTTGGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACAGCTGGCAGGGAAAACGGCACCTTTTCATTA         TGTGTAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101512 ACAGCTGGCAGGGAAAACGGCACCTTTTCATTAGTG...CAGTGTGTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACTGCAGCACAGATCTGTACTCCCTTTGGTCGGCTGTTGGCTGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101804 TACTGCAGCACAGATCTGTACTCCCTTTGGTCGGCTGTTGGCTGCTTTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAGGCTTCCATCCGTCTCTTTGCTGCCGAGTTGGTGCTGGTACTGT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101854 TGAGGCTTCCATCCGTCTCTTTGCTGCCGAGTTGGTGCTGGTACTGTGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653       GTTATCTCCATGACTTGGGCATCATGCATCGAGATGTGAAG   
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101904 ...CAGGTTATCTCCATGACTTGGGCATCATGCATCGAGATGTGAAGGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694       ATGGAGAATATTCTTCTAGATGAACGAG         GCCATCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102122 ...CAGATGGAGAATATTCTTCTAGATGAACGAGGTA...TAGGCCATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 GAAACTGACAGACTTTGGTCTGTCCCGCCACGTGCCCCAGGGAGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102513 GAAACTGACAGACTTTGGTCTGTCCCGCCACGTGCCCCAGGGAGCTCAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCTACACTATCTGTGGCACTCTTCAGTACATGGGTGAGAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102563 CCTACACTATCTGTGGCACTCTTCAGTACATGGGTGAGAGAGGT