seq1 = pF1KE0562.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KE0562/gi568815575f_70134696.tfa (gi568815575f:70134696_70340287), 205592 bp

>pF1KE0562 984
>gi568815575f:70134696_70340287 (ChrX)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-184  (101021-101128)   100% ->
185-255  (101374-101444)   100% ->
256-460  (102349-102553)   100% ->
461-632  (103517-103688)   100% ->
633-832  (105040-105239)   100% ->
833-984  (105441-105592)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCATTCCAAGCAGCCTAGTCACTTCCAGAGTCTGATGCTTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCATTCCAAGCAGCCTAGTCACTTCCAGAGTCTGATGCTTCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGCCTTTGAGCTACCTTGCCATCT         TTTGGATCTTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GTGGCCTTTGAGCTACCTTGCCATCTGTG...CAGTTTGGATCTTGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATTGTTCGTCTACCTGCTGTTTACATCCTTGTGGCCGCTACCAGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101036 CATTGTTCGTCTACCTGCTGTTTACATCCTTGTGGCCGCTACCAGTGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACTTTGCCTGGTTGTTCCTGGACTGGAAGACCCCAGAGCGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101086 TACTTTGCCTGGTTGTTCCTGGACTGGAAGACCCCAGAGCGAGGTA...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTGGCAGGCGTTCGGCCTGGGTAAGGAACTGGTGTGTCTGGACCCACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101372 AGGTGGCAGGCGTTCGGCCTGGGTAAGGAACTGGTGTGTCTGGACCCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAGGGACTATTTCCCCATTACG         ATCCTGAAGACAAAGGAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101422 TCAGGGACTATTTCCCCATTACGGTA...CAGATCCTGAAGACAAAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTATCACCTGAGCACAACTACCTCATGGGGGTTCACCCCCATGGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 CTATCACCTGAGCACAACTACCTCATGGGGGTTCACCCCCATGGCCTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACCTTTGGCGCCTTCTGCAACTTCTGCACTGAGGCCACAGGCTTCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102417 GACCTTTGGCGCCTTCTGCAACTTCTGCACTGAGGCCACAGGCTTCTCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGACCTTCCCAGGCATCACTCCTCACTTGGCCACGCTGTCCTGGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102467 AGACCTTCCCAGGCATCACTCCTCACTTGGCCACGCTGTCCTGGTTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGATCCCCTTTGTTAGGGAGTACCTCATGGCCAAAG         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102517 AAGATCCCCTTTGTTAGGGAGTACCTCATGGCCAAAGGTG...TAGGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTGCTCTGTGAGCCAGCCAGCCATCAACTATCTGCTGAGCCATGGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103521 GTGCTCTGTGAGCCAGCCAGCCATCAACTATCTGCTGAGCCATGGCACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCAACCTCGTGGGCATTGTAGTGGGAGGTGTGGGTGAGGCCCTGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103571 GCAACCTCGTGGGCATTGTAGTGGGAGGTGTGGGTGAGGCCCTGCAAAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGCCCAACACCACCACCCTCATCCTCCAGAAGCGCAAGGGGTTCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103621 GTGCCCAACACCACCACCCTCATCCTCCAGAAGCGCAAGGGGTTCGTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CACAGCCCTCCAGCATGG         GGCTCATCTGGTCCCCACCTTCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103671 CACAGCCCTCCAGCATGGGTA...CAGGGCTCATCTGGTCCCCACCTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTTTTGGGGAAACTGAGGTGTATGATCAGGTGCTGTTCCATAAGGATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105063 CTTTTGGGGAAACTGAGGTGTATGATCAGGTGCTGTTCCATAAGGATAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGGATGTACAAGTTCCAGAGCTGCTTCCGCCGTATCTTTGGTTTCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105113 AGGATGTACAAGTTCCAGAGCTGCTTCCGCCGTATCTTTGGTTTCTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTGTGTCTTCTATGGACAAAGCTTCTGTCAAGGCTCCACTGGGCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105163 TTGTGTCTTCTATGGACAAAGCTTCTGTCAAGGCTCCACTGGGCTCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CATACTCCAGGCCTATTGTCACTGTGG         TTGGGGAGCCTCTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105213 CATACTCCAGGCCTATTGTCACTGTGGGTG...CAGTTGGGGAGCCTCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCACTGCCCCAAATTGAAAAGCCAAGCCAGGAGATGGTGGACAAATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105455 CCACTGCCCCAAATTGAAAAGCCAAGCCAGGAGATGGTGGACAAATACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCACTTTATATGGATGCTCTGCACAAACTGTTCGACCAGCATAAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105505 TGCACTTTATATGGATGCTCTGCACAAACTGTTCGACCAGCATAAGACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    947 ACTATGGCTGCTCAGAGACCCAAAAGCTGTTTTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105555 ACTATGGCTGCTCAGAGACCCAAAAGCTGTTTTTCCTG