seq1 = pF1KE0674.tfa, 1188 bp
seq2 = pF1KE0674/gi568815579f_11877029.tfa (gi568815579f:11877029_12079106), 202078 bp

>pF1KE0674 1188
>gi568815579f:11877029_12079106 (Chr19)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-197  (100343-100403)   100% ->
198-1188  (101088-102078)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCAGGACCCTGTGGCCTGTGAGGATGTTGCTGTGAACTTCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTCAGGACCCTGTGGCCTGTGAGGATGTTGCTGTGAACTTCACCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCGCAGAGGAAACTCTACAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCGCAGAGGAAACTCTACAGGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAG         GGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 TGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAGGTA...TAGGGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 AAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCAG         GAGTCTCATAGAAGGGAATGTCAATGAAATTAAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 CTTCAGGTA...CAGGAGTCTCATAGAAGGGAATGTCAATGAAATTAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101123 AAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGCAAAATCATGTGATAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101173 AACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGCAAAATCATGTGATAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTATGTGGAGAAGTTGGCATAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101223 TGTATGTGGAGAAGTTGGCATAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAGGTGACATTGGGCACAAGGCATACGAGTATCAGGACTATGCACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101273 GAGGTGACATTGGGCACAAGGCATACGAGTATCAGGACTATGCACCAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCATATAAGTGTCAACAACCTAAGAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101323 CCATATAAGTGTCAACAACCTAAGAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TAGAACACAAGAAAGGAATCACACCGGAGAGAAACCCTATGCTTGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101373 TAGAACACAAGAAAGGAATCACACCGGAGAGAAACCCTATGCTTGTAAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAGGCATTCGAAGACGCATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101423 AATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAGGCATTCGAAGACGCATGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101473 ATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101523 CCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AACCGTATGAATGTAAACAATGTGTTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101573 AACCGTATGAATGTAAACAATGTGTTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CATCGAATACATGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101623 CATCGAATACATGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTTCCAGTTCTTTTCAAGCACATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101673 GCAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTTCCAGTTCTTTTCAAGCACATAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GAACCCACACTGGGGGAAAGCCATATGAATGTAAACAATGTGGCAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101723 GAACCCACACTGGGGGAAAGCCATATGAATGTAAACAATGTGGCAAATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTCAGTTGGTGTCATTCCTTTCAAATACATGAAAGAACTCACACTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101773 TTCAGTTGGTGTCATTCCTTTCAAATACATGAAAGAACTCACACTGGGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAAGCCCTGTGAATGTAGCAAATGTAATAAAGCATTCCGTAGTTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101823 GAAGCCCTGTGAATGTAGCAAATGTAATAAAGCATTCCGTAGTTACAGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCTATCTTAGACATAAAAGGAGTCACACGGGAGAGAAGCCTTATCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 CCTATCTTAGACATAAAAGGAGTCACACGGGAGAGAAGCCTTATCAATGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGGAATGTAGAAAAGCATTCACGTATCCCAGTTCCCTTCGTAGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101923 AAGGAATGTAGAAAAGCATTCACGTATCCCAGTTCCCTTCGTAGACATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AAGGACCCACTCTGCGAAAAAACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101973 AAGGACCCACTCTGCGAAAAAACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CATTATCTTATAAGTTTTCAAACACACCTAAGAATGCGCTCTGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102023 CATTATCTTATAAGTTTTCAAACACACCTAAGAATGCGCTCTGGAGAAAG

   1200     .
   1183 ACCTTA
        ||||||
 102073 ACCTTA