seq1 = pF1KE0549.tfa, 462 bp
seq2 = pF1KE0549/gi568815585f_30327991.tfa (gi568815585f:30327991_30528452), 200462 bp

>pF1KE0549 462
>gi568815585f:30327991_30528452 (Chr13)

1-462  (100001-100462)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCAGCAGGAGGCTGATGAAGGAGCTTGAAGAAATCCGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCAGCAGGAGGCTGATGAAGGAGCTTGAAGAAATCCGCAAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGATGAAAAACTTCCGTAACATCCAGGTTGATGAAGCTAATTTATTGA
        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAATGGAAAACTTCCGTAACATCCAGGTTGATGAAGCTAATTTATTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTGGCAAGGGCTTATTGTTCCTGACAACCCTCCATATGATAAGGGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||
 100101 CTTGGCAAGGGCTTATTGTTCCTGACAACCCTCCGTATAATAAGGGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAGAATCGAAATCAACTTTCCAGCAGAGTACCCATTCAAACCACCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100151 TTCAGAATCGAAATCAACTTTCCAGCAGAGTACCCATTCAAACCACCGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATCACATTTAAAACAAAGATCTATCACCCAAACATCGACGAAAAGGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100201 GATCACATTTAAAACAAAGATCTATCACCCGAACATCGACGAAAAGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTCTGTCTGCCAGTAATTAGTGCCGAAAACTGGAAGCCAGCAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGTCTGTCTGCCAGTAATTAGTGCTGAAAACTGGAAGCCAGCAACCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCGACCAAGTAATCCAGTCCCTCATAGCACTGGTGAATGACCCCCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100301 ACCGACCAAGTAATCCAGTCCCTCATAGCACTGGTGAATGACCCGCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGCACCCGCTTCGGGCTGACCTAGCTGAAGAATACTCTAAGGACCGTA
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100351 CGAGCACCCGCTTCGGGCTGACCTAGCTGAAGAATACTCTAACGACCGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAAATTCTGTAAGAATGCTGAAGAGTTTACAAAGAAATATGGGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAAATTCTGTAAGAATGCTGAAGAGTTTACAAAGAAATATGGGGAAAAG

    450     .    :
    451 CGACCTGTGGAC
        ||||||||||||
 100451 CGACCTGTGGAC