seq1 = pF1KE0620.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KE0620/gi568815579r_11354529.tfa (gi568815579r:11354529_11566827), 212299 bp

>pF1KE0620 1080
>gi568815579r:11354529_11566827 (Chr19)

(complement)

6-229  (99998-100220)   99% ->
230-333  (100553-100656)   99% ->
334-487  (108217-108370)   100% ->
488-713  (108542-108767)   100% ->
714-752  (109680-109718)   100% ->
753-1080  (111972-112299)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CACTCAGATACTGGGGGCCATGGAGTCTCAGGTGGGGGGGGGCCCGGCCG
        || -||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 CAG CAGATACTGGGGGCCATGGAGTCTCAGGTGGGGGGGGGCCCGGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     56 GCCCGGCCCTGCCCAACGGGCCACTCCTTGGTACAAATGGAGCCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 GCCCGGCCCTGCCCAACGGGCCACTCCTTGGTACAAATGGAGCCACTGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    106 GACAGCAAGACCAACCTCATCGTCAACTACCTGCCCCAGAACATGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100097 GACAGCAAGACCAACCTCATCGTCAACTACCTGCCCCAGAACATGACCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    156 GGATGAGTTCAAGAGTCTCTTCGGCAGCATTGGCGACATCGAGTCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100147 GGATGAGTTCAAGAGTCTCTTCGGCAGCATTGGCGACATCGAGTCCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    206 AGTTGGTTCGGGACAAGATCACAG         GGCAGAGCCTTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100197 AGTTGGTTCGGGACAAGATCACAGGTG...CAGGGCAGAGCCTTGGCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    247 GGGTTTGTGAACTATTCTGATCCCAATGATGCAGACAAAGCCATCAACAC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100570 GGGTTTGTGAACTATTCTGACCCCAATGATGCAGACAAAGCCATCAACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    297 CCTCAACGGCCTCAAATTACAGACGAAGACCATCAAG         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100620 CCTCAACGGCCTCAAATTACAGACGAAGACCATCAAGGTT...CAGGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338 CCTATGCCAGACCCAGTTCAGCATCCATCCGGGATGCTAACCTGTACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108221 CCTATGCCAGACCCAGTTCAGCATCCATCCGGGATGCTAACCTGTACGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388 AGCGGGCTCCCCAAGACCATGAGCCAGAAAGAGATGGAGCAGCTCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108271 AGCGGGCTCCCCAAGACCATGAGCCAGAAAGAGATGGAGCAGCTCTTCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438 CCAGTACGGCCGCATCATCACGTCCCGCATCCTGGTGGACCAGGTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108321 CCAGTACGGCCGCATCATCACGTCCCGCATCCTGGTGGACCAGGTCACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488          GTGTCTCTCGGGGTGTGGGATTCATCCGCTTTGACAAGAGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108371 GTC...CAGGTGTCTCTCGGGGTGTGGGATTCATCCGCTTTGACAAGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    529 ATTGAGGCCGAAGAGGCTATCAAAGGACTGAATGGGCAGAAGCCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108583 ATTGAGGCCGAAGAGGCTATCAAAGGACTGAATGGGCAGAAGCCGCTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 CGCAGCTGAGCCCATCACAGTCAAGTTCGCGAACAACCCAAGTCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108633 CGCAGCTGAGCCCATCACAGTCAAGTTCGCGAACAACCCAAGTCAGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CGGGGCAGGCGCTGCTCACCCACCTCTACCAGTCATCCGCCCGGCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108683 CGGGGCAGGCGCTGCTCACCCACCTCTACCAGTCATCCGCCCGGCGCTAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GCAGGCCCCCTACACCATCAGACCCAGCGTTTCCG         GCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108733 GCAGGCCCCCTACACCATCAGACCCAGCGTTTCCGGTG...CAGGCTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 CAATTTGCTCAACATGGCCTACGGCGTCAAGAG         GTTCTCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109686 CAATTTGCTCAACATGGCCTACGGCGTCAAGAGGTA...CAGGTTCTCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 CGATCGCCATCGATGGTATGAGCGGCCTGGCGGGCGTGGGCCTGTCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111980 CGATCGCCATCGATGGTATGAGCGGCCTGGCGGGCGTGGGCCTGTCGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 GGCGCGGCGGGCGCCGGCTGGTGCATCTTCGTGTACAACCTGTCACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112030 GGCGCGGCGGGCGCCGGCTGGTGCATCTTCGTGTACAACCTGTCACCGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GGCAGACGAGAGCGTGCTGTGGCAGCTGTTCGGGCCTTTTGGGGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112080 GGCAGACGAGAGCGTGCTGTGGCAGCTGTTCGGGCCTTTTGGGGCAGTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CCAACGTCAAGGTCATCCGTGATTTCACCACCAACAAGTGCAAGGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112130 CCAACGTCAAGGTCATCCGTGATTTCACCACCAACAAGTGCAAGGGTTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGCTTCGTGACCATGACCAACTATGACGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112180 GGCTTCGTGACCATGACCAACTATGACGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CCTGAACGGCTATCGCCTGGGCGAGCGCGTGCTGCAGGTCTCCTTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112230 CCTGAACGGCTATCGCCTGGGCGAGCGCGTGCTGCAGGTCTCCTTCAAGA

   1100     .    :    .    :
   1061 CCAGCAAACAGCACAAGGCG
        ||||||||||||||||||||
 112280 CCAGCAAACAGCACAAGGCG