seq1 = pF1KE0591.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KE0591/gi568815581r_47444.tfa (gi568815581r:47444_281479), 234036 bp

>pF1KE0591 1236
>gi568815581r:47444_281479 (Chr17)

(complement)

1-373  (100001-100373)   100% ->
374-453  (108864-108943)   100% ->
454-528  (117276-117350)   100% ->
529-638  (119290-119399)   100% ->
639-765  (119939-120065)   99% ->
766-923  (125103-125260)   100% ->
924-1005  (132288-132369)   100% ->
1006-1102  (133211-133307)   100% ->
1103-1236  (133903-134036)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTCCGGCGGCGCGGGGAGAAGGCGACCATCAGCATCCAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTCCGGCGGCGCGGGGAGAAGGCGACCATCAGCATCCAGGAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGGCCATCGACGTGTGCCCCGGCCCCATCCGTCCCATCAAGCAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGGCCATCGACGTGTGCCCCGGCCCCATCCGTCCCATCAAGCAGATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGACTACTTCCCCCGCTTCCCGCGGGGCCTGCCCCCGGACGCCGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGACTACTTCCCCCGCTTCCCGCGGGGCCTGCCCCCGGACGCCGGGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAGCCGCTGCACCCCCGGACGCCCCCGCGCGCCCGGCTGTGGCCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGAGCCGCTGCACCCCCGGACGCCCCCGCGCGCCCGGCTGTGGCCGGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCCGCCGCAGCCCCTCCGACGGCGCCCGCGAGGACGACGAGGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCCGCCGCAGCCCCTCCGACGGCGCCCGCGAGGACGACGAGGATGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCAGCTCTTCGGAGCCTACGGCTCCAGCCCGGGCCCCAGCCCGGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCAGCTCTTCGGAGCCTACGGCTCCAGCCCGGGCCCCAGCCCGGGTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCCCGCGCGGCCGCCAGCCAAGCCGCCGGAGGACGAGCCGGACGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCCCGCGCGGCCGCCAGCCAAGCCGCCGGAGGACGAGCCGGACGCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCTACGAGTCGGACGACTGCA         CTGCCCTGGGCACGCTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100351 CGGCTACGAGTCGGACGACTGCAGTA...CAGCTGCCCTGGGCACGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTCAGCCTGCTGTATGACCAGGAGAACAACGCCCTCCACTGCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108882 ACTTCAGCCTGCTGTATGACCAGGAGAACAACGCCCTCCACTGCACCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCAAGGCCAAG         GGCCTGAAGCCAATGGACCACAATGGGCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 108932 ACCAAGGCCAAGGTA...CAGGGCCTGAAGCCAATGGACCACAATGGGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCAGACCCCTACGTCAAGCTGCACCTGCTGCCAGGAGCCAGTAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 117305 GGCAGACCCCTACGTCAAGCTGCACCTGCTGCCAGGAGCCAGTAAGGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    529      GCAAATAAGCTCAGAACAAAAACTCTCCGTAACACTCTGAACCCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117355 ..CAGGCAAATAAGCTCAGAACAAAAACTCTCCGTAACACTCTGAACCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACATGGAACGAGACCCTCACTTACTACGGGATCACAGATGAAGACATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119335 ACATGGAACGAGACCCTCACTTACTACGGGATCACAGATGAAGACATGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGCAAGACCCTGCG         GATCTCTGTGTGTGACGAGGACAAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 119385 CCGCAAGACCCTGCGGTG...TAGGATCTCTGTGTGTGACGAGGACAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCGGCACAATGAGTTCATCGGGGAGACACGTGTGCCCCTGAAGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119965 TCCGGCACAATGAGTTCATCGGGGAGACACGTGTGCCCCTGAAGAAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAACCCAACCACACCAAGACCTTCAACATCTGCCTGGAGAAGCAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 120015 AAACCCAACCACACCAAGACCTTCAGCATCTGCCTGGAGAAGCAGCTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 G         GTGGACAAGACTGAAGACAAGTCCCTGGAGGAGCGGGGCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120065 GGTG...CAGGTGGACAAGACTGAAGACAAGTCCCTGGAGGAGCGGGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCATCCTCATCTCCCTCAAGTACAGCTCACAGAAGCAAGGCCTGCTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125143 GCATCCTCATCTCCCTCAAGTACAGCTCACAGAAGCAAGGCCTGCTGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGCATCGTGCGGTGCGCCCACCTGGCCGCCATGGACGCCAACGGCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125193 GGCATCGTGCGGTGCGCCCACCTGGCCGCCATGGACGCCAACGGCTACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GGACCCCTACGTGAAAAC         ATACCTGAGGCCAGATGTGGACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 125243 GGACCCCTACGTGAAAACGTG...CAGATACCTGAGGCCAGATGTGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGAAATCCAAACATAAGACAGCGGTGAAGAAAAAAACCCTGAACCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132311 AGAAATCCAAACATAAGACAGCGGTGAAGAAAAAAACCCTGAACCCGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTAATGAG         GAGTTCTGTTACGAGATCAAGCATGGGGACCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 132361 TTTAATGAGGTA...CAGGAGTTCTGTTACGAGATCAAGCATGGGGACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGCCAAGAAGTCCCTGGAGGTCACCGTTTGGGATTACGACATTGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133243 GGCCAAGAAGTCCCTGGAGGTCACCGTTTGGGATTACGACATTGGAAAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCAACGATTTCATTG         GTGGTGTGGTTCTGGGCATCCACGCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 133293 CCAACGATTTCATTGGTA...CAGGTGGTGTGGTTCTGGGCATCCACGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGGGGGAGCGCCTGAAGCACTGGTTTGACTGCCTGAAGAACAAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133929 AAGGGGGAGCGCCTGAAGCACTGGTTTGACTGCCTGAAGAACAAGGACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCGCATCGAGCGCTGGCACACGCTCACCAGCGAGCTCCCAGGGGCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133979 GCGCATCGAGCGCTGGCACACGCTCACCAGCGAGCTCCCAGGGGCTGTGC

   1300     .
   1229 TCAGCGAC
        ||||||||
 134029 TCAGCGAC