seq1 = pF1KE0576.tfa, 813 bp
seq2 = pF1KE0576/gi568815576f_38884071.tfa (gi568815576f:38884071_39125672), 241602 bp

>pF1KE0576 813
>gi568815576f:38884071_39125672 (Chr22)

14-210  (138748-138944)   100% ->
211-813  (141000-141602)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     14 TCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138748 TCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     64 GAAAACGAACCCATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138798 GAAAACGAACCCATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    114 AGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTTGGGACACAGGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138848 AGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTTGGGACACAGGGGTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    164 TTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 138898 TTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    211       GTGTATTTCCGGTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138948 ...CAGGTGTATTTCCGGTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    255 TTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCCAGATCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141044 TTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCCAGATCACCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    305 GGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141094 GGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    355 TTCTTGGCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141144 TTCTTGGCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    405 CTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCTCAGGCTGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141194 CTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCTCAGGCTGCATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    455 AGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGGTGAGAGGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141244 AGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGGTGAGAGGTGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    505 GGTCAGGGGAGCATGACGGGGAGGAACAGCCTCAGAGATGGATGGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141294 GGTCAGGGGAGCATGACGGGGAGGAACAGCCTCAGAGATGGATGGATCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    555 CAATGCCATGGCTGGGGGTGTTCCAGGGCAGCCTGCAGGGGTGGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141344 CAATGCCATGGCTGGGGGTGTTCCAGGGCAGCCTGCAGGGGTGGGGCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605 CACTGATTGCAACTGACAGCCAGGAGACCAGGCCTGGGAGGGCAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141394 CACTGATTGCAACTGACAGCCAGGAGACCAGGCCTGGGAGGGCAGGCCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655 GGGTCAGGGGAGAGCCTGAGTGCTTCCCACCTCTTCATCTCAGACTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141444 GGGTCAGGGGAGAGCCTGAGTGCTTCCCACCTCTTCATCTCAGACTTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    705 ATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTCAGCCATTCATGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141494 ATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTCAGCCATTCATGCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    755 GGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141544 GGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAG

    800     .
    805 ATTCTCAGG
        |||||||||
 141594 ATTCTCAGG