seq1 = pF1KE0599.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE0599/gi568815580r_35368614.tfa (gi568815580r:35368614_35597874), 229261 bp

>pF1KE0599 576
>gi568815580r:35368614_35597874 (Chr18)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-267  (117312-117422)   100% ->
268-379  (118464-118575)   100% ->
380-447  (119526-119593)   100% ->
448-576  (129133-129261)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCAAATTCCAATTGTGGCCACCACTTCCACTCCCGGAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCAAATTCCAATTGTGGCCACCACTTCCACTCCCGGAATAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAACAGCAAGAAGAGGCCGGCCAGCCCTTCCCACAATGGCAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAACAGCAAGAAGAGGCCGGCCAGCCCTTCCCACAATGGCAGCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGGGGCTATGGCGCCAGTAAGAAGAAAAAAGCGTCCGCTTCCAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGGGGCTATGGCGCCAGTAAGAAGAAAAAAGCGTCCGCTTCCAGCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGCAG         GGTATCAGCATGGAAGCCATGAGTGAGAATAAAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGCAGGTA...AAGGGTATCAGCATGGAAGCCATGAGTGAGAATAAAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTGCCCTCTGAGTTTAGCACAGGACCTGTGGAAAAAGCTGCCAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117347 GGTGCCCTCTGAGTTTAGCACAGGACCTGTGGAAAAAGCTGCCAAACCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCCATTTAAGGATCCCAACTTTGTG         CACTCTGGCCACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 117397 TGCCATTTAAGGATCCCAACTTTGTGGTA...AAGCACTCTGGCCACGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCGCAGTAGCTGGCAAGAAGAACAGAACCTGGAAGAACCTGAAACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118479 GGCGCAGTAGCTGGCAAGAAGAACAGAACCTGGAAGAACCTGAAACAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCGCTTCTGAAAGGGCATTGCCGTGGCAACTGAACGATCCTAACT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 118529 CCTCGCTTCTGAAAGGGCATTGCCGTGGCAACTGAACGATCCTAACTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    380       ACTTCAGTATTGATGCTCCTCCATCCTTTAAGCCAGCTAAGAAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118579 ...CAGACTTCAGTATTGATGCTCCTCCATCCTTTAAGCCAGCTAAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATTCTGATGTTTCAGGTCTGCTT         GCCAACTACACAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119570 TATTCTGATGTTTCAGGTCTGCTTGTG...CAGGCCAACTACACAGACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGAGCAAACTGCGGTTCAGCACCATTGAAGAGTTTTCCTACATTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129150 CCAGAGCAAACTGCGGTTCAGCACCATTGAAGAGTTTTCCTACATTCGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGCTGCCCTCTGACGTCGTCACCGGCTACCTGGCCCTGAGGAAGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129200 GGCTGCCCTCTGACGTCGTCACCGGCTACCTGGCCCTGAGGAAGGCCACG

    600     .    :
    565 AGCATCGTTCCC
        ||||||||||||
 129250 AGCATCGTTCCC