seq1 = pF1KE0602.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KE0602/gi568815584r_50230077.tfa (gi568815584r:50230077_50495871), 265795 bp

>pF1KE0602 1074
>gi568815584r:50230077_50495871 (Chr14)

(complement)

1-171  (100001-100171)   100% ->
172-293  (136723-136844)   100% ->
294-366  (150814-150886)   100% ->
367-457  (153650-153740)   100% ->
458-658  (154640-154840)   100% ->
659-741  (156843-156925)   100% ->
742-798  (161251-161307)   100% ->
799-969  (163440-163610)   100% ->
970-1074  (165691-165795)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAGGGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAGGGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGAAATCCGAATGCTCAAG         CAACTCAAGCATCCCAACCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100151 CGGGAAATCCGAATGCTCAAGGTA...CAGCAACTCAAGCATCCCAACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAACGGAGGCTTCACCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136743 TGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAACGGAGGCTTCACCTGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136793 TTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GG         GGTACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136843 GGGTG...TAGGGTACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAAT         TGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 150853 ACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATGTA...TAGTGCATAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153657 ATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTTTGTGACTTTGGATTTGCTCGGCTTTTGA         CTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 153707 AAGCTTTGTGACTTTGGATTTGCTCGGCTTTTGAGTG...TAGCTGGACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154647 GAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCTGCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154697 AGCTGCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGTCAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154747 ATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGTCAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 154797 AAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    659    GGGATCTCATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156840 AAGGGGATCTCATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATATG         GAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 156890 TTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATATGGTG...CAGGAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161256 ACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AG         GGCTGTCTCCACATGGACCCTACTCAAAGGCTGACATGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161306 AGGTA...TAGGGCTGTCTCCACATGGACCCTACTCAAAGGCTGACATGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163479 GAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TTTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163529 TTTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAAAGCACCACTGCTTTACAGAAACATCCAAG         TTGCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 163579 GAAAGCACCACTGCTTTACAGAAACATCCAAGGTT...TAGTTGCAGTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTACCCCAGGTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165700 CTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1029 GTACTACTGTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165750 GTACTACTGTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT